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  • 基于离散平稳小波分解和递归零空间LDA算法的SELDI蛋白质谱特征选择

    作者:祝磊;王尧佳;韩斌;厉力华;柯激情;孟旭莉

    目的 针对如何筛选与肿瘤相关的蛋白位点问题,提出一种基于平稳小波变换与递归零空间LDA算法相结合的特征选择方法.方法 首先对样本质谱数据进行平稳小波变换;接着基于递归框架调用零空间LDA算法,挑选出具判别意义的小波系数特征;然后经平稳小波逆变换,将挑选出的小波系数特征对应回原始蛋白质谱数据中,获得与肿瘤判别相关的蛋白位点.后,运用SVM分类器估算位点的分类性能.结果 在卵巢癌公共数据集OC-WCX2b和浙江省肿瘤医院乳腺癌数据集BC-WCX2a上分别挑选出与肿瘤判别相关的6个和2个蛋白位点.结论 本文提出的算法能够有效提取出具有较好判别效果的蛋白质谱位点,有助于癌症的辅助诊断.

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