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深圳市男男性行为人群人类免疫缺陷病毒1型流行株的聚集性分析
目的 研究深圳市男男性行为(MSM)人群人类免疫缺陷病毒1(HIV-1)亚型的聚集性,为艾滋病的预防治疗提供科学依据.方法 RT-PCR巢式扩增深圳市MSM人群HIV-1病毒的gag基因和env基因,结合HIV数据库和MEGA4.02软件分析测序结果,确定亚型;建立进化树,比较各亚型的组内基因离散率.结果 深圳市MSM人群中HIV-1流行株以CRF01-AE为主,占53.0%,与CRF07-BC、CRF08-BC、B、C共同存在,各个亚型均形成了簇集(cluster);B亚型cluster的基因离散率大(gag区:9.5%,env区:16.1%),CRF01-AE形成了3个独立的cluster.结论深圳市MSM人群中流行的HIV-1毒株是复杂的,并且不同亚型的毒株也有各自的变异,以CRF01-AE和B亚型为典型,病毒基因的变异对病毒的表型,疾病的进程及耐药性的影响尚待进一步研究.
关键词： 人类免疫缺陷病毒1型 男男性行为 基因变异 进化树模型 聚集性分析 -
深圳艾滋病病毒1型传播途径及优势流行株分析
目的 分析广东省深圳市艾滋病病毒1型( HIV-1)优势株的亚型特征和传播规律,为正确掌握HIV-1的流行趋势提供帮助.方法 对429例HIV-1阳性的感染者进行流行病学调查和外周血采集,逆转录-聚合酶链反应( RT-PCR)巢式扩增包膜蛋白(env),测序后确定亚型,建立进化树,计算基因离散率.结果 深圳市HIV-1亚型包括01 -AE 、07- BC 、08-BC 、02 -AG 4种重组亚型和B、C2种亚型；其中01 -AE、07-BC和B亚型为主要流行株,分别占51.8％ (207/400) 、28.8％ (115/400)和12.3％ (49/400)；08-BC 、C亚型和02-AG在人群中流行较少,分别占3.5％( 14/400)、3.5％ (14/400)和0.3％( 1/400)；传播途径以性传播和静脉吸毒传播为主,占感染总数的96.6％( 200/207),其他传播途径仅占3.4％(7/207);异性传播毒株的组内基因离散率大,为14.3％；同性传播病毒株与异性传播病毒株之间的基因离散率大,为15.8％；在进化树上,各种传播途径的毒株形成了相对独立的簇,但是存在交叉.结论 01 -AE是深圳地区HIV-1的优势流行株,性传播是主要的传播途径.
关键词： 艾滋病病毒1型( HIV-1) 巢式PCR 优势株 进化树模型 基因离散率
