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深圳市H5N6、H7N9流感病毒HA-UTR基因分子特征分析
目的 了解深圳市H5N6、H7 N9流感病毒HA基因非翻译区(Untranslated region,UTR)的分子特征.方法 使用MEGA7.0、DNAStar7.1.0等生物信息学分析软件对全球及深圳H5N6、H7N9流感病毒HA基因的UTR进行核苷酸序列同源性分析及基因多态性分析.结果 3株2014-2015年深圳市H5N6病毒与其他H5NX病毒株比较,HA-3'UTR核苷酸同源性为77.4％～100％,H5N6-HA-3'UTR未见明显突变位点;HA-5'UTR核苷酸同源性为91.7％ ～ 100％,H5N6-HA-5'UTR第24、31位发生突变.11株2013-2014年深圳市H7N9病毒与其他H7NX病毒株比较,HA-5'UTR核苷酸同源性为81.2％ ～100％,H7N9-HA-5'UTR在第2～6、9、10、12及15 ～ 17位发生多位点突变.结论 深圳市人感染H5N6及H7N9病毒HA的UTR保守区高度同源性及其可变区具有基因多态性.
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深圳市H5N6、H7N9流感病毒NA?UTR序列特征
目的 分析深圳市H5N6、H7N9流感病毒神经氨酸酶(NA)基因非翻译区(UTR)的分子特性,为进一步探究NA基因与流感病毒转录复制及包装之间的关系奠定理论基础.方法 使用MEGA 7.0、DNAstar7.1.0等生物信息分析软件对全球和深圳H5N6、H7N9流感病毒NA的UTR进行核苷酸序列同源性分析及基因多态性分析.结果 2014-2015年深圳市H5N6病毒与其他HXN6病毒株比较,NA?3′端核苷酸同源性为95.1％～100.0％,H5N6?NA 3′?UTR高度保守;5′端UTR核苷酸同源性为89.7％～100.0％,H5N6?NA 5′?UTR主要在第23、27、29及33位发生突变.8株2013-2014年深圳市H7N9病毒与其他HXN9流感病毒株比较,NA?5′端UTR核苷酸同源性为93.3％～100.0％,其在第4、6及23位发生突变.结论 深圳市人感染H5N6及H7N9病毒NA?UTR的保守区具有高度同源性,其可变区具有基因多态性.
