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Mce4A文献资料
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结核分枝杆菌Mce4A蛋白结构与功能的生物信息学分析
目的 采用生物学信息方法分析预测结核分枝杆菌Mce4A蛋白的结构和功能.方法 登录NCBI数据库, 获取Mce4A蛋白基因信息;运用ProParam工具和ProScale工具分析Mce4A蛋白预测基本理化性质和疏水性;利用SignaIP 4.1Server和TMHMM Server v.2.0工具预测Mce4A蛋白的信号肽和跨膜区;应用SOMPA工具分析Mce4A蛋白的二级结构, 并采用SWISS MODEL工具对该蛋白进行三级结构同源建模;运用ABCpred软件和SYFPEITHI预测Mce4A蛋白的B细胞抗原表位和T细胞抗原表位;运用STRING数据库预测Mce4A蛋白的相互作用蛋白.结果Mce4A蛋白基因全长1 203bp, 编码400个氨基酸.该蛋白理论分子质量单位 (Mr) 为42.418 33×103, 理论等电点为7.69, 分子式为C1900H3022N510O576S6, 半衰期为4.4h, 脂肪系数为93.70, 不稳定系数为27.89, 总平均亲水性为0.023, 为稳定性亲水蛋白.预测该蛋白在13-35位氨基酸之间形成一个典型的跨膜螺旋区, 无信号肽.二级结构中α螺旋、β折叠、β转角、无规则卷曲分别占37％、21％、6.5％和35.5％.预测该蛋白共有18个B细胞抗原表位和23个CTL表位.相互作用蛋白预测显示该蛋白可与5个蛋白协同发挥作用.结论 生物信息学分析Mce4A蛋白为稳定性亲水蛋白, 具有跨膜区, 是典型的跨膜蛋白, 在MTB入侵宿主巨噬细胞及存活起重要的作用.该蛋白含有潜在的B、T细胞抗原表位, 为药物作用靶位的选定和药物分子的设计提供了新的方向.
