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5株猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF7全长基因的克隆及序列分析
目的 通过测定5株猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ORF7基因序列,结合GenBank登录的国内外PRRSV分离株核苷酸序列,分析PRRSV核衣壳蛋白(N蛋白)的遗传变异情况. 方法 根据GenBank公布的PRRSV ATCC VR-2332株全基因组核苷酸序列,设计合成1对特异性引物,用RT-PCR方法扩增出3株PRRSV甘肃流行株(命名为GSZY、GSBY、GSZY株)、1株陕西流行株(命名为Shanxi株)和1株PRRSV江西分离株(命名为Jingxi株)的ORF7全长基因,克隆到Pgem-T Easy载体,然后分别测定插入的核苷酸序列.应用DNAStar序列分析软件对所测ORF7基因核苷酸序列及其推导的氨基酸序列与不同来源的13个PRRSV毒株进行同源性比较. 结果 5株PRRSV ORF7基因与以ATCC VR-2332为代表的早期引发PRRS的美洲型毒株的核苷酸序列间的同源性为91.9%～94.3%,与国内其他PRRSV分离株的同源性为98.7%～99.7%,与欧洲型代表株LV的同源性为57.7%～58.2%. 结论 美洲型PRRSV N蛋白氨基酸发生了变异,但国内毒株相对保守.
