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HefA基因文献资料
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幽门螺杆菌多重耐药株hefA基因表达的检测与分析
目的 了解hefA外排基因表达与贵阳市幽门螺杆菌(Hp)多重耐药的关系. 方法 提取耐3种抗生素的多重耐药菌株(10株)、敏感菌株(6株)及质控菌株SS1的基因组DNA,PCR扩增hefA基因片段,PCR产物经2％琼脂糖凝胶电泳检测后测序,将测序基因片段序列输入NCBI中进行BLAST比对;利用TRIzol试剂提取上述细菌的RNA并逆转录成cDNA,以16 sRNA为内参基因,通过实时荧光定量PCR(Real time PCR)检测hefA基因和内参基因的CT值,通过比较2-△△CT判断多重耐药菌株和敏感菌株hefA基因表达的差异,以两小样本t检验进行统计学分析. 结果 2％琼脂糖凝胶电泳显示,6株敏感菌和10株多耐药菌及SS1 hefA基因PCR产物均约140 bp,测序显示受试菌hefA基因序列与SS1菌株序列的一致性大于96％;RT-PCR检测hefA外排基因的表达,敏感菌株的2-△△CT为0.895±0.540,多重耐药菌株的2-△△CT为3.387±1.597,差异元统计学意义(t=9.399,P＜0.05). 结论 hefA外排基因高表达是贵阳地区Hp多重耐药的机制之一.
