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VFA:一种可视化代谢网络建模工具
数学建模是代谢工程研究的关键方法 之一.目前的代谢网络建模工具在构建代谢通量分析模型时,不能同时建立通量平衡分析(FBA)模型和<'13>C代谢通量分析(<'13>C-MFA)模型,而且大都采用私有格式描述代谢模型,不利于信息共享.为了解决上述问题,作者基于Cytoscape插件开发了一种可视化代谢通量建模工具VFA,它摆脱了繁琐、易出错的文本建模方式,提供友好的图形化用户界面、方便的可视化建模功能,并能够同时对代谢网络进行FBA和<'13>C-MFA建模.VFA的代谢模型描述格式扩展自系统生物学标记语言(SBML),且与后者完全兼容,有利于平台间的模型交换和共享.
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梅花香自苦寒来--访中国工程院院士刘昌孝教授
药物动力学是近40年来发展的新兴学科,是将数学与药理学、药物治疗学、药物制剂学、药物设计等分支学科结合和联系的交叉和边缘学科,研究药物在体内的吸收、分布、代谢和排泄规律,并将此规律用数学模型描述、用动力学参数表达其量变特征.正如药物在体内的代谢有其独特的轨迹,我国的药物动力学发展也有自己的轨迹.刘昌孝教授,无疑是一位沿着那轨迹一步步走过来的开拓者,他潜心研究药物动力学30余年,于2003年光荣当选为中国工程院院士.本刊记者专赴天津采访了刘教授.