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中国牛病毒性腹泻病毒JZ05-1分离株全基因测序及分析
牛病毒性腹泻病毒为瘟病毒属成员,呈世界性分布并在乳/肉牛业中造成严重经济损失.本研究利用MD-BK细胞增殖一株分离于我国吉林地区的牛源牛病毒性腹泻病毒JZ05-1毒株,观察发现其具有典型的致细胞病变效应.使用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)方法分别扩增覆盖基因组全长的八个片段并测序,拼接获得该病毒的全基因组序列长12 285核苷酸(nt),GenBank登录号;GQ888686.该病毒基因组具有编码多聚蛋白的一个11694 nt可读框,5'非翻译区(UTR)长387 nt,3'非翻译区长204 nt.分别分析BVDV JZ05-1的5'-UTR序列和全基因组序列,发现该病毒属于BVDV-2a亚型.BVDV-2型多数毒株之间的相似性约为96%,与JZ05-1全基因组序列相似性高的加拿大p11Q毒株和中国XJ-04毒株的相似性为90%和91%.因此,JZ05-1全基因组序列与BVDV-2型其他毒株的全基因组序列具有较大差异.