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金荞麦MYB转录因子基因FdMYBP1的克隆及分子特征分析
目的:对金荞麦MYB转录因子基因FdMYBP1进行克隆和序列特征分析.方法:采用RACE结合cDNA文库筛选的方法,从金荞麦cDNA文库中克隆MYBP1基因(FdMYBP1);生物信息学分析,Southern杂交.结果:克隆到1个MYBP1转录因子基因(FdMYBP1),通过Southern杂交分析,推测FdMYBP1基因是1～2个拷贝基因;FdMYBP1基因编码1个长256个氨基酸的蛋白质,在N端存在1个保守结构域,属于MYB转录因子家族.结论:首次从金荞麦中克隆到转录因子基因FdMYBP1,它具有MYB同源基因的典型特征,可能在金荞麦类黄酮代谢途径中起作用.
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红花MYB转录因子基因克隆及表达分析
红花是菊科一年生草本植物红花(Carthamus tinctorius L.)的干燥花,为活血化瘀常用中药.黄酮类成分是红花主要有效成分,MYB转录因子广泛参与调控黄酮类成分的合成,对红花MYB转录因子克隆及表达分析为解析红花黄酮类成分的调控机制、调控黄酮类成分的合成具有重要意义.本研究基于在线二代转录组数据,首先利用iTAK软件对MYB转录因子进行注释,设计引物对长片段MYB转录因子基因进行克隆,其次对克隆到的MYB转录因子基因进行序列分析,再次利用实时荧光定量PCR对克隆的MYB转录因子基因表达进行分析.注释筛选得到8个长片段MYB转录因子基因,成功克隆到6个MYB转录因子基因,分别命名为CtMYB-TF1、CtMYB-TF2、CtMYB-TF4、CtMYB-TF5、CtMYB-TF6及CtMYB-TF7.序列分析表明,克隆到的6个MYB转录因子基因都具有MYB转录因子核心结构域,其中CtMYB-TF7转录因子同已报道黄酮类成分合成调控因子AtMYBL2及AtMYB 12关系较近.表达分析表明,Ct MYB-TF5、CtMYB-TF6及CtMYB-TF7在根、茎及叶中表达量低,在花中表达量高.研究结果为进一步研究红花黄酮类成分的分子调控奠定基础.
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调控红花类黄酮合成MYB转录因子基因克隆及表达分析
目的 在红花Carthamus tinctorius中克隆调控类黄酮合成的MYB转录因子基因,通过序列及表达分析初步鉴定参与调控类黄酮合成的MYB转录因子基因.方法 对已报道调控类黄酮合成MYB转录因子进行序列比对,设计简并引物克隆核心序列,采用RACE技术克隆MYB转录因子基因全长,利用生物信息学方法分析基因序列,采用半定量PCR分析基因在红花不同组织及不同花期的表达情况.结果 克隆得到3个调控类黄酮合成候选MYB转录因子基因,命名为CtFRMYB1、CtFRMYB2及CtFRMYB3.序列全长分别为1 223、1 080、1 348 bp,蛋白质相对分子质量分别为17 878.15、28 766.45、27 987.89.序列分析表明3个转录因子都具DNA结合功能,属MYB转录因子家族.进化分析表明CtFRMYB1和CtFRMYB2同AtMYB12关系较近.表达分析表明CtFRMYB1和CtFRMYB2仅在花中表达且在花期3(开花第3天)表达量较高.结论 成功克隆3个调控类黄酮合成候选MYB转录因子基因CtFRMYB1、CtFRMYB2及CtFRMYB3,经生物信息学及表达分析初步鉴定到2个调控红花类黄酮合成MYB转录因子基因CtFRMYB1及CtFRMYB2,为红花类黄酮合成的调控机制研究奠定基础.
