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cDNA-SRAP文献资料
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应用cDNA-SRAP研究大黄不同功效组分型特异表达基因
目的:探讨生态环境和遗传背景相同条件下3种不同化学变异类型大黄在基因表达水平上的差异,揭示大黄种内变异的分子机制.方法:采用cDNA-SRAP生物信息学方法,对不同化学变异类型大黄地下组织特异表达的基因进行分析和功能预测.结果:共获得5条差异表达基因片段和4条表达量有明显差异的公共条带,其中4条功能已知,分别与植物生长发育及光信号转导、植物抗病性及水分运输相关,5条功能未知.结论:克隆了不同化学变异类型大黄特异表达的基因,为筛选优良变异类型、品种选育、功能基因组的研究提供参考.
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基于cDNA-SRAP技术筛选的ATP合成酶CF1-α亚单位基因(CTL-spn)与红花刺性状紧密连锁
红花的花是传统的活血化瘀中药,但因其花序周围苞叶有刺非常不利于人工采摘.本研究采用eDNA-SRAP技术分析了与红花苞叶刺性状紧密连锁的基因.在分别建立红花F2代cDNA无刺池和有刺池的基础上,利用60对引物筛选与苞叶刺连锁的基因片段,获得6条与红花刺性状连锁的基因片段,其中基因GPY-1和GPY-2重组率低,与苞叶刺紧密连锁并成功测序.采用RACE技术,克隆了GPY-2 cDNA全长,命名为CTL-spn,生物信息学分析显示:CTL-spn全长1679bp,具有1524 bp的开放阅读框,编码508个氨基酸.同源比对发现:CTL-spn表达蛋白与其他物种的ATP合成酶CF1-α亚基具有很高的同源性(97％).半定量RT-PCR分析结果显示:GPY-1和GPY-2仅在有刺F2代单株中表达.因此,红花ATP合成酶CF1-α亚基基因(CTL-spn)可能直接参与了红花刺性状的形成从而提高了有刺红花的抗逆性,这一发现为红花无刺品种的选育提供了重要思路.
