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支持向量机在构建白介素-1β转化酶抑制剂药效团模型中的应用
以24个作用于人体外围血单核细胞药理模型的白介素-1β转化酶抑制剂作为研究对象,计算了其表征分子的拓扑、电子、几何结构等物理化学性质的1209个分子描述符,用CfsSubsetEval评价方法和BestFirst-D1-N5搜索方法筛选描述符,用Kennard-Stone方法选择训练集和测试集.分别采用支持向量机、决策树、贝叶斯网络、人工神经网络等机器学习方法建立分类预测模型并使用Catalyst/HipHop系统建立药效团模型.结果表明支持向量机优于其他分类模型,正、负样本的预测正确率均达到100%.优药效团模型具有5个特征:2个疏水基团、2个脂性氢键受体、1个氢键给体;以此药效团进行中药数据库筛选得到384个候选白介素-1β转化酶抑制剂.利用支持向量机建立的分类预测模型对候选化合物的活性进行了预测,其中高活性化合物占96.6%,表明白介素-1β转化酶抑制剂药效团模型较准确地反映了高活性化合物的公共特征.该模型的建立有助于从中草药筛选新型白介素-1β转化酶抑制剂.
关键词： 白介素-1β转化酶抑制剂 分子描述符 支持向量机 药效团 HipHop -
Caspase-1抑制剂对大鼠局灶脑缺血再灌注后神经元损伤的影响
目的:研究YVAD-FMK(Caspase-1抑制剂)对大鼠局灶脑缺血再灌注后神经元损伤的影响.方法:采用大鼠局灶脑缺血再灌注模型,动态测量脑组织中IL-1β含量、脑含水量及血清NSE含量的变化以及YVAD-FMK对上述指标的影响.结果:YVAD-FMK能够减少脑组织IL-1β的含量,减轻脑水肿及能显著降低血清NSE升高的幅度.结论:YV4D-FMK对局灶脑缺血再灌注后神经元的损伤具有保护的作用.
关键词： 脑缺血/再灌注损伤 白介素-1β转化酶抑制剂 脑水肿 白介素-1β -
白介素-1β转化酶抑制剂的高通量筛选
目的 筛选具有白介素-1β转化酶(ICE)抑制活性的化合物.方法 通过体外克隆ICE原酶全长基因、质粒原核表达及蛋白纯化等方式,应用酶与特异性底物的荧光反应,建立ICE抑制剂高通量筛选平台:通过紫外、质谱及核磁等理化数据分析对所筛选的化合物进行结构鉴定,同时进行了初步的药理毒理学活性验证.结果 筛选得到1种具有较强ICE抑制活性的化合物LX1986,该化合物与已知化合物棕曲菌素D(Aspochalasin D)结构相同.结论 LX1986为活性较强的微生物来源ICE抑制剂,其抑制活性为首次报道.
关键词： 白介素-1β转化酶 白介素-1β转化酶抑制剂 高通量筛选 纯化
