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GNAT1基因文献资料
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鼻咽癌组织中GNAT1基因的表达、杂合性丢失及甲基化分析
背景与目的:在鼻咽癌中,染色体3p21.3为高频缺失区,杂合性丢失(loSS of heterozygosity,LOH)分析和功能学研究都表明3p21.3区存在与鼻咽癌相关的抑瘤基因.GNAT1基因也定位于3p21.3,但在鼻咽癌中未见关于GNAT1基因的研究报道.本研究旨在探讨GNAT1基因在鼻咽癌组织中的表达、LOH及甲基化情况.方法:应用逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)方法检测了33例鼻咽癌组织和15例慢性鼻咽炎组织中GNAT1基因的表达,并通过微卫星分析技术和甲基化特异性聚合酶链式反应(methylation-specific polymerase chain reaction,MSP)分析GNAT1基因LOH和启动子区甲基化情况.结果:GNAT1基因在慢性鼻咽炎组织中均稳定表达,而在72.7%(24/33)的鼻咽癌组织中表达下调或缺失,显著低于慢性鼻咽炎组织(100%,15/15)(P=0.022);LOH分析显示鼻咽癌组织中GNAT1基因的杂合性丢失率为15%(3/20),且LOH与基因表达存在相关性(P=0.016);甲基化分析发现在100%的鼻咽癌组织和80%慢性鼻咽炎组织中存在GNAT1基因启动子区高甲基化.结论:GNAT1基因在鼻咽癌组织中表达下调或缺失,这一现象与GNAT1基因的LOH存在相关性,而与3p21.3区基因启动子区CpG岛的甲基化可能无关.GNAT1基因的甲基化可能不是鼻咽癌的发病机制.
