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测序反应中PCR产物纯化方法的比较
目的 寻找佳的PCR产物纯化方法,建立稳定的重亚硫酸盐直接测序技术平台.方法 应用过柱、乙醇/醋酸钠及SAP-Exon I 3种纯化方法,对10例PCR产物进行纯化.结果 经配对资料t检验,乙醇/醋酸钠和过柱纯化与SAP-Exon I纯化法比较,纯化后PCR产物损失量均有极显著性差异(P<0.01),测序结果也有显著性差异(P<0.05).结论 应用SAP-Exon I纯化法,PCR产物损失量低,测序结果明显优于另外两种方法.
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OPRM1基因PCR产物和测序产物三种纯化方法的比较
目的 探讨一种快速、简便、效果好的OPRM1基因PCR产物和测序产物纯化方法,建立稳定的DNA测序技术平台.方法 采用乙醇/醋酸钠、过柱和SAP-Exonuclease Ⅰ结合BigDye Xterminator Purification Kit 3种纯化方法,对50份OPRM1基因PCR产物和测序产物进行纯化效果的比较.结果 SAP-Exonuclease Ⅰ法对PCR反应产物进行纯化的回收率显著高于乙醇/醋酸钠和过柱法,分别为0.86±0.01,0.48±0.08,0.65±0.01(t=32.5,P<0.001;t=86.1,P<0.001);BigDye Xterminator Purification Kit法对测序产物进行纯化成功率显著高于乙醇/醋酸钠和过柱法,分别为100%,62%和84%(x2=23.46,P<0.001;x2 =8.70,P=0.003).结论 SAP-Exonuclease Ⅰ结合BigDye Xterminator Purification Kit是一种快速、简便、效果好的测序纯化方法.