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生合成途径特异性转录因子及其激活真菌沉默次级代谢产物的研究进展
真菌次级代谢产物一直以来都是现代天然药物研究的重要资源,如何应用新技术和新方法高效快速地从真菌中发现更多活性独特的新颖次级代谢产物,一直是该领域研究的热点.近几年,真菌全基因组测序和生物信息学分析表明,真菌基因组中包含大量处于“沉默”(silent或cryptic)状态的次级代谢基因簇,这意味着真菌基因组中还有丰富的次级代谢产物生物合成潜能有待于激活和挖掘.生合成途径特异性转录因子(pathway-specific transcription factor)能够激活和调控真菌“沉默”次级代谢产物基因簇的转录表达,促进相应代谢产物的生物合成,从而提高新代谢产物的发现几率,已成为挖掘真菌沉默基因簇、激活菌株代谢潜能的有效手段.本文对目前生合成途径特异性转录因子及其激活真菌次级代谢产物的研究进展进行综述.
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LAL途径特异性转录因子研究进展
链霉菌可产生许多具有重要应用价值的次级代谢产物,如抗生素、免疫调节剂、抗肿瘤药物等,它们已经广泛应用于临床医药中.次级代谢产物的生物合成受到转录因子的调控,转录因子通过控制结构基因的转录激活或阻遏解除,决定了表达方式和程度.LuxR家族大ATP结合调控因子(large ATP-binding regulators of the LuxR family,LAL)是一类新的次级代谢途径转录因子,由900~1000个氨基酸残基组成,它的N-端具有Walker A和Walker B模体的ATP/GTP结构域,C-端具有保守的LuxR家族螺旋-转角-螺旋模体的DNA结合域.己在40余种次级代谢产物生物合成基因簇中发现LAL,本文对LAL途径特异性转录调控的研究进展进行综述.