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非经典前折叠素RPB5相互作用因子1文献资料
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URI1蛋白生物信息学分析及在人体组织中的表达
目的 分析人非经典前折叠素RPB5相互作用因子1(URI1)蛋白的特性、结构和变异体,观察URI1蛋白在人组织中的表达.方法 通过多种网络分析工具,预测和分析URI1的基本特性及结构.用人组织微阵列免疫组化染色方法检测其在多种组织/细胞中的表达.结果 URI1编码1个535个氨基酸的蛋白质,该蛋白质性质不稳定,无跨膜片段,N末端无信号肽,非分泌型蛋白质,其mRNA在组织中广泛表达.URI1具有11个潜在的泛素化位点,其中6个为高度可信,5个为中度可信.有48个潜在的磷酸化位点(35个在丝氨酸位、11个在苏氨酸位、2个在酪氨酸位).在第287氨基酸位有一糖基化位点,在第291、371氨基酸位也可能发生糖基化修饰,未发现乙酰化位点.蛋白质结构预测α螺旋(H)占39.63％,N端具有1个PFD功能域.URI1在多种组织/细胞广泛表达并存在明显差异表达,与基于高密度微阵列技术的BioGPS mRNA表达谱数据吻合.结论 用生物信息学技术预测了URI1蛋白的结构和功能,为URI1蛋白的相关研究提供了信息.
关键词： 非经典前折叠素RPB5相互作用因子1 变异体 生物信息学 表达
