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基于MALDI-TOF MS技术食管鳞癌诊断预测模型的建立及初步验证
目的 建立食管鳞癌诊断预测模型,寻找食管鳞癌潜在肿瘤标志物.方法 收集59例食管鳞癌患者及57例体检健康者血清标本,按照3:1随机分为训练组(患者44例,健康人对照42例)和验证组(患者15例,健康人对照15例).弱阳离子交换磁珠(WCX-MB)提纯血清蛋白质/肽后,经基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)检测,筛选出差异表达蛋白质/肽,构建诊断预测模型并初步验证.结果 经ClinProTools软件分析,共筛选出差异多肽峰31个(P<0.05),其中18个峰差异有统计学意义(P<0.01);与健康人对照组相比,8个峰在食管鳞癌组中表达上调;10个峰在食管鳞癌组中表达下调.其中差异峰m/z 2660.84和m/z 5336.49的ROC曲线下面积(AUCROC)分别为0.95和0.91,且均在食管鳞癌组中表达上调.应用遗传算法(GA)建立的食管鳞癌诊断预测模型经验证其准确性为93.10％,敏感性为92.90％,特异性为93.30％.结论 建立的食管鳞癌诊断预测模型能较好的用于食管鳞癌辅助诊断,多肽峰m/z 2660.84和m/z 5336.49有望成为食管鳞癌潜在肿瘤标志物.
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基于蛋白质谱技术建立胃癌诊断预测模型及其初步验证
目的 基于高通量蛋白质谱技术利用ClinProTools系统筛选胃癌患者与健康对照者的血清差异蛋白/多肽,建立胃癌诊断预测模型,发现胃癌的潜在血清标志物.方法 收集胃癌患者血清标本60例 、对照组血清标本60例,按照3:1随机分为训练组(胃癌患者45例,健康对照45例)和验证组(患者15例,健康对照15例).采用弱阳离子交换磁珠(WCX-MB)吸附低丰度蛋白/多肽,通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)分析建立相应的蛋白表达指纹图谱,筛选差异表达蛋白/多肽,建立胃癌的诊断预测模型并进行验证.结果 筛选出10个具有显著差异的多肽峰,差异显著的2个多肽峰质荷比(m/z)2952.57和m/z 5904.36的受试者工作曲线(ROC)曲线下面积(AUC)分别为0.93和0.81.运用遗传算法(GA)建立胃癌诊断预测模型,验证组验证此模型,结果显示此模型准确性为90.00％,灵敏度为93.30％,特异度为86.70％.结论 MALDI-TOF MS联合WCX-MB能够检测到胃癌患者与健康对照者的血清差异蛋白/多肽,以此建立的胃癌蛋白质谱诊断预测模型存在着潜在的应用价值,m/z 2952.57、5904.36有望成为诊断胃癌的潜在血清标志物.
