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青岛地区肾综合征出血热病毒基因分型
目的 调查青岛地区肾综合征出血热病毒的流行情况,研究病毒在该地区的分子流行病学特征及基因分型.方法 采集64例肾综合征出血热(HFRS)急性期患者血清标本,提取血清中病毒RNA作为模板.根据GenBank中汉坦病毒基因序列,设计HTN型和SEO型的通用外套引物,同时分别设计HTN型特异性引物和SEO型的特异性引物作为内套引物.采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增汉坦病毒基因组M片段G1区基因序列并测序.测序结果利用DNA Star软件进行核苷酸序列分析.结果 在64例标本中用HTN型特异性引物扩增阳性6例,占9%;用SEO型特异性引物扩增阳性25例,占39%;总阳性率为48%.总体来看,青岛地区流行的汉坦病毒以SEO型为主.SEO型汉坦病毒间核苷酸序列的差异相对较小,在核苷酸序列水平其基因的离散度为0.3%～8.9%.HTN型汉坦病毒的变异率较高,其基因的离散度为2.6%～11.2%.结论 青岛地区汉坦病毒的流行以SEO型为主,HTN型并存,其中HTN型主要发生在胶南市.
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青岛地区2000～2003年肾综合征出血热的病毒基因分型
①目的调查山东省青岛地区2000～2003年汉坦病毒的流行情况,研究病毒在该地区的分子流行病学特征.②方法采集肾综合征出血热(HFRS)急性期病人血清标本64份,提取血清中病毒RNA作为模板,根据GenBank中汉坦病毒基因序列,设计HTN型和SEO型的通用外套引物,同时分别设计HTN型特异性引物和SEO型的特异性引物作为内套引物,RT-nest-PCR扩增汉坦病毒基因组M片段G1区基因序列并测序.测序结果利用DNA Star软件进行核苷酸序列分析.③结果在64例标本中用HTN型特异性引物扩增阳性6例,占9%;用SEO型特异性引物扩增阳性25例,占39%;总阳性率为48%.总体来看青岛地区流行的汉坦毒株以SEO型为主.SEO型汉坦病毒间核苷酸序列的差异相对较小,在核苷酸序列水平其基因的离散度为0.3%～8.9%.HTN型汉坦病毒的变异率较高,其基因的离散度为2.6%～11.2%.④结论青岛地区汉坦病毒的流行以SEO型为主,HTN型并存,其中HTN型主要发生在胶南市.
