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双核酸频率特征向量文献资料
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基于双核酸频率分布特征的细菌亲缘关系定量分析
目的采用生物信息学方法定量分析细菌的亲缘关系.方法抽取全基因组核酸序列的双核苷酸频率特征向量,表征数字特征.采用Pearson相关系数分析特征向量之间的距离.结果以119个细菌的全基因组核酸序列为研究对象,两两比对的结果为:越是相近的物种,Pearson相关系数越大,PCC距离越小.结论该方法对细菌亲缘关系的定量描述做了有益的探索.
关键词: Pearson相关性系数 双核酸频率特征向量 基因组特征