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HBV基因型与拉米夫定疗效相关性的研究
根据聚合酶链反应-限制性片断长度多态性(PCR-RFLP)基因型分型法,目前已将前S基因分为A、B、C、D、E和F六种基因型.本文就HBV基因型分型方法,基因型与疾病的关系以及与拉米夫定抗病毒疗效相关性的研究作一综述.
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两种类型急性胰腺炎患者早期外周血Toll样受体4基因多态性分析
目的 探讨Toll样受体4(TLR4)(896A>G)基因多态性、核因子-κB激活在两种类型急性胰腺炎(AP)患者中的差异.方法 选取山西医科大学第二医院2013年1月至2015年12月AP患者52例,其中轻症急性胰腺炎(MAP)和中重症急性胰腺炎(MSAP)各26例.采用错配PCR-限制性片段长度多态性分析方法检测外周血中TLR4(896A>G)突变频率、流式细胞术检测核因子-κB激活.各组间血淀粉酶、尿淀粉酶、APACHEⅡ评分、MCTSI评分的比较采用t检验;NF-κB激活组间数据采用重复测量方差分析;TLR4(896A>G)频率比较采用 χ2检验.结果 与MAP组相比,MSAP组APACHEⅡ评分和MCTSI评分均显著升高[(8.2±3.1)分vs(4.6±1.8)分;(5.2±1.4)分vs(2.4±0.8)分],差异具有统计学意义(t=3.408,P=0.004;t=5.422,P=0.000);但血、尿淀粉酶两者间差异无统计学意义(P>0.05).各组外周血中性粒细胞、单核巨噬细胞NF-κB p65激活不同时间段之间差异有统计学意义(F=125.387,P<0.001),时间与组别之间存在交互效应(F=55.466,P<0.001),不同组别间差异有统计学意义(F=1126.191,P<0.001).TLR4(-/+)(896A>G)等位基因频率,MAP组与对照组相比差异无统计学意义(OR=3.13,P=0.63),MSAP组与对照组比较,差异具有统计学意义(OR=10.67,P=0.03).结论 TLR4错义突变(TLR4896A>G)和核因子-κB激活在不同类型AP患者具有明显差异.重视TLR4/NF-κB跨膜信号转导通路在AP发病中的作用,对临床诊断及治疗具有一定指导价值.
关键词： Toll样受体4 核因子-κB 流式细胞术 急性胰腺炎 限制性片断长度多态性 -
胰岛素受体底物1基因Gly972Arg多态性与2型糖尿病不相关
目的探讨中国汉族人群胰岛素受体底物1 (IRS-1)基因Gly972Arg多态性与2型糖尿病的关系. 方法选取102例2型糖尿病患者及102例糖耐量正常的患者配偶进行对照研究,应用聚合酶链反应--限制性片断长度多态性的方法进行胰岛素受体底物1基因Gly972Arg多态性位点基因型检测. 结果 IRS-1基因Gly972Arg突变频率在病例组和对照组均为2%,明显低于白人. 结论在中国汉族人群中,IRS-1基因Gly972Arg突变不是2型糖尿病的主要致病因素.
关键词： 胰岛素受体底物1基因 2型糖尿病 聚合酶链反应 限制性片断长度多态性 -
多发性骨髓瘤患者肿瘤坏死因子α水平及其基因启动子多态性的研究
多发性骨髓瘤(MM)是以骨髓单克隆浆细胞增多为特征的B细胞恶性疾病,肿瘤B细胞能以自分泌的方式产生TNFα[1].近年来研究显示[2],TNFα基因启动子具有多态性,而这种多态性可能导致TNFα转录水平的变化,可能会影响TNFα在肿瘤增殖过程中的自分泌模式.因此,TNFα基因启动子与人类疾病的关系,成为国内外学者研究热点.我们通过检测血清TNFα水平及应用PCR-限制性片断长度多态性(PCR-RFLP)技术研究TNFα308位点在MM患者和正常人中的分布情况.
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绝经后妇女雌激素受体(ER)基因XbaⅠ限制性片断长度多态性(RFLP)与骨密度的关系
目的研究绝经后妇女ER基因XbaⅠ限制性片断长度多态性(RFLP)与骨密度、骨生化指标和停经年限的关系.方法用PCR-RFLP方法检测绝经后妇女的ER基因型;DEXA检测腰椎和股骨各处骨密度,同时测定血骨钙素、尿吡啶并酚等骨转换指标.结果在205例绝经后妇女中发现XX、Xx和xx基因型频率分别为6.8%、25.9%和67.3%,XX基因型的妇女虽然停经时间更长,但腰椎骨密度仍高于Xx和xx型.结论 ER基因XX型可能对腰椎骨量的维持有一定作用.
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日本人群2型糖尿病中骨骼肌特异性蛋白质磷酸酶1糖原靶亚基基因的3′-非翻译区多态性
近有报道蛋白质磷酸酶1骨骼肌特异性糖元亚单位(PPP1R3)基因的新发现的 3′-非翻译区(UTR)多态性与Pima印第安人胰岛素抵抗和2型糖尿病发病率相关.为阐明PPP1R3基因的这种多态性在日本人2型糖尿病发病机制中的作用,本实验用聚合酶链反应-限制性片断长度多态性(PCR-RFLP)法对426名日本2型糖尿病和380名非糖尿病者的PPP1R3基因的UTR多态性进行了研究.
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载脂蛋白E和脂肪结合蛋白-2基因多态性与2型糖尿病肾病的相关性研究
目的探讨载脂蛋白E(Apo-E)基因、脂肪酸结合蛋白-2(FABP-2)基因Ala54Thr的多态性与2型糖尿病肾病(DN)的相关性.方法对65例2型糖尿病(DM)患者与30例健康对照者进行血清生化指标检测,并采用多聚酶链反应-限制性片断长度多态性(PCR-RFLP)技术,观察Apo-E、FABP-2 Ala54Thr基因多态性,研究其与DN的关系.结果正常对照组与糖尿病组的Apo-E、FABP-2等位基因和基因型频率存在差异(P<0.01).DM3组的Apo-E2等位基因频率、FABP-2 Thr/Thr基因型频率高于正常对照组(P<0.01).携ε2等位基因的DM患者胰岛素抵抗的稳态模式评估指数(HOMA)、甘油三酯(TG)水平高于携ε3、ε4者,胰岛素敏感指数(ISI)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白(LDL)则低于两者,但无统计学意义.携FABP-2 Thr/Thr基因型患者的尿微量白蛋白(UAER)明显高于携Ala/Ala,Ala/Thr基因型者(P<0.05).Apo-E2与FABP-2 Thr/Thr基因型共显的患者,85.7%出现在DM3组.结论 Apo-E、FABP-2 Ala54Thr基因多态性与DN的发生有关,当Apo-E2与FABP-2 Thr/Thr基因型共显时,可能会加重DN的病情.Apo-E2等位基因与FABP-2 Thr/Thr基因型是预测DN发生和发展有用的指标.
关键词： 载脂蛋白E 糖尿病肾病 基因频率 限制性片断长度多态性 -
老年人心肌梗死与血管紧张素原基因T174M多态性关系
目的探讨血管紧张素原(angiotensinogen,AGT)基因T174M变异与老年人心肌梗死(MI)的发病关系. 方法采用聚合酶链反应(PCR)、限制性片段长度多态性(RFLP)分析,对55例呈MI患者和60例无冠心病证据的对照组(老年人)进行AGT基因T174M等位基因检测.结果 MI患者AGT基因174MM型(7.27%)和M174等位基因(16.36%)的频率显著高于健康对照组(分别为1.67%和9.17%,χ2=7.55,P=0.022,χ2=5.79,P=0.016),经校正冠心病的主要危险因素后,AGT基因174MM仍可显著增加心肌梗死发生的危险性(比数比3.66,P=0.018).结论 AGT基因T174M可能是老年人MI发病的重要危险因素之一.
关键词： 心肌梗死 血管紧张素原 基因 聚合酶链反应 限制性片断长度多态性 -
羊水直接PCR法快速诊断脊肌萎缩症的实验研究
目的:建立一种快速、简便的产前诊断脊肌萎缩症的检测方法.方法:基于运动神经元生存基因SMNc和SMNt的两个同源拷贝碱基的差异,对SMNt基因第7、8外显子进行缺失分析,抽取孕妇羊水后用作者自行研制的“HpH-Buffer”,以离心后羊水沉淀中的胎儿细胞为模板直接进行PCR扩增,扩增产物进行酶切限制性片断长度多态性分析,对2例有脊肌萎缩症患儿生育史的孕妇怀有的胎儿进行产前基因诊断.同时,为考察羊水直接扩增方法的效率,对羊水样本直接扩增和对羊水样本中提取的基因组DNA扩增进行了平行实验.结果:2例胎儿均有SMNt基因第7、8外显子缺失;以羊水为模板和以基因组DNA为模板进行扩增的效率相似.结论:应用“HpH Buffer”直接对羊水样本中SMN基因上外显子7、8进行扩增,结合限制性片断长度多态性分析SMNt上是否发生缺失,可缩短诊断时间,节约诊断成本,减少检测过程中可能出现的样本交叉污染,有望成为临床上产前诊断脊肌萎缩症的新方法.
关键词： 脊肌萎缩症 SMN基因 产前诊断 基因诊断 限制性片断长度多态性 -
低密度脂蛋白受体基因多态性与心肌梗死相关性的研究
目的研究中国东北地区低密度脂蛋白受体(LDLR)基因PvuII多态性与心肌梗死(MI)的相关性,并对其血脂质、脂蛋白水平的关系进行分析.方法采用PCR-RFLP方法检测41例MI患者和67例健康体检者LDLR基因的多态性分布.结果①MI组和对照组的P-P-基因性与高LDL-C和TC水平明显相关,P+P+基因性与较低的TC和LDL-C相关.②MI组患者的P-等位基因型相对频率高于正常组,两者存在显著性差异.③MI组血清TC和LDL-C水平高于对照组,两者存在显著性差异.结论研究证实LDLR基因PvuII位点的多态性可影响血清胆固醇水平,并且与MI的发生密切相关.LDLR基因PvuII位点的多态性变化可作为预测冠心病发生的一个基因标志.
关键词： 低密度脂蛋白 低密度脂蛋白受体基因 限制性片断长度多态性 心肌梗死 -
5-羟色胺2A受体基因多态性与抑郁症的关联研究
目的 探讨5-羟色胺2A(5-HT2A)受体基因T102C和A-1438G多态性与抑郁症的关系.方法 采用聚合酶链式反应(PCR)和限制性片断长度多态性(RFLP)技术检测123例抑郁症患者和122名健康对照的T102C和A-1438G基因多态性分布,病例-对照关联分析法分析两组间基因型频率和等位基因频率的差异.结果 5-HT2A基因T102C多态性等位基因频率和A-1438G等位基因频率在患者组和对照组间的分布均有显著性差异(P＜0.05),患者组C102等位基因频率(30.1%)明显低于对照组(41.0%),在分层分析中,男性患者组中频率(26.2%)明显低于男性对照组(50.0%);患者组A-1438等位基因型频率(69.1%)明显高于对照组(56.6%),A-1438等位基因在女性患者组中频率(69.1%)明显高于女性对照组(55.2%).患者组中TT/AA(T102T/A-1438A)基因型组合频率(43.9%)明显高于对照组(20.5%).结论 5-HT2A基因T102C和A-1438G多态性可能与抑郁症的发病有关,其中C102等位基因可能是男性罹患抑郁症的保护因子,A-1438等位基因可能是抑郁症特别是女性抑郁症患病的危险因子,T102T和A-1438A基因型同时出现可能是抑郁症发病的重要危险因素.
关键词： 抑郁症 聚合酶链反应 限制性片断长度多态性 五羟色胺 基因多态性 -
上海市长宁区2005-2006年肺结核分子流行病学研究
结核分枝杆菌可变数目串联重复( variable - number ctandem repeats,V1NTR)或散在分布重复单位(mycobacterial interspersed repetitive units typing,MIRU)基因型分型法,是利用结核分枝杆菌基因组中特定位点上数目可变的串联重复序列进行基因型分型的方法[1-2],通过不同位点和数目的组合其分辨率可以达到或接近于"金标准"IS6110限制性片断长度多态性(IS6110 restriction fragment length polymorphism,IS6110 - RFLP)分型法[3].该方法操作简单,其数字化的结果更有利于世界各地不同实验室鉴定菌株的比较,使人们可以在全球范围追踪特定菌株[4].
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多巴胺D2受体基因与迟发性运动障碍关联研究
目的探讨DRD2基因TaqI多态性的分布与迟发性运动障碍(TD)的关联性.方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态的方法,检测100例精神分裂症伴TD患者、60例无TD患者和102名正常人DRD2基因TaqI多态性,比较各组等位基因和基因型频率分布的差异.结果经吻合度检验,精神分裂症伴有TD组、无TD组和正常对照组DRD2基因各基因型的分布均符合Hardy-Weinberg平衡法则(x2=0.242,0.208,0.002,υ均=1,P均＞0.05);经比较,显示各基因型及等位基因在各组间分布无显著性差异(经Z检验,υ均=1,P均＞0.05);TD患者DRD2基因多态分布在不同性别之间无显著性差异(P＞0.05);在TD组中,基因型频数及等位基因频数与病程、服药时间、药物、剂量和AIM评分无显著性意义(P＞0.05).结论DRD2基因TaqI多态性可能与TD的发生无关联性.
关键词： 多巴胺 D2受体基因 迟发性运动障碍 限制性片断长度多态性 -
α1-抗糜蛋白酶信号肽基因及载脂蛋白E基因多态性与帕金森病的关系[郝怡鑫,等.中华医学杂志,2001,81(19):1172]
目的:探讨α1-抗糜蛋白酶(AACT)信号肽基因多态性、载脂蛋白E(ApoE)基因多态性与帕金森病(PD)发病风险间的关系.方法:采用聚合酶链式反应限制性片断长度多态性方法(PCR-RFLP),在64例PD患者、101例健康老人中对照观察AACT信号肽基因多态、ApoE基因多肽的分布,并通过比值比(OR)对AACT多态、ApoE多态与PD作相关分析.结果:(1)PD患者与正常老人间不存在AACT各等位基因多态分布的差异(χ2=0.83,P=0.363<0.05),但PD患者AACT-AA纯合子基因型与PD呈正关联(OR=2.68, χ2=4.31,P=0.038<0.05).(2)AopE基因多态性与PD之间不存在任何关联(等位基因:χ2=2.85,P=0.241>0.05;基因型:χ2=9.25,P=0.099>0.05).(3)非ApoEε4型AACT-AT杂合子基因型与PD负关联(OR=0.47,χ2=4.10, P=0.043<0.05).(4)AACT-AT杂合子型PD与ApoEε4等位基因正关联(OR=3.26,χ2=5.53,P=0.019<0.05).结论:AACT-AA纯合子基因型、ApoEε4型AACT-AT杂合子基因型均可能是PD发病的风险因子.
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利巴韦林与α-干扰素联合治疗1 b基因型慢性丙型肝炎
此项研究目的是比较单用大剂量α-于扰素(疗程12月)与利巴韦林、α-干扰素联合治疗1b基因型慢性丙型肝炎的疗效.研究对象包括307例治疗前ALT水平升高、血清HCV RNA阳性且活检证实慢性肝炎的1b基因型慢性丙型肝炎病人,随机分为三组,A组95人,给予α2b-干扰素,6Mu,皮下注射,每周3次,6月后改为3Mu,每周3次,再用6月;B组83人,给予α2h-干扰素,10Mu及6Mu,皮下注射,每周3次,各3月后改为3Mu,每周3次,再用6月;C组129人,干扰素用法同A组,加服利巴韦林1g-1.2g/d(46人服4月,44人服6月,39人服12月).治疗前临床、病理、和病毒学指标各组间均无差异,长期过量饮酒(≥80g/d)、抗-HIV或HBsAg阳性、用过免疫抑制剂者不纳人本研究.抗-HCV用第二代ELISA试剂,分支DNA法进行HCVRNA定量,HCV基因型用限制性片断长度多态性(RFLP)分析法,肝组织炎症活动度用Knodell积分.
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丙型肝炎病毒基因NS5区酶切分型研究
目的:了解丙型肝炎病毒(HCV)感染的基因型及其与临床的关系.方法:用逆转录套式聚合酶链反应(RT-PCR)和限制性片断长度多态性(RFLP)分析的方法,对78例HCV感染患者进行HCV NS5区基因分型.结果:HCV1b型感染71例(91%),HCV 2a型7例(9%),未发现其它基因型;丙型肝炎患者有无输血史、是否重叠HBV感染,其基因分型构成比均无显著性差异(P>0.05);1b型HCV血清ALT异常者(63.4%)明显多于2a型(14.3%)(P<0.05).结论:本组HCV感染的基因型多数为1b型,少数为2a型,1b型更易致肝细胞损伤,并可能与活动性肝病有关.
关键词： 丙型肝炎病毒 基因型 限制性片断长度多态性 -
乙型肝炎病毒基因型、拉米夫定耐药突变的RFLP检测及临床相关性分析
目的 对乙型肝炎(简称乙肝)肝病毒进行基因分型,检测患者服用拉米夫定后血清中乙肝病毒突变情况,并进行临床相关性分析.方法 设计乙肝病毒突变及基因分型特异性引物和酶切位点,系用限制性片断长度多态性(RFLP)分析法检测突变类型并对乙肝病毒进行基因分型.结果 在115份被检测的血清标本中,75份(65%)标本为野生型,18份(15.7%)标本为YIDD突变,10份(8.7%)标本为YVDD突变;在混合型突变中,YIDD+YVDD 存在于6份(5.2%)标本中,YMDD+YIDD存在于4份(3.5%)标本中,2份(1.7%)标本为YMDD+YVDD混合突变型;未检测到YSDD突变型.在180位点的突变检测中,98份(85%)标本为野生型,5份(4.3%)标本为rtL180M,L180M+M204I存在于8份(6.96%)标本中,另4份(3.5%)标本为L180M+M204V混合突变型.在115份标本中,102份标本为C基因型,13份标本为B基因型,未发现其他基因型.通过χ2检验,乙肝病毒YMDD突变与患者的性别、血清DNA水平、病毒基因型之间没有相关性(P＞0.05),而乙肝病毒YMDD变异与患者服用拉米夫定的时间长短有相关性(P＜0.05),用药时间越长,发生突变的几率越大.乙肝患者服用拉米夫定后,180位点的突变和204位点突变具有相关性(P＜0.05).结论 采用RFLP分析法可以有效地检测乙肝病毒YMDD突变并对乙肝病毒进行基因分型.
关键词： 乙型肝炎病毒 突变 基因分型 YMDD 限制性片断长度多态性 -
2型糖尿病患者脂蛋白脂酶常见变异基因检测
目的:探讨脂蛋白脂酶(LPL)基因三种常见基因变异(Asp9Asn、Asn291Ser和Ser447Ter)与2型糖尿病的相关性.方法:采用PCR-RFLP方法,分析102例2型糖尿病患者(病例组)及113名健康体检者(对照组)LPL基因Asp9Asn、Asn291Ser和Ser447Ter位点多态性.结果:病例组和对照组中未发现Asp9Asn及Asn291Ser突变,病例组Ter447等位基因和Ser447Ter基因型频率均低于对照组(3.4%vs 7.6%;6.9%vs 15.0%),其差异非常接近显著性水平(P=0.065和P=0.057).结论:我国汉族人群脂蛋白脂酶基因Asp9Asn、Asn291Ser突变位点与2型糖尿病无明显关联,而S447X突变能引起有益的血脂改变,很可能与2型糖尿病发病率降低相关.
关键词： 脂蛋白脂酶 基因 2型糖尿病 限制性片断长度多态性 -
脂蛋白脂酶基因S447X多态性与2型糖尿病的相关研究
目的:探讨脂蛋白脂酶(LPL)基因S447X多态性是否与2型糖尿病发病率降低相关,及其对患者血脂代谢的影响. 方法:采用聚合酶链反应-限制性片断长度多态性方法,对102例2型糖尿病患者(病例组)及113名非患者(对照组)S447X位点进行分析.结果:病例组X等位基因和S/X基因型频率均低于对照组,其差异非常接近显著性水平(P =0.065和P=0.057).我国汉族人群S447X多态性位点等位基因频率与欧美白种人相似.结论:LPL基因S447X突变能引起有益的血脂改变,很可能与2型糖尿病发病率降低相关,该多态性位点分布未见明显的种族差异.
关键词： 脂蛋白脂酶 基因 2型糖尿病 限制性片断长度多态性 -
广东人群CYP2C9基因T269C位点多态性研究
目的研究广东人群CYP2C9基因T269C位点多态性.方法 PCR扩增跨越CYP2C9基因T269C位点的DNA片断,用MvaI酶切PCR产物,通过PAGE-银染判断基因型.结果在接受检测的158例健康广东人中,共检出2名CYP2C9 T269C位点杂合子个体,其余156人均为野生型纯合子个体.结论广东人群存在CYP2C9 269C即CYP2C9·13等位基因,其频率为0.006;中国人群和韩国人群CYP2C9·13等位基因频率差异无显著性.
关键词： 细胞色素P450 2C9 聚合酶链反应 限制性片断长度多态性
