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DNA修复基因XPD多态性与地方性砷中毒关系的研究
目的研究核苷酸切除修复基因XPD单核苷酸多态性与地方性砷中毒患病风险的关系.方法采用病例对照研究,包括正常对照99人,地方性砷中毒患者92人.以聚合酶链反应-限制性长度多态性方法分析XPD基因Lys51 Gln多态性,比较不同基因型和地方性砷中毒患病风险的方法.结果病例组中野生型XPD75Lys纯合子的频率明显低于对照组,和携带XPD751Lys/Lys基因型比较,携带至少一个XPD75Gln等位基因的个体即LysGln和Gln/Gln基因型,地方性砷中毒发病风险显著增加,OR值分别为1.59和8.56.结论XPD基因Lys51Gln多态性和地方性砷中毒易感性有关,XPD751Gln等位基因可能是地方性砷中毒的风险等位基因.
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DNA修复基因XPD单核苷酸多态性和环境因素的交互作用与肝细胞癌的关联研究
目的 探讨XPD基因751、312位点单核苷酸多态性和环境因素的交互作用与肝细胞癌的关系.方法 采用以医院为基础的病例对照研究方法,运用TaqMan MGB荧光定昔实时PCR分析方法对病例组300例肝细胞癌患者和对照组312例非肿瘤患者进行XPD基因751和312位点的基因型分析.以非条件logistic回归模型分析比较各基因型在两组中分布频率的差异,以及基因多态性和环境因素的交互作用.结果 XPD基因751位点3种基因型AA、AC、CC在病例组和对照组中的分布差异无统计学意义(P>0.05),与携带XPD751野生纯合子AA基因型者比较,携带XPD751AC或CC基因型者患肝细胞癌风险无显著增加(P>0.05).XPD基因312位点3种基因型GG、GA、AA在病例组和对照组中的分布差异有统计学意义(P<0.01).与携带XPD312野生纯合子GG基因型者比较,携带XPD312 AA基因型个体罹患HCC的风险是携带XPD312 GG基因型的2.67倍(OR=2.67,95%CI:0.431～16.537),但差异无统计学意义;携带至少一个XPD312A等位基因的个体罹患肝细胞癌的风险是GG基因型的2.62倍(95%CI:1.626～4.222),且差异有统计学意义.交互作用分析结果表明XPD基因751位点多态性与吸烟、XPD基因312位点多态性与吸烟、XPD基因312位点多态性与HBsAg阳性之间在肝细胞癌发生中存在交瓦作用,交互作用的OR值分别为4.291、5.341、7.348.结论 DNA修复基因XPD312A等位基因可能是广西南部地区人群肝细胞癌的危险等位基因,XPD基因多态性与吸烟、HBsAg阳性之间在肝细胞癌发生中存在交互作用,能增加罹患肝细胞癌的风险.
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核苷酸剪切修复酶XPD基因多态性与非霍奇金淋巴瘤发病风险的研究
本研究探讨核苷酸剪切修复基因XPD基因多态与非霍奇金淋巴瘤(NHL)发病风险的关系.以309名NHL患者和305名健康对照者为研究对象,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态技术检测XPD G23591A、A35931C位点的基因多态,并应用非条件logistic回归方法进行数据分析,比较不同基因型与NHL发病风险的关系.结果表明,XPD G23591A和A35931C基因多态性与NHL发生无显著相关性.进一步将NHL分为滤泡性淋巴瘤(FL)、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、其他B细胞-NHL和T细胞-NHL 4大类分析显示,在4类NHL中XPD 23591位点变异基因型GA+AA型频率分别为16.3%、18.0%、10.5%、18.4%,对照组为12.5%.携带A变异基因型者发生各类NHL危险度(OR值)分别约为每GG型的1.43、1.58、0.89和1.50倍,但各病例组与对照组间差异无显著性(p＞0.05);在4类NHL中XPD35931位点变异基因型AC+CC型频率分别约为15.2%、15.8%、18.4%、12.5%,与对照组11.5%相比,变异基因型频率有所增加,携带C变异基因型者发生各类NHL危险度分别约为AA型的1.41、1.48、1.75和1.12倍.但差异均无统计学显著性(p＞0.05).结论:中国山东地区汉族人群中XPD G23591A、G85931C位点基因多态性与非霍奇金淋巴瘤发病无关.
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DNA切除修复基因XPD312位点多态性与食管癌发病风险的Meta分析
目的 通过Meta分析的方法探讨DNA切除修复基因XPD312位点多态性与食管癌发病风险的相关性.方法 检索PubMed数据库中1990年至2012年6月30日有关XPD基因多态性与食管癌发病风险关系的文献,进行文献筛选和数据提取后,采用Meta-Analyst 3.13软件进行Meta分析.结果 终纳入8篇病例对照研究共10个试验,Meta分析结果显示XPD基因Asp312Asn多态性与食管癌的关联有统计学意义[(Asn/Asn+Asp/Asn)vs.Asp/Asp:OR=1.20,95% CI=1.05~1.36,P=0.01;Asp/Asn vs.Asp/Asp:OR=1.15,95% CI=1.01~1.31,P=0.04].未检测出明显的发表偏倚.结论 对目前相关研究结果的Meta分析显示XPD基因Asp312Asn多态性与食管癌发生风险具有微弱相关性.
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东北地区汉族人群DNA修复基因XPD单核苷酸多态性与胃癌的相关性
目的: 研究核苷酸切除修复基因XPD单核苷酸多态性与东北地区汉族人群胃癌风险倒叵?方法: 以聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法分析了238例胃癌患者标本XPD基因Asp312Asn和Lys751Gln多态性,比较不同基因型与胃癌风险的关系.结果: Lys751Gln多态在胃癌患者中的分布和正常对照组差异不显著,与胃癌风险无关.胃癌患者中Asp/Asn和Asn/Asn基因型频率明显高于正常对照组(P=0.041);与携带312 Asp/Asp基因型者比较,携带至少1个312 Asn等位基因者(即Asp/Asn和Asn/Asn基因型)罹患胃癌的风险增加1.901倍(95%CI:1.119-3.229).结论: XPD基因Asp312Asn多态是东北地区汉族人群胃癌传易感因素.
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XPD对SMMC-7721肝癌细胞中DNp73和GADD45β的调控及意义
目的:观察人剪切修复基因人类着色性干皮病D组基因(xeroderma pigmentosum group D,XPD)转染至人肝癌细胞株SMMC-7721细胞后XPD、DNp73和GADD45p基因的表达变化以及对肝癌细胞生长的影响.方法:实验分4组:重组质粒SMMC-7721-pEGFP-N2-XPD(XPD组)、空载质粒SMMC-7721-pEGFP-N2组(N2组),脂质体组和SMMC-7721细胞空白对照组.应用Lipofectamine2000脂质体瞬时转染,逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)和蛋白印迹(Westernblot)法检测转XPD基因后,人肝癌细胞株SMMC-7721细胞中DNp73以及GADD45β的mRNA和蛋白质的表达量变化,并用四甲基偶氮唑盐(MTT)法检测细胞增殖的活力,流式细胞仪检测细胞凋亡的变化.结果:荧光显微镜下,XPD组和N2组细胞中观察到绿色荧光蛋白表达,说明转染成功；RT-PCR检测显示:XPD组中DNp73 mRNA相对表达量较其他3组显著下调,XPD和GADD45βmRNA相对表达量较其他3组明显上调(均P＜0.01); Western blot检测显示:XPD、DNp73以及GADD45β蛋白相对表达量在各组间的差异与其mRNA各组间差异一致;MTT检测示:SMMC-7721细胞空白对照组、脂质体组、N2组、XPD组的吸光度(A)值分别为0.633-0.012,0.623±0.009,0.628±0.016,0.384±0.011,XPD组低于其他3组,差异均有统计学意义(均P＜0.01),表明转染XPD后SMMC-7721细胞的增殖能力减弱.流式细胞仪检测SMMC-7721肝癌细胞凋亡:转染XPD的SMMC-7721细胞凋亡显著,凋亡率达56.53％,而其他3组均未见明显凋亡.结论:XPD基因在肝癌的发生发展中起抑制作用,癌基因DNp73的表达随XPD表达增加而降低,抑癌基因GADD45β则随XPD表达增加而增加,提示两者可能在XPD抑制肝癌细胞的生长机制中起重要作用.
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XPA、XPC、XPD、XRCC1基因单核苷酸多态性与急性淋巴细胞白血病易感性的关系
目的 研究中国人群DNA修复基因XPA A23G、XPC C499T和A939C、XPD T751G、XRCC1 G399A和C194T单核苷酸多态性与急性淋巴细胞白血病(ALL)遗传易感性的关系。方法 采用病例-对照研究方法，以Mass-ASSAY平台的基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱(MALDI-TOF-MS)技术对114例确诊的ALL病例和169例年龄、性别相匹配的正常对照者进行多态性检测，比较不同基因型与ALL风险的关系。结果 与携带XPA 23AA基因型者相比，携带至少1个23G等位基因(即23GG和23AG基因型)的个体ALL风险是其2.02倍(95％CI1.08 ～3.78)，而同时有XPAA23G和XPC C499T 2个位点突变者ALL风险是其5.60倍(95％ CI 1.57～19.90)。XPD T751G、XRCC1 G399A和C194T多态性与ALL易感性之间无显著相关性。结论 XPA A23G和ⅪC C499T 多态性可能与中国人群ALL遗传易感性有关，且存在显著的协同效应。
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人剪切修复基因XPD对p52和p21基因的影响
目的:探讨人剪切修复基因XPD转染人HepG2肝癌细胞后p52和p21基因表达的变化以及对肝癌细胞生长的影响.方法:人肝癌细胞HepG2为靶细胞,XPD基因通过Lipofectamine 2000脂质体转染HepG2.将细胞分为重组质粒HepG2-pEGFP-N2-XPD组(XPD组)、空载质粒HepG2-pEGFP-N2组(N2组)和HepG2空白对照组.分别用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)和蛋白印迹(Western blot)法检测各组细胞中XPD、p52以及p210的mRNA和蛋白质的表达量,并用四甲基偶氮唑盐微量酶反应比色(MTT)法检测各组细胞的增殖能力.结果:XPD组中的p52的mRNA表达较其他2组显著下调,XPD、p21的mRNA表达较其他2组明显上调(均P<0.01).Westem blot检测结果显示各组细胞中XPD、p52及p21的蛋白表达各组间差异与其mRNA各组间差异一致.MTT检测显示XPD转染入HepG2后细胞增殖能力减弱.结论:XPD基因可以抑制癌细胞的生长和基因p52的表达,促进p21的表达.
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人剪切修复基因XPD对肝癌细胞生长及ERG基因的影响
目的 探讨人剪切修复基因XPD转染人肝癌细胞SMMC-7721后对细胞自身生长及癌基因ERG表达的影响.方法 将XPD基因通过LipofectamineTM 2000转染人人肝癌细胞SMMC-7721.实验分为4组,分别为重组质粒转染细胞SMMC-7721-pEGFP-N2-XPD组(XPD组)、空载质粒转染细胞SMMC-7721-pEGFP-N2组(N2组)、脂质体转染细胞SMMC-7721组(脂质体组)、肝癌细胞SMMC-7721无转染空白对照组(空白对照组).分别用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)和Westem blot法检测各组细胞中XPD、ERG的mRNA和蛋白质的表达量,用四甲基偶氮唑盐比色法(MT)检测各组细胞的增殖活力及流式细胞仪检测各组细胞的凋亡情况.结果 与其他3组比较,XPD组中的ERG mRNA及蛋白表达量显著降低,而XPD mRNA及蛋白表达量明显升高(P＜0.01).转染了XPD的肝癌细胞SMMC-7721,其细胞增殖活性(0.455±0.009)显著降低,细胞凋亡率(42.06±0.01)％明显升高(P＜ 0.001).结论 XPD基因可以抑制癌基因ERG的表达,明显降低肝癌细胞的增殖活力并提高肝癌细胞的凋亡率.
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XPD基因多态性与辐射致染色体损伤关系
目的 探讨人类着色性干皮病基因D(XPD基因)751位点、312位点多态性与电离辐射损伤效应之间的相关性,为筛检电离辐射高危人群提供生物学指标.方法 应用病例对照研究方法,以唐山市所有从事射线工作的人员为对象,选择有染色体异常的放射人员182人为病例组,以无辐射损伤182人为对照组,进行1∶1配对.染色体分析采用微量全血培养法,XPD基因751,312位点基因型检测采用聚合酶链反应-限制性片断长度多态性(PCR-RFLP)分析.结果 XPD 751位点野生型AA与突变基因型(包括突变杂合子AC和突变纯合子CC)在病例组与对照组之间差异有统计学意义,病例组野生基因型频率高于对照组(OR=1.90,95% CI=1.10～3.28,P＜0.05).结论 XPD751位点基因多态性与辐射致染色体损伤有关联,751位点野生基因型AA是辐射致染色体损伤的危险因素.
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着色性干皮病基因D多态性与二甲基甲酰胺致肝功能损伤易感性的关系
采用随机整群抽样方法抽取296名二甲基甲酰胺作业工人为研究对象,采集外周静脉血样品,检测血ALT、AST、γ-GT水平,采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性分析技术(PCR-RFLP)检测XPD基因Asp312Asn、Lys751 Gln多态性,分析二甲基甲酰胺作业工人不同基因型与二甲基甲酰胺肝毒性易感性的关系.结果显示,XPD-312GG/GA+ AA、XPD-751AA/AC+ CC基因型组工人血ALT、AST、γ-GT水平比较,差异均无统计学意义(P＞0.05);肝功能指标异常以ALT≥ 50 IU/L、AST≥40 IU/L、γ-GT≥54 IU/L一项或一项以上为界,经x2检验、logistic回归分析显示,不同基因型组工人肝功能异常率差异均无统计学意义(P＞0.05),校正ORj分别为0.70、1.03,95％ CI分别为0.38～1.41、0.51 ～2.05.说明XPD基因Asp312Asn和Lys751 Gln多态性可能与二甲基甲酰胺肝毒性易感性无关.
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DNA修复基因XPD 312 Asn和751Lys多态性与非吸烟女性肺癌的关系
目的 着色性干皮病互补基因D(xeroderma pigmentosum group D,XPD)是一种重要的DNA损伤修复基因,其常见的多态是位于751密码子的A→C颠换和312密码子G→A转换.本研究旨在探讨XPD基因751位点和312位点单核苷酸多态性与非吸烟女性肺癌易感性的关系.方法 采用病例-对照研究方法,纳入非吸烟女性肺癌患者222人和对照222人.以聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法分析XPD基因Lys751Gln和Asp312Asn多态基因型.结果 携带至少1个751Gln等位基因者和携带至少1个312Asn等位基因者患肺癌的风险均显著增高,调整OR分别为3.36(95%CI为2.29-4.90)和1.83(95%CI为1.16-2.91).结论 XPD基因Lys751Gln和Asp312Asn多态是非吸烟女性肺癌的遗传易感因素.
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DNA修复基因XPD多态性和肝细胞肝癌危险性的病例-对照研究
目的探讨DNA修复基因XPD多态性和肝细胞肝癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)发生的关系.方法应用病例-对照研究方法,选择了江苏启东地区72例HCC患者以及137例正常对照,以年龄(±3岁)和性别为配对因素进行了配对,对XPD-751位点基因多态性作PCR-RFLP分析.结果XPD-751位点的Gln/Lys或Gln/Gln基因型的发生频率在病例组中明显高于对照组,差别有显著性(OR=3.13,95%CI=1.16～8.47),在调整了HBV感染因素后,差别的显著性虽然消失,但可信限下限位于临界处(OR=2.70,95%CI=0.98～7.42).对HBV感染患者并同时伴有XPD-751位点为Gln/Lys或Gln/Gln基因型的个体,其HCC发生的危险性是HBV阴性及XPD-751位点为Lys/Lys野生型基因型个体的6.68倍,差别有显著性(OR=6.68,95%CI=3.43～13.01).结论本次研究的结果首次应用病例-对照研究发现XPD-751位点基因多态性可能影响HCC的发生,同时指出XPD-751位点基因多态性和HBV感染之间可能存在基因-环境交互作用.
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在晚期非小细胞肺癌中XRCC1和XPD基因多态性的联合和铂类化疗的关系
目的 探讨DNA修复基因XRCC1和XPD两种基因多态性的联合与接受铂类治疗的非小细胞肺癌(NSCLC)患者临床疗效及生存时间的关系.方法 对接受铂类治疗的108例ⅢB期和Ⅳ期NSCLC患者,利用聚合酶链反应(PCR)结合限制性片段长度多态性(RFLP)来检测XRCC1第399位点和XPD第751位点基因多态性,通过电话随访等方式获得患者的生存状态,以STATA软件分析比较基因多态性与铂类化疗疗效及生存时间的关系.结果 在所有接受含铂药物治疗的患者中,化疗总有效率为21.6%.携带XRCC1 Arg/Gln基因型和XPD Lys/Gln基因型的患者有更高有效率(33.33%),但此类患者与其他各种基因型患者相比,化疗有效率的差异无统计学意义(P＞0.05).Cox比例风险模型显示,携带XRCC1 Arg/Gln基因型和XPD Lys/Gln基因型的患者中位生存时间(MST)长35.5个月,但与其他基因型患者相比,MST差异无统计学意义(P＞0.05).结论 同时携带XRCC1 Arg/Gln和XPD Lys/Gln基因型的NSCLC患者,使用含铂方案化疗可能有更高的有效率和更长的生存期.但此结果仍需扩大样本进一步验证.
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非小细胞肺癌患者DNA修复基因XPD多态性与p53基因突变的相关性研究
[目的]研究非小细胞肺癌(NSCLC)患者DNA修复基因XPD多态性与p53基因突变的相关性.[方法]以PCR-RFLP方法分析60例NSCLC患者外周血XPD基因Lvs751Gln多态;运用PCR-SCCP银染结合DNA序列分析法检测癌组织p53基因第5、6、7和8外显子突变情况.[结果]19例患者至少携带1个XPD751Gln等位基因;25例发生p53基因突变.突变率为42%:携带至少1个XPD751Gln等位基因的患者中p53基因突变率为52.6%,XPD751野生基冈型中突变率为36.6%(P=0.27).所有p53基冈突变患者DNA序列分析结果显示,颠换27个,转换12个;突变类型分析显示,携带至少1个XPD751Gln等位基因的患者颠换发生明显占优势,颠换:转换为14:2,XPD751野生基因型颠换:转换为13:10(P=0.08).[结论]NSCLC患者中DNA修复基因XPD多态性与p53基因突变发生无明显相关性.
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修复基因XRCC1和XPD多态性及交互作用对铅毒性易感性的影响
目的 研究XRCC1、XPD基因多态性及交互作用与铅毒性易感性的关系.方法 采集326名某蓄电池企业铅作业工人静脉血和晨尿,检测血铅、血锌原卟啉(ZPP)和尿铅,用PCR-RFLP检测XRCC1、XPD的基因多态性,分析不同基因型及交互作用对铅毒性易感性的影响.结果 XRCC1-19 4CT+ TT基因组平均血铅值较XRCC1-194CC组高;病例组XRCC1-194CT+ TT基因型比例大于对照组,慢性铅中毒发生率风险较XRCC1-194CC组高.结论 在相同职业铅暴露环境下,XRCC1-194CT+ TT基因型工人对铅毒性易感;XPD Asp312Asn和Lys751 Gln多态性与铅毒性易感性无关;XRCC1 Arg194Trp、XPD Asp312Asn和Lys751Gln基因对铅毒性的影响不存在交互作用.
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胃癌病人外周血XPD751基因多态性与奥沙利铂化疗敏感性的关系
目的 探讨胃癌病人外周血白细胞中DNA 修复基因XPD751基因多态性与奥沙利铂化疗效果的关系.方法 收集经病理学检查确诊的胃癌128例,所有病例化疗前取静脉血,提取白细胞DNA,用TaqMan-MGB探针等位基因分型技术检测XPD751基因型.比较其基因型与接受奥沙利铂化疗病人临床疗效的关系.结果 在128例胃癌病人中,XPD751 A/A、A/C和C/C基因型分别为 104(81.3%)、23(17.9%)和1例(0.8%).经化疗后,63例病人有效,总有效率为49.2%.XPD751 A/A、A/C+C/C基因型有效率分别为53.3%(56/105)、30.4% (7/23),两者相比差异有统计学意义(χ2=3.958,P＜0.05).携带A/A基因型病人的腹泻程度高于A/C+C/C基因型病人(χ2=7.212,P＜0.05).结论 XPD751基因多态性可能与胃癌对奥沙利铂为基础的化疗敏感性相关.
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XPD基因在氢醌致U937细胞DNA损伤修复中的作用
目的 探讨XPD基因在氢醌(HQ)致U937细胞DNA损伤修复中的作用.方法 选择5、10、20、40、80 μmol/L HQ分别对U937细胞染毒12、24、48 h,根据各浓度下U937细胞活性,选择10、20、40 μmol/L HQ染毒24、48 h进行后续实验.取10、20、40 μmol/L HQ染毒24、48 h U937细胞,分别设为HQ低、中、高浓度组,另取未染毒U937细胞作为空白对照组,采用单细胞凝胶电泳检测各组细胞尾矩(TM)、Oliv尾矩(OTM),采用Western blotting法检测各组XPD蛋白相对表达量.结果 与空白对照组比较,HQ低、中、高浓度组染毒24、48 h TM和OTM均明显增大(P均<0.05);与同组染毒24 h比较,HQ低、中、高浓度组染毒48 h TM和OTM均明显增大(P均<0.05),染毒48 h HQ低、中、高浓度组TM和OTM依次升高(P均<0.05).与空白对照组比较,HQ低、中、高浓度组染毒24 h XPD蛋白相对表达量均明显升高(P均<0.05),且HQ高浓度组明显高于HQ低浓度组(P均<0.05);染毒48 h,HQ高浓度组XPD蛋白相对表达量明显高于空白对照组及HQ低、中浓度组(P均<0.05),但空白对照组及HQ低、中浓度组两两比较差异均无统计学意义(P均>0.05);HQ各浓度组染毒48 h XPD蛋白相对表达量与染毒24 h比较差异均无统计学意义(P均>0.05).结论 XPD基因表达上调可促进HQ致U937细胞DNA损伤修复.
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DNA修复基因XPD单核苷酸多态性与肺癌遗传易感性
目的 探讨XPD基冈单核营酸多态性与肺癌遗传易感性的关系.方法 以聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法分析肺癌患者(n=114)和按性别、年龄频数配比的对照者(n=114)XPD基因Asp312Ash和Lys751GIn位点的多态性,比较不同基因型与肺癌风险的关系,并探讨吸烟在其中的影响.结果 与携带XPD 312Asp/Asp基冈型者比较,携带至少1个312Asn等位基因的个体罹患肺癌的风险增加1.55倍(95%CI 1.02～2.39).而与携带XPD 751Lys/Lys基因型者比较,携带至少1个751 GIn等位基因的个体罹患肺癌的风险并没有显著增加(校正OR=0.96;95%CI 0.53～0.72).交互作用分析显示,携带至少1个312Asn等位基因并吸烟者肺癌风险增加5.14倍(95%CI 1.82～9.16),其巾重度吸烟者肺癌风险增加高达7.32倍(95%CI 2.17～21.18).结论 DNA修复基因XPD Asp312Asn多态性可能与山东地区汉族人群肺癌遗传易感性有关.并可显著增加吸烟对肺癌的危险性.
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XPD基因多态性与慢性苯中毒发病风险的单纯病例研究
目的 研究环境暴露因素与着色性干皮病基因D多态性对慢性苯中毒发生危险性的影响.方法 以152例慢性苯中毒工人为研究对象,应用单纯病例方法进行分析.结果 高接触组慢性苯中毒病人XPDc.312位点Asp/Asn+ Asn/Asn基因型的携带率显著高于低接触组(44.7％vs 12.2％,ORadj=7.14,95％ CI:1.26～40.0,P=0.03);慢性苯中毒病人XPDc.751位点Lys/Gln基因型的携带率在吸烟*低接触组高于非吸烟*低接触组(60％ vs 12.8％,P＜0.05),但在调整性别、工龄后差异无统计学意义.结论 XPDc.312位点的基因多态与高强度苯接触存在交互作用,影响到慢性苯中毒发生的危险性.
