首页 > 文献资料
-
一起由札如病毒引起的急性胃肠炎暴发疫情的分子流行病学研究
目的 调查深圳市某幼儿园发生的一起急性胃肠炎暴发疫情的病原体,并分析病原体的分子流行病学特征.方法 收集患病幼儿及相关人员的粪便标本16份,剩余食物6份,采用国家卫生行业标准规定方法检测肠道致病菌、实时荧光RT-PCR法检测诺如病毒、札如病毒、轮状病毒核酸,逆转录RT-PCR法对病毒衣壳区和聚合酶区序列进行扩增,对PCR产物进行序列测定.序列用Clustalx软件进行多重比对、Mega 5.0软件绘制系统进化树.结果 16份样本中检出11例札如病毒核酸阳性,对其中3例阳性标本进行札如病毒衣壳区和聚合酶区序列测定,3株札如病毒与GII.3型参考株AY603425衣壳区核苷酸同源性为86.3％,聚合酶区核苷酸同源性为90.2％,3株札如病毒与GII.3型参考株AY603425、AB455793同属于GII.3型遗传分支.结论 此起急性胃肠炎爆发是由GII.3型札如病毒导致,GII.3型引起的急性胃肠炎暴发属广东省首次报道.
-
一起幼儿园札如病毒感染所致急性胃肠炎聚集性疫情调查
目的 对一起幼儿园急性胃肠炎聚集性疫情进行调查,为明确病因及有效控制疫情提供参考依据.方法 2016年10月16日对北京市某幼儿园出现呕吐、腹泻症状的患者进行调查,调查内容包括发病前3 d的病例接触史、同住人员发病情况、发病前72 h饮食饮水史、其他可疑食物摄入情况、疫苗接种史及生活习惯等;制定病例定义,设对照组,病例组和对照组均采集粪便标本进行实验室检测,检测方法为荧光定量RT-PCR法.结果 共发现14名病例,均在一个班级;其中,幼儿13例,教师1例.13份粪便标本中,诺如病毒、轮状病毒、星状病毒、腺病毒检测结果均为阴性,9份标本札如病毒核酸检测阳性,阳性率为69.2%.对照组11份标本中,1份粪便标本札如病毒核酸检测阳性,阳性率为9.1%.病例组和对照组札如病毒核酸检测阳性率差异有统计学意义(Fisher确切概率法,P=0.005).结论 本次疫情为一起由札如病毒引起的急性胃肠炎聚集性疫情.
-
2016年深圳市腹泻患者札如病毒感染特征分析
目的 分析深圳市腹泻患者札如病毒(sapovirus,SaV)的感染特征.方法 收集2016年1月至12月深圳市疑似病毒性腹泻患者粪便标本838份,采用RT-PCR法检测粪便中的SaY核酸,将阳性PCR扩增产物测序并进行进化分析,同时分析病例的流行病学特征.结果 2016年,深圳市SaV的检出率为1.07％(9/838),男性检出率为1.68％(8/477),女性检出率为0.55％(1/361),不同性别检出率差异无统计学意义(x2=3.79,P＞0.05).3～14岁患者无检出,0～2岁、15～19岁及20岁以上患者检出率分别为0.79％(3/381)、5.00％(1/20)和1.36％(5/367).SaY在春季的检出率为0.99％(2/202),夏季的检出率为1.15％(4/347),秋季的检出率为1.35％(3/222),冬季无检出.系统进化分析表明,SaV的GI.2型是深圳市SaY的优势流行株,同时SaV的GI.1型亦有检出.结论 SaV是深圳市病毒性腹泻的病原之一,GI.2是主要的检出型别.
-
人类札如病毒流行概况
1976年英国学者Madeley CR等[1]使用电镜首次在人粪便标本中观察到直径约30nm的猫杯状病毒样颗粒,呈“大卫”星(star ofDavid)状.此后其他研究者也有类似的发现.1979年Chiba S等[2]对日本札幌市的一起急性胃肠炎暴发疫情进行调查,在患者粪便标本中也发现类似的病毒颗粒,实验室检测结果和流行病学证据证实了该病毒在入急性胃肠炎中的致病作用.1998年国际病毒分类委员会(the international committee on taxonomy of viruses,ICTV)将其命名为札幌样病毒(“Sapporo-like viruses”),2002年重命名为札如病毒(Sapovirus,SaV)[3].ICTV 2009年将杯状病毒科分为5个属:诺如病毒(Norovirus,NoV)、札如病毒(Sapovirus,SaY)、囊病毒(Vesivirus,VeV)、兔出血热病毒(Lagovirus,LaV)和Nebovirus(NeV)[4].其中,NoV和SaV主要感染人,二者合称为人类杯状病毒(human calicivirus,HuCV),其它三种则感染动物.
-
一起札如病毒所致成年人急性胃肠炎暴发的分子流行病学研究
目的 了解一起成年人急性胃肠炎暴发流行的病原学.方法 采用国家标准方法对样本进行沙门菌、志贺菌、金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌、副溶血弧菌、变形杆菌、致泻性大肠埃希菌、蜡样芽孢杆菌、空肠弯曲菌及单核细胞增生李斯特菌10种致病菌进行检测.采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测诺如病毒和札如病毒核酸,对阳性PCR产物进行核苷酸序列测定,并进行基因系统进化分析.结果 7份粪便样本中4份为札如病毒核酸阳性.4株札如病毒与GⅠ.2型参考株核苷酸序列司源性在94.7％～98.4％之间.基因进化分析显示,札如病毒深圳株与Sapovirus Hu/Oshimal/2009/JP、Houston/90 (U95644)、Parkville/94/U73124在同一进化树遗传分支,属于GⅠ.2型.结论 此起成年人急性胃肠炎暴发是由札如病毒GⅠ.2型感染所致.
-
2010年乌鲁木齐市住院儿童病毒性腹泻监测结果分析
目的 了解乌鲁木齐市住院儿童病毒性腹泻的流行现状.方法 2010年1-12月采集乌鲁木齐市379例腹泻住院患儿粪便标本,用酶联免疫吸附试验(ELISA)、反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和聚合酶链反应(PCR)检测5种常见腹泻病毒.结果 229份(60.4％)粪便标本检出至少1种病毒.轮状病毒、诺如病毒、星状病毒、肠道腺病毒和札如病毒检出率分别为45.6％、14.2％、4.2％、3.2％和1.1％.混合感染共26例,以轮状病毒和诺如病毒组合占首位(50.0％,13/26).1-3月和10-12月是轮状病毒流行高峰期；诺如病毒流行主要发生在10月.轮状病毒感染平均年龄小于诺如病毒感染平均年龄(P =0.002),肠道腺病毒和札如病毒感染全部发生于＜2岁儿童.结论 轮状病毒仍是2010年乌鲁木齐市儿童病毒性腹泻的主要的病原体,其次是诺如病毒；混合感染占一定比例,在以后的流行病学及病原学研究中应该更加关注混合感染的出现.
-
一起小学札如病毒急性胃肠炎聚集性疫情调查
目的 调查一起小学札如病毒急性胃肠炎聚集性疫情的原因,为有效控制疫情提供参考依据.方法 采用个案调查分析方法,对上海市某小学札如病毒性胃肠炎疫情进行调查.结果 2013年1月上旬上海市奉贤区某所小学连续发生32名师生急性腹泻,经采集粪便等标本检测证明为札如病毒性腹泻.经及时采取有效防控措施,疫情得到及时控制.结论 该小学的急性腹泻为一起札如病毒急性胃肠炎聚集性发病疫情,密切接触及未能及时消毒是该疫情发生的主要原因.
-
兰州地区2003-2007年急性腹泻住院患儿中札如病毒感染情况研究
诺如病毒(NV)和札如病毒(SV)同属人类杯状病毒(HuCV),是仅次于轮状病毒(RV)引起儿童急性腹泻的主要病原.本研究对兰州地区急性腹揭住院患儿中SV感染情况、临床特点、基因多态性和遗传变异规律进行初步研究.
-
杭州地区2009-2010年急性腹泻患者中杯状病毒的检测和分型
目的 了解2009-2010年杭州地区急性腹泻患者中杯状病毒基因型别和分子流行病学特征.方法 收集2009-2010年杭州地区920例急性腹泻患者的粪便标本和流行病学资料,用多重PCR方法进行杯状病毒检测,测定部分标本的阳性扩增片段基因序列,并对序列进行系统进化分析.结果 急性腹泻患者杯状病毒检出率为21.8％(201/920),其中诺如病毒(NV)G Ⅰ型25例、GⅡ型170例、札如病毒(SAV) 11例,4例为NVⅠ型和Ⅱ型混合感染、1例为NVⅡ型和SAV混合感染.NV基因型别包括:GⅠ-1(3株)、G Ⅰ-2(1株)、GⅡ-4/2006b变异株(7株)、GⅡ-2(1株)、GⅡ-7(1株)和GⅡ-4/2008变异株(2株);SAV基因型别包括:G Ⅰ -2(5株)、GⅠ-1(4株)和GⅡ-1(1株).杯状病毒的流行在不同季节、年龄组人群均有发病.结论 杯状病毒是2009-2010年引起杭州地区急性腹泻的主要病原之一,其病原具有病毒多样性和基因型别多样性,NVGⅡ-4/2006b变异株或类似株可能是2009-2010年杭州地区流行的优势株.
-
札如病毒急性胃肠炎暴发特征系统综述
目的 了解全球札如病毒(SaⅤ)急性胃肠炎暴发的流行病学及病原学特征.方法 通过万方、中国知网、PubMed、Web of Science等数据库,检索2018年1月以前发表的SaⅤ急性胃肠炎暴发文献,对文献进行评价和筛选,分析暴发的时间分布、地区分布、场所分布、人群分布、传播途径、病原学特征、患者临床症状等.结果 共收集到34篇SaⅤ暴发文献,涉及146起暴发,发生时间范围为1976年10月至2016年4月.138起暴发报告了发生月份,均来自北半球,全年均有发生,8月发生少,12月发生多,主要发生于温度较低月份.报告暴发较多国家为日本、加拿大、美国和荷兰.共141起暴发提供了发生场所,常见的为托幼机构(48/141,34.04％)、长期看护机构(41/141,29.08％)和医院(16/141,11.35％).31起暴发共1 704例病例具有临床症状信息,腹泻常见(1 331/1 704,78.12％),然后分别为恶心(829/1 198,69.20％)、腹痛(840/1 328,63.25％)、呕吐(824/1 704,48.36％)和发热(529/1 531,34.53％).119起暴发确定了病毒型别,其中GⅠ组(51/119,42.86％)和GⅣ组(45/119,37.82％)SaⅤ较为常见,GⅣ组SaⅤ引起的暴发在2007年突然增加,GⅠ组导致的暴发则在2008、2011-2013年报告较多.结论 SaⅤ暴发主要为发达国家报告,寒冷月份高发,常发生于托幼机构和长期看护机构,主要流行株为GⅠ组和GⅣ组.我国SaⅤ暴发防控工作较为落后,需开展相应的培训工作,在有条件的地区开展SaⅤ暴发监测工作.
-
我国九省区2006年札如病毒流行状况及基因序列分析
为了研究我国札如病毒(Sapovirus,SV)的流行情况及变异特点,收集了2006年2月至2007年1月安徽省、福建省、海南省、河北省、河南省等9个地区5岁以下腹泻患儿的粪便标本共1 110份,应用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)对札如病毒进行检测,结果表明,札如病毒阳性率为0.9%.对检测到的全部10株札如病毒进一步进行系统进化分析,表明这10株札如病毒属于三个基因型:GⅠ/1、GⅠ/3和GⅡ/3.
-
北京2008-2009年成人急性胃肠炎病例中札如病毒的检测和分型
目的 了解北京地区2008-2009年成人急性胃肠炎病例中札如病毒的分子流行病学特征.方法 收集2008年8月至2009年7月519例14岁以上急性胃肠炎门诊病例粪便标本和流行病学资料,利用RT-PCR方法检测札如病毒,测定所有阳性毒株序列并进行系统进化分析.结果 札如病毒的检出率为3.7％(19/519),主要在20 ～39岁年龄组中检出,5月检出率高,系统进化分析表明GⅣ札如病毒为主要毒株,其他基因型包括GⅠ.2和GⅡ.3型.结论 札如病毒是北京地区成人急性胃肠炎的病原之一,GⅣ基因型是主要流行型别.
-
急性腹泻婴幼儿胃肠道病毒感染现状与临床特征分析
目的 了解浙江省宁波市北仑区婴幼儿急性腹泻的临床特征及其胃肠道病毒的感染情况.方法 选择2012年7月至2013年7月在北仑区人民医院儿科门诊的900例急性腹泻婴幼儿病例(≤5岁),分析婴幼儿急性腹泻的临床特征并采集粪便样本,用PCR方法检测A/B/C型轮状病毒(Rotavirus,RV)、肠道腺病毒(Enteric adenovirus,AdV)、星状病毒(Astrovirus,AstV)、札如病毒(Sapovirus,SV)及诺如病毒(Norovirus,NV),并采用x2检验对不同性别和年龄段患者病毒检出情况进行比较.结果 900份腹泻患儿粪便样本中369份呈阳性结果,其中单一病毒感染的291份,混合病毒感染78份.在单一病毒感染病例的样本中,NV检出率为19.4％(GⅠ型为4.9％,GⅡ型14.6％),RV-A为8.2％,未检出B型及C型RV,SV为2.9％,AstV为1.0％,AdV为0.8％.在混合感染病例的样本中,以RV-A与NV混合感染多,为5.8％.2岁以下(含2岁)患儿的病毒总检出率(51.0％)显著高于＞2 ～5岁的患儿(22.1％,x2=70.404,P＜0.01).369例病毒检测阳性的患儿中,24.1％伴有发热,35.2％伴有呕吐症状.单一病毒感染病例发热、呕吐以及发热合并呕吐的发生率均低于混合感染病例(x2=17.878,21.869和14.155,P＜0.01).结论 NV和RV-A是浙江省宁波市北仑区婴幼儿急性腹泻的主要胃肠道病毒,2岁以下婴幼儿是这两种病毒的易感人群.
-
2012-2014年南通市感染性腹泻病毒学监测结果
目的 了解病毒对南通市感染性腹泻的影响及其流行规律,为制定病毒性腹泻防治措施提供基础资料.方法 采集哨点医院感染性腹泻患者的粪便标本,运用RT-PCR或PCR技术检测诺如病毒、轮状病毒、星状病毒、札如病毒和腺病毒核酸,利用Excel 2007及SPSS 19.0对资料进行统计和流行病学分析.结果 987份感染性腹泻样品中病毒核酸阳性样品为96份,总阳性率为9.73％,诺如病毒2型的阳性率高,为5.27％;其次为轮状病毒和星状病毒,分别为2.43％、1.14％;札如病毒、腺病毒和诺如病毒1型检测阳性率较低,分别为0.61％、0.41％和0.30％;混合感染的感染率为0.41％.病毒核酸阳性以诺如病毒2型和轮状病毒为主,分别占阳性总数的52.00％、24.00％.轮状病毒与诺如病毒感染出现的高峰皆为冬春季.结论 病毒是南通市感染性腹泻的重要因素之一,诺如病毒和轮状病毒是该地区病毒性腹泻的主要病原,流行季节以冬春季为主.
-
哈尔滨市2011年病毒性腹泻流行病学研究
病毒性腹泻是一组由多种病毒引起的急性肠道传染病,轮状病毒、杯状病毒(诺如病毒和札如病毒)、星状病毒和肠道腺病毒是主要病原.临床特点为起病急、恶心、呕吐、腹痛、腹泻,排水样便或稀便,伴有发热等全身不适症状.病死率不高,但发病率高,在全球感染性疾病中位居第三,全球每年约有2.5亿5岁以下儿童发生腹泻,其中200万死亡[1],是仅次于呼吸道疾病引起小儿死亡的重要原因.由于不同地区不同年份优势流行株有较大变异,为了解哈尔滨市病毒性腹泻流行病学特征和病原构成,2011年1-12月对哈尔滨市8家哨点医院收治的腹泻病例进行5种常见病毒的检测.
-
一步法多重荧光定量RT-PCR检测人杯状病毒的建立及应用
目的 建立检测人杯状病毒(human calieivirus,HuCVs,主要包括SV、NoV-G Ⅰ和NoV-GⅡ)的一步法多重荧光定量RT-PCR (rRT-PCR)法.方法 用Primer Express 3.0软件设计特异性引物和探针,通过合成的对应病毒基因的质粒来评价该方法的灵敏度、特异性和重复性,检测临床标本并对阳性结果进行基因测序验证.结果 建立的rRT-PCR法检测SV、NoV-G Ⅰ和NoV-GⅡ的灵敏度均达到103 copies/mL,特异性为100％,且变异系数(CV)均≤1.275％.HuCVs检出率为21.43％(75/350),其中SV、NoV-G Ⅰ和NoV-GⅡ分别为14.67％(11/75)、21.33％ (16/75)和64.00％(48/75).随机选择检测阳性结果进行测序,结果均与该法检测结果一致.结论 建立的rRT-PCR法可同时检测并区分SV、NoV-G Ⅰ和NoV-GⅡ病毒,可用于HuCVs引起的急性腹泻散发和暴发疫情的监测.
关键词： 人杯状病毒 札如病毒 诺如病毒 一步法多重荧光定量聚合酶链反应 -
南京地区人感染杯状病毒的病原学检测
目的 了解南京地区病毒性腹泻患者中杯状病毒的感染情况,明确该地区杯状病毒的主要基因型和分子进化特点.方法 收集南京市儿童医院疑似病毒性腹泻粪便标本155例,南京市某三甲医院成人腹泻标本8例,采用RT-PCR方法检测粪便中诺如病毒和札如病毒的多聚酶区核酸片段,并测序以明确基因型,对核苷酸序列使用CLUSTALW和phylip软件分析病毒的分子进化和亲缘关系.结果 婴幼儿的155例标本共检出15例杯状病毒阳性,检出率达到9.7%,成人检出5份阳性,与婴幼儿感染的诺如病毒核酸在多聚酶区未发现显著差异,均为GⅡ4型,与GENBANK上序列号为EU074213(苏州)、EU096514、EF200699 的毒株有较高的同源性;婴儿腹泻中有一例经核酸序列比对确认为札如病毒感染,为SGⅡ型,与GENBANK上序列号为AF439862的有94%的同源性.结论 杯状病毒是本地区病毒性腹泻的重要病原体,感染的该病毒以诺如病毒GⅡ4型为主,与近年多个地区发现的该病毒有较近的亲缘关系.南京地区存在札如病毒感染.
-
青岛地区2010年札如病毒感染流行病学及基因型分析
目的:了解青岛地区病毒性腹泻患者中札如病毒的感染情况,明确札如病毒的主要基因分型和分子进化特点.方法:收集青岛市青岛医学院附属医院散发疑似病毒性腹泻粪便标本94例,应用逆转录-聚合酶链反应对札如病毒进行检测.结果:检测到札如病毒2株,对其进一步进行系统进化分析,表明这2株札如病毒属于基因型GIV.结论:青岛地区存在札如病毒感染,并已查明其基因型.
-
无锡市病毒性腹泻流行的监测分析
目的 了解无锡市门诊就诊腹泻病例中主要腹泻病毒感染情况.方法 连续一年逐月采集无锡市腹泻监测哨点医院门诊腹泻病例的粪便样本,采用实时荧光PCR方法对收集的样本检测诺如病毒(NV)、轮状病毒(RV)、肠道腺病毒(EADV)、札如病毒(SPAV)和星状病毒(ASTV)的核酸,分析病原构成和季节分布变化.结果 291份腹泻样本中,共检出目标病毒核酸阳性79份,总检测阳性率为27.1％,阳性率由高到低依次为NV 15.5％、RV 8.2％、ASTV2.1％、SPAV 1.0％、EADV 0.3％.NV全年各月都有检出,其中GⅡ型占88.9％ (40/45),GⅠ型占11.1％ (5/45).这些病毒感染有明显的季节特征,基本表现为冬春季发病高峰的特征.结论 无锡地区冬春季节腹泻中病毒性感染值得重视,目前以NV和RV为主,同时,应加强监测优势型别的变化.
-
深圳散发腹泻患者札如病毒的检测及型别分析
目的 了解深圳地区札如病毒(sapovirus,SaV)的感染情况和流行病学特征.方法 采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法对收集的852份腹泻患者粪便标本进行SaV检测,PCR产物测序进行核苷酸序列比对构建系统发生树并进行同源性比较.结果 检出SaV阳性株16例,阳性率为1.88%.同源性比较发现8例为SaV GⅠ型,7例GIV型,1例GⅡ型.结论 深圳地区存在SaV感染,主要基因型为GⅠ型;首次报道中国存在SaV GIV型,与先前检出的安徽株A141和北京株CHN99/BJ360均不同,说明SaV感染在中国存在基因多样性,为进一步研究SaV感染情况提供了流行病学及基因型别基本资料.
