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Implementation of the FilmArray ME panel in laboratory routine using a simple sample selection strategy for diagnosis of meningitis and encephalitis

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Abstract:

Background Infectious meningitis is a serious disease and patient outcome relies on fast and reliable diagnostics. A syndromic panel testing approach like the FilmArray ME can accelerate diagnosis and therefore decrease the time to pathogen specific therapy. Yet, its clinical utility is controversial, mainly because of a remaining uncertainty in correct interpretation of results, limited data on its performance on clinical specimens and its relatively high costs. The aim of this study was to analyze clinical performance of the assay in a real life setting at a tertiary university hospital using a pragmatic and simple sample selection strategy to reduce the overall cost burden. Methods Over a period of 18 months we received 4623 CSF samples (2338 hospitalizations, 1601 individuals). FilmArray ME analysis was restricted to CSF-samples with a high pretest probability of infectious meningitis, e.g. positive Gram-stain, samples in which leukocytes and/or bacteria were evident or urgent suspicion of infection was communicated by clinicians. N = 171 samples matched to our risk criteria and were subjected to FilmArray ME analysis. Those samples were also analyzed by reference methods: culture only (n = 45), PCR only (n = 20) or both methods (n = 106). Results 56/171 (32.75%) were FilmArray ME positive. Bacterial pathogens were detected in 30/56 (53.57%), viral pathogens were detected in 27/56 (48.21%) and yeast DNA was detected in 1/56 (1.79%) of positive samples. Double detection occurred in 2/56 samples. In 52/56 (92.86%) FilmArray ME positive samples, results could be confirmed by the reference assays (sensitivity = 96.30%, specificity =96.58%). Conclusion The FilmArray ME assay is a fast and reliable diagnostic tool for the management of infectious meningitis and can easily be implemented in routine diagnostic workflows. However, correlation of test results and underlying clinical symptoms requires experienced users and the awareness of potentially false negative or false positive results. Moreover, considering the need for antimicrobial susceptibility testing, the use of molecular tests as a stand-alone diagnostic cannot be recommended.

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BMC INFECTIOUS DISEASES

BMC INFECT DIS
最新影响因子:3.667 期刊ISSN:1471-2334 CiteScore:2.86
出版周期:Irregular 是否OA:YES 出版年份:2001

期刊官方网址:http://www.biomedcentral.com/bmcinfectdis/

期刊投稿地址:https://www.editorialmanager.com/infd/default.aspx

自引率:4.70% 研究方向:医学-传染病学
出版地区:ENGLAND

SCI期刊coverage:Science Citation Index Expanded(科学引文索引扩展)

NCBI查询:PubMed Central (PMC)链接全文检索(pubmed central)

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BMC INFECTIOUS DISEASES 期刊简介

英文简介:

Published by BioMed Central. ISSN: 1471-2334. BMC Infectious Diseases publishes original research articles in all aspects of the prevention, diagnosis and management of infectious and sexually transmitted diseases, as well as related molecular genetics, pathophysiology, and epidemiology.

中文简介:(来自Google、百度翻译)

由生物医学中心出版。ISSN: 1471 - 2334。 BMC传染病在传染病和性传播疾病的预防、诊断和管理,以及相关的分子遗传学、病理生理学和流行病学的所有方面发表原创研究文章。

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SNIP:1.187
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BMC INFECTIOUS DISEASES 投稿经验

(由下方点评分析获得,15人参与,62301人阅读)

最新评论(不代表本站观点)

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    liting7111

    杂志审稿周期太长了,根不是讲的两到三周!
    2020-06-16
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    liting7111

    研究方向:免疫

    审稿时间: 6个月内 接受率: 比较困难(25%命中)

    审稿速度特别慢,投稿4个月要求大修,提了25个问题,修回后等了两个半月,提了7个问题,要求小修,不知道猴年马月才能接收,总之就是慢慢慢!
    2020-06-07
  • avatar

    liting7111

    投稿系统改版了?显示 Please note, this journal now uses Editorial Manager for submission and peer review. Therefore, until further notice any manuscripts submitted or reviewed through Editorial Manager will not be included in the display below. Please go to https://www.editorialmanager.com/infd to track and manage those manuscripts. 用之前的账户密码登录说无此用户,怎么办?
    2020-03-13
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    liting7111

    接受率: 一般容易(75%命中)

    投稿后两个审稿人审了半个月,返回给编辑花了10天,给了大修的意见,花了25天修回,10天后接收了,感觉还是挺快的,快慢全看审稿人。
    2020-03-02
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    liting7111

    投稿一个月都显示with editor,发邮件咨询后,状态改为under review。过了四个月还是这个状态,再次发邮件询问,又拖了一个月被退稿了,理由是找不到合适的审稿人
    2020-01-18
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    liting7111

    建议想投稿的,可以进入杂志官网,点击易发表的文章,在右侧找到pre-publication,可以找到改文章各个升高细节和时间。审稿基本都是一身意见要三个月才能回复,半年才能发表。
    2020-01-08
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    liting7111

    催了两次稿,第一次回复在于编辑沟通,之后没有回复了。第二次再次催稿,直接没回复了。速度太慢!
    2019-11-22
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    liting7111

    为什么啊!我在4月14日投的,两天后under review,今天显示decision making,看来是要被拒的节奏啊。
    2019-09-27
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    liting7111

    研究方向:感染

    审稿时间: 3个月内 接受率: 中等(50%命中)

    投稿终于被接受了,编辑处理稿件很细致,从刚接收到后面的修改格式,付版面费恨不得再折腾几次,只能说老外严谨起来,程度令人咋舌。
    2019-08-04
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    liting7111

    研究方向:肝病 免疫

    审稿时间: 2个月内 接受率: 中等(50%命中)

    投稿后在编辑部待了两个星期,之后审稿一个月被拒了,其中一个审稿人提了很多细节修改的问题,另外一个直接拒了,第一次投稿感觉还是经验欠缺,有很多不足,不过重在改进,大家加油呀~
    2019-07-10
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    liting7111

    这种杂志不要投!去年8月投稿,今年8月返修,要求大修,修回返回二修意见,要求再修。修个毛,等了这么久,果断撤稿了。
    2019-07-09
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    liting7111

    研究方向:感染与免疫

    投稿过去快两个月了,还卡在initial assessment,不知道哪年才有结果。
    2019-06-09
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    liting7111

    研究方向:肺损伤 缺血缺氧脑病

    审稿时间: 2个月内 接受率: 一般容易(75%命中)

    希望审稿速度能快点!
    2019-05-02
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    liting7111

    5月份投的稿,中间因为格式问题修改过一次,三个月一直是under review,拖到九月份受不了了发了一封催稿信,之后状态显示为reject,一直未在收到邮件了。
    2019-03-20
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    liting7111

    审稿时间: 3个月内 接受率: 中等(50%命中)

    投过一次,说说我的经验,杂志审稿很慢,我的一片在12年7月投稿,第一次修回在13年2月,发表则在5月,希望能帮助到大家。
    2019-02-23

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Korean Journal of Medical Mycology 0.26 第13百分位
#231
Clinical Epidemiology and Global Health 0.25 第12百分位
#232
Medecine et sante tropicales 0.25 第12百分位
#233
Molecular Genetics, Microbiology and Virology 0.25 第12百分位
#234
Jurnal Infektologii 0.24 第12百分位
#235
Infectious Diseases in Clinical Practice 0.22 第11百分位
#236
Kekkaku 0.22 第11百分位
#237
Voprosy Virusologii 0.22 第11百分位
#238
Antibiotiki i Khimioterapiya 0.21 第10百分位
#239
Chinese Journal of Schistosomiasis Control 0.21 第10百分位
#240
Journal of Communicable Diseases 0.21 第10百分位
#241
Malaysian Journal of Microbiology 0.21 第10百分位
#242
Revista Cubana de Medicina Tropical 0.20 第9百分位
#243
HIV and AIDS Review 0.19 第8百分位
#244
Klimik Dergisi 0.18 第8百分位
#245
Pediatric Infection and Vaccine 0.16 第8百分位
#246
Boletin de Malariologia y Salud Ambiental 0.15 第7百分位
#247
Ethiopian Journal of Health Development 0.15 第7百分位
#248
Turk hijiyen ve deneysel biyoloji dergisi. Turkish bulletin of hygiene and experimental biology 0.15 第7百分位
#249
Enfermedades Infecciosas y Microbiologia 0.12 第6百分位
#250
Journal of International Peacekeeping 0.10 第6百分位
#251
Infektsionnye Bolezni 0.07 第5百分位
#252
Journal Africain d'Hepato-Gastroenterologie 0.07 第5百分位
#253
Journal des Anti-Infectieux 0.07 第5百分位
#254
Chinese Journal of Infection and Chemotherapy 0.06 第4百分位
#255
Vacunas 0.06 第4百分位
#256
Forum for Nordic Dermato-Venerology 0.05 第3百分位
#257
Kasmera 0.05 第3百分位
#258
Japanese Journal of Leprosy 0.04 第2百分位
#259
Vakcinologie 0.04 第2百分位
#260
Virologie 0.04 第2百分位
#261
Cocuk Enfeksiyon Dergisi 0.03 第2百分位
#262
Hygiene + Medizin 0.02 第1百分位
#263
Infektoloski Glasnik 0.02 第1百分位
#264
Nederlands Tijdschrift voor Dermatologie en Venereologie 0.01 第0百分位
#265
Hospital Infection Control and Prevention 0.00 第0百分位
#266
Krankenhaushygiene und Infektionsverhutung 0.00 第0百分位

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