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AstroDot: a new method for studying the spatial distribution of mRNA in astrocytes.

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Abstract:

:Astrocytes are morphologically complex and use local translation to regulate distal functions. To study the distribution of mRNA in astrocytes, we combined mRNA detection via in situ hybridization with immunostaining of the astrocyte-specific intermediate filament glial fibrillary acidic protein (GFAP). mRNAs at the level of GFAP-immunolabelled astrocyte somata, large and fine processes were analyzed using AstroDot, an ImageJ plug-in and the R package AstroStat. Taking the characterization of mRNAs encoding GFAP α and δ isoforms as a proof of concept, we showed that they mainly localized on GFAP processes. In the APPswe/PS1dE9 mouse model of Alzheimer's disease, Gfap α and δ mRNA density and distribution changed as a function of the region of the hippocampus and the astrocyte's proximity to amyloid plaques. To validate our method, we confirmed that the ubiquitous Rpl4 (large subunit ribosomal protein 4) mRNA was present in astrocyte processes as well as in microglia processes immunolabelled for ionized calcium binding adaptor molecule 1 (Iba1). In summary, this novel set of tools allows to characterize mRNA distribution in astrocytes and microglia in physiological or pathological settings.

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JOURNAL OF CELL SCIENCE

J CELL SCI
最新影响因子:5.235 期刊ISSN:0021-9533 CiteScore:4.23
出版周期:Semimonthly 是否OA:YES 出版年份:1966

期刊官方网址:http://jcs.biologists.org/

期刊投稿地址:http://jcs.biologists.org/content/submit-manuscript

自引率:3.80% 研究方向:生物-细胞生物学
出版地区:ENGLAND

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JOURNAL OF CELL SCIENCE 期刊简介

英文简介:

Journal of Cell Science is an international peer-reviewed journal in the field of cell biology that is published by The Company of Biologists, a not-for-profit charitable organisation run by biologists for the benefit of the biological community. Journal of Cell Science is committed to publishing the full range of topics in cell biology, and the single most important criterion for acceptance is scientific excellence. Articles must therefore pose and test a significant hypothesis that will provide novel perspectives and approaches to understanding cell biology, and will stimulate the interest of the broad readership of the journal (see aims and scope). All research articles published in Journal of Cell Science are subject to rigorous single-blind peer review, and editorial decisions are made by a team of research-active academics in the field, supported by an international Editorial Advisory Board. In addition to primary research articles, Journal of Cell Science publishes a range of commissioned review-based articles aimed at synthesising the latest advances in the field, putting forward new hypotheses to provoke debate and inspire new research directions, and educating newcomers to the field. For more information on publishing in Journal of Cell Science, please visit our submission, manuscript preparation, article types and journal policies pages. Journal of Cell Science offers advance posting of accepted author manuscripts on its Accepted manuscripts page, which is updated daily. Publication of the final version of record is by a continuous publication model - as soon as an article is ready to be published, it is immediately released online rather than waiting for other articles in the issue to be completed, resulting in faster access to the final version of the article. Journal of Cell Science [ISSN 1477-9137 (online); ISSN 0021-09533 (print)] is a continuation of The Quarterly Journal of Microscopical Science (ISSN 0370-2952).

中文简介:(来自Google、百度翻译)

《细胞科学杂志》是由生物学家公司出版的细胞生物学领域的国际同行评议期刊。生物学家公司是一个非盈利慈善组织,由生物学家经营,旨在造福生物群落。《细胞科学杂志》致力于出版细胞生物学领域的所有主题,而唯一最重要的接受标准是科学的卓越性。因此,文章必须提出并检验一个重要的假设,该假设将为理解细胞生物学提供新的视角和方法,并将激发期刊广大读者的兴趣。 发表在《细胞科学杂志》上的所有研究论文都要经过严格的单盲同行评审,编辑决策由该领域的研究活跃学者组成的团队做出,并得到一个国际编辑顾问委员会的支持。除了主要的研究文章,《细胞科学杂志》还发表了一系列委托评审的文章,旨在综合该领域的最新进展,提出新的假设,以引发辩论和启发新的研究方向,并教育该领域的新来者。有关细胞科学杂志发表的更多信息,请访问我们的提交,手稿准备,文章类型和期刊政策页面。 《细胞科学杂志》在其“已被接受的原稿”页面上提供了已被接受的作者原稿的预贴,该页面每天都会更新。最终版本的出版记录是由一个连续出版模式——尽快准备发表一篇文章,它是立即释放而不是等待其他文章在网上完成,导致更快的访问文章的最终版本。 细胞科学杂志[ISSN 1477-9137(在线);是《显微科学季刊》(ISSN 0370-2952)的续刊。

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