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Effect of CTerm of Human albumin on the aggregation propensity of Aβ1-42 peptide: A Potential of mean force study.

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Abstract:

:Alzheimer's disease (AD) is the most common progressive neurodegenerative brain disorder. It is characterized by the presence of extracellular aggregated fibrillary form of amyloid-beta (Aβ) peptide and intraneuronal neurofibrillary tangles caused by the hyperphosphorylation of tau protein. Monomeric form of Aβ-peptide in α-conformation is not toxic but it can undergo self aggregation to form β-conformation which is neurotoxic. The most promising approach to combat AD is to prevent the self aggregation of Aβ-peptide. Recently, it has been reported that C-terminal (CTerm) of Human albumin (HA) binds to the Aβ1-42 peptide and impairs the Aβ1-42 aggregation and promote disassembly of Aβ1-42 aggregates. In this work, using Potential of mean force (PMF) and binding free energy (BFE) calculations, we have demonstrated the effect of CTerm of HA on the dimerization of Aβ1-42 peptide. From the PMF profile, we noticed Aβ1-42-CTerm Heterodimer (10.99 kcal mol-1) complex to have higher disassociation energy than Aβ1-42-Aβ1-42 Homodimer (2.23 kcal mol-1) complex. And also from the BFE calculations, we found that the binding affinity between Aβ1-42 peptide and CTerm (ΔGbind = -32.27 kcal mol-1 from MM-GBSA and ΔGbind = -2.83 kcal mol-1from MM-PBSA) to be stronger than the Aβ1-42 peptide and another Aβ1-42 peptide (ΔGbind = -16.20 kcal mol-1 from MM-GBSA and ΔGbind = -1.95 kcal mol-1 from MM-PBSA). In this study, our findings from PMF and BFE analysis of the two complexes, provides salient structural, binding and unbinding features and thermodynamics that support the ability of CTerm of HA in affecting the dimerization of Aβ1-42.

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JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS

J BIOMOL STRUCT DYN
最新影响因子:5.235 期刊ISSN:0739-1102 CiteScore:2.28
出版周期:Bimonthly 是否OA:YES 出版年份:0

期刊官方网址:http://www.jbsdonline.com/Issue-August-2011-c4311.html

期刊投稿地址:http://www.jbsdonline.com/instructions-c4292.html

自引率:28.50% 研究方向:生物-生化与分子生物学
出版地区:UNITED STATES

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JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS 期刊简介

英文简介:

The Journal of Biomolecular Structure and Dynamics welcomes manuscripts on biological structure, dynamics, interactions and expression. The Journal is one of the leading publications in high end computational science, atomic structural biology, bioinformatics, virtual drug design, genomics and biological networks. The Journal publishes original articles and timely reviews. If an author wishes to write a review, please obtain clearance from any one of the Editors. Peer Review Statement The Journal of Biomolecular Structure and Dynamics is an international, peer-reviewed journal which publishes high quality, original research contributions to scientific knowledge. All manuscript submissions are subject to initial appraisal by the Editor-in-Chief, and, if found suitable for further consideration, to peer review by independent, anonymous expert referees. All peer review is single blind and submission is online via Scholar One Manuscripts.

中文简介:(来自Google、百度翻译)

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Research in Microbiology 2.11 第36百分位
#235
Journal of Peptide Science 2.10 第35百分位
#236
Protein Engineering, Design and Selection 2.10 第35百分位
#237
Molecular and Biochemical Parasitology 2.09 第35百分位
#238
Sub-Cellular Biochemistry 2.09 第35百分位
#239
Biomedical Microdevices 2.07 第34百分位
#240
Connective Tissue Research 2.06 第34百分位
#241
Journal of Molecular Recognition 2.05 第34百分位
#242
Applied Biochemistry and Biotechnology 2.02 第33百分位
#243
Plant Molecular Biology Reporter 2.02 第33百分位
#244
Histochemistry and Cell Biology 2.01 第33百分位
#245
International Journal of Experimental Pathology 2.01 第33百分位
#246
Proteome Science 2.01 第33百分位
#247
Biochemistry and Cell Biology 2.00 第32百分位
#248
Current Chemical Genomics and Translational Medicine 2.00 第32百分位
#249
Current Gene Therapy 2.00 第32百分位
#250
Molecular Medicine Reports 1.99 第31百分位
#251
Critical Reviews in Eukaryotic Gene Expression 1.96 第31百分位
#252
Methods in Enzymology 1.96 第31百分位
#253
Journal of Microbiological Methods 1.95 第30百分位
#254
Toxicologic Pathology 1.95 第30百分位
#255
Comparative Biochemistry and Physiology - B Biochemistry and Molecular Biology 1.93 第30百分位
#256
Enzymes 1.93 第30百分位
#257
Algorithms for Molecular Biology 1.92 第29百分位
#258
Journal of Biochemical and Molecular Toxicology 1.92 第29百分位
#259
Plasmid 1.92 第29百分位
#260
Clinical Research in Cardiology Supplements 1.91 第28百分位
#261
Journal of Molecular Evolution 1.91 第28百分位
#262
Molecular and Cellular Pharmacology 1.90 第28百分位
#263
Journal of Cell Communication and Signaling 1.88 第28百分位
#264
Antonie van Leeuwenhoek 1.87 第28百分位
#265
BioData Mining 1.81 第27百分位
#266
Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology 1.81 第27百分位
#267
FEMS Microbiology Letters 1.80 第27百分位
#268
Molecular Biology Reports 1.80 第27百分位
#269
International Journal of Proteomics 1.75 第26百分位
#270
Molecular Biotechnology 1.75 第26百分位
#271
Reproduction, Fertility and Development 1.75 第26百分位
#272
Archives of Microbiology 1.74 第25百分位
#273
Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology 1.72 第25百分位
#274
Experimental Lung Research 1.71 第25百分位
#275
Applied and Translational Genomics 1.70 第25百分位
#276
Biotechnology and Genetic Engineering Reviews 1.69 第24百分位
#277
Journal of Gene Medicine 1.69 第24百分位
#278
Genetics and Molecular Biology 1.67 第24百分位
#279
Chemistry and Biodiversity 1.66 第23百分位
#280
Biomedical Chromatography 1.65 第23百分位
#281
Journal of Molecular Signaling 1.65 第23百分位
#282
Virus Genes 1.65 第23百分位
#283
Biochemical Genetics 1.63 第22百分位
#284
Gene Expression Patterns 1.61 第22百分位
#285
Molecular and Cellular Probes 1.61 第22百分位
#286
Pathobiology 1.61 第22百分位
#287
Blood Cells, Molecules, and Diseases 1.59 第21百分位
#288
Indian Journal of Experimental Biology 1.57 第21百分位
#289
Molecular Physics 1.55 第21百分位
#290
Physical Biology 1.54 第20百分位
#291
BMC Biochemistry 1.53 第20百分位
#292
Genome 1.53 第20百分位
#293
Journal of Receptor and Signal Transduction Research 1.53 第20百分位
#294
Canadian Journal of Microbiology 1.52 第19百分位
#295
Cellular and Molecular Biology Letters 1.52 第19百分位
#296
Cytogenetic and Genome Research 1.51 第19百分位
#297
Physiology and Molecular Biology of Plants 1.51 第19百分位
#298
BMC Hematology 1.47 第18百分位
#299
Journal of Nucleic Acids 1.46 第18百分位
#300
Cellular and Molecular Biology 1.40 第18百分位
#301
Journal of Experimental Zoology Part A: Ecological Genetics and Physiology 1.33 第17百分位
#302
Magnesium Research 1.30 第17百分位
#303
Journal of Solution Chemistry 1.29 第17百分位
#304
Journal of Stem Cells and Regenerative Medicine 1.29 第17百分位
#305
Bioscience, Biotechnology and Biochemistry 1.26 第16百分位
#306
Journal of Biomolecular Techniques 1.25 第16百分位
#307
Folia Biologica 1.23 第15百分位
#308
Medical Molecular Morphology 1.23 第15百分位
#309
Molecular Cytogenetics 1.23 第15百分位
#310
Synergy 1.22 第15百分位
#311
Journal of Computational Biology 1.16 第15百分位
#312
Molecular Genetics and Metabolism Reports 1.12 第14百分位
#313
New Negatives in Plant Science 1.09 第14百分位
#314
AIMS Biophysics 1.07 第14百分位
#315
Journal of Biological Physics 1.06 第14百分位
#316
Genome Announcements 1.01 第13百分位
#317
Canadian Entomologist 0.96 第13百分位
#318
Methods in Molecular Biology 0.96 第13百分位
#319
International Journal of Immunogenetics 0.95 第12百分位
#320
Genetics and Molecular Research 0.94 第12百分位
#321
Biochemistry and Biophysics Reports 0.93 第12百分位
#322
Biochemistry and Molecular Biology Education 0.92 第12百分位
#323
Plant Cell Monographs 0.90 第11百分位
#324
Journal of Bioinformatics and Computational Biology 0.89 第11百分位
#325
Genes and Genetic Systems 0.87 第11百分位
#326
Biologia (Poland) 0.86 第10百分位
#327
IET Systems Biology 0.86 第10百分位
#328
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology 0.86 第10百分位
#329
Turkish Journal of Biology 0.85 第10百分位
#330
Annals of Clinical and Laboratory Science 0.84 第9百分位
#331
MCB Molecular and Cellular Biomechanics 0.83 第9百分位
#332
International Journal of Molecular and Cellular Medicine 0.80 第9百分位
#333
Journal of Investigative Dermatology Symposium Proceedings 0.69 第9百分位
#334
Recent advances in DNA 0.69 第9百分位
#335
Biodiversitas 0.66 第8百分位
#336
Stem Cell Investigation 0.65 第8百分位
#337
Genes and Genomics 0.64 第8百分位
#338
Current Chemical Biology 0.60 第7百分位
#339
Current Bioinformatics 0.55 第7百分位
#340
Current Proteomics 0.54 第7百分位
#341
Genomics Insights 0.50 第6百分位
#342
Fisheries and Aquatic Sciences 0.48 第6百分位
#343
Nucleus (India) 0.40 第6百分位
#344
Genome Integrity 0.38 第6百分位
#345
Current Bladder Dysfunction Reports 0.36 第5百分位
#346
Journal of Integrated OMICS 0.33 第5百分位
#347
Mitochondrial DNA Part B: Resources 0.30 第5百分位
#348
Current Topics in Peptide and Protein Research 0.25 第4百分位
#349
Mitochondrial DNA Part A: DNA Mapping, Sequencing, and Analysis 0.25 第4百分位
#350
Molecular Genetics, Microbiology and Virology 0.25 第4百分位
#351
Turkish Journal of Biochemistry 0.25 第4百分位
#352
Biologicheskie Membrany 0.23 第3百分位
#353
Asia-Pacific Journal of Molecular Biology and Biotechnology 0.22 第3百分位
#354
Current Issues in Pharmacy and Medical Sciences 0.22 第3百分位
#355
Genes and Cells 0.21 第3百分位
#356
Journal of Sichuan University (Medical Science Edition) 0.21 第3百分位
#357
In Silico Biology 0.20 第2百分位
#358
Journal of Biological Macromolecules 0.14 第2百分位
#359
Analele Universitatii din Oradea, Fascicula Biologie 0.13 第1百分位
#360
Anales de la Real Academia Nacional de Farmacia 0.13 第1百分位
#361
Current Pharmacogenomics and Personalized Medicine 0.11 第1百分位
#362
Malaysian Journal of Biochemistry and Molecular Biology 0.10 第1百分位
#363
Annals of the Romanian Society for Cell Biology 0.09 第0百分位
#364
BioSpektrum 0.05 第0百分位
#365
Journal of Cellular Neuroscience and Oxidative Stress 0.00 第0百分位
#366
Proteomics - Practical Proteomics 0.00 第0百分位

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