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Codon optimization is an essential parameter for the efficient allotopic expression of mtDNA genes.

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Abstract:

:Mutations in mitochondrial DNA can be inherited or occur de novo leading to several debilitating myopathies with no curative option and few or no effective treatments. Allotopic expression of recoded mitochondrial genes from the nucleus has potential as a gene therapy strategy for such conditions, however progress in this field has been hampered by technical challenges. Here we employed codon optimization as a tool to re-engineer the protein-coding genes of the human mitochondrial genome for robust, efficient expression from the nucleus. All 13 codon-optimized constructs exhibited substantially higher protein expression than minimally-recoded genes when expressed transiently, and steady-state mRNA levels for optimized gene constructs were 5-180 fold enriched over recoded versions in stably-selected wildtype cells. Eight of thirteen mitochondria-encoded oxidative phosphorylation (OxPhos) proteins maintained protein expression following stable selection, with mitochondrial localization of expression products. We also assessed the utility of this strategy in rescuing mitochondrial disease cell models and found the rescue capacity of allotopic expression constructs to be gene specific. Allotopic expression of codon optimized ATP8 in disease models could restore protein levels and respiratory function, however, rescue of the pathogenic phenotype for another gene, ND1 was only partially successful. These results imply that though codon-optimization alone is not sufficient for functional allotopic expression of most mitochondrial genes, it is an essential consideration in their design.

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Redox Biology

REDOX BIOL
最新影响因子:9.986 期刊ISSN:2213-2317 CiteScore:6.86
出版周期: 是否OA:YES 出版年份:0

期刊官方网址:http://www.journals.elsevier.com/redox-biology/

期刊投稿地址:http://www.evise.com/evise/faces/pages/navigation/NavController.jspx?JRNL_ACR=REDOX

自引率:6.60% 研究方向:BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY-
出版地区:NETHERLANDS

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Redox Biology 期刊简介

英文简介:

Redox Biology is a forum for novel research, methods and review articles in redox biology in the areas of both health and disease. Acceptable paper types are research articles (short or full communications), methods, mini-reviews, and commentaries in the following areas: Nutrition Polyphenolics Cancer Metabolism Cardiovascular Diabetes Inflammation Aging Neuroscience Cell and Molecular Biology Cell Signaling Bioenergetics Redox Biology will also consider research articles focused in chemical or biochemical mechanisms of redox biology, if these include data demonstrating effects in physiologically relevant models. Studies of uncharacterized complex mixtures of natural products are not a suitable area of focus for the journal. Studies using commercial, undefined kits as the sole or primary assay for redox related changes which are not validated using other methods will not be considered for publication. Redox Biology introduces Graphical Redox Reviews. These reviews will summarize schematically key concepts, established and novel ideas in redox biology which will be accessible to a broad audience and freely downloaded as PowerPoint slides for use in teaching or conference presentations. Graphical Redox Reviews ideally should have a format of 3-5 color schemes with a title, short introductory paragraph, extended figure legends, and include up to 20 selected citations.

中文简介:(来自Google、百度翻译)

氧化还原生物学是一个论坛的新研究,方法和评论文章在氧化还原生物学领域的健康和疾病。可接受的论文类型包括研究文章(短或完整的交流)、方法、小综述和以下领域的评论: 营养 多酚 癌症 新陈代谢 心血管 糖尿病 炎症 老化 神经科学 细胞与分子生物学 细胞信号传导 生物能学 氧化还原生物学也将考虑关注氧化还原生物学的化学或生物化学机制的研究文章,如果这些包括在生理学相关模型中显示效果的数据。对未鉴定的天然产物的复杂混合物的研究不适合作为该杂志的研究重点。使用商业的、未定义的试剂盒作为氧化还原相关变化的唯一或主要检测方法的研究,如果没有使用其他方法进行验证,将不考虑发表。 氧化还原生物学介绍图形氧化还原综述。这些综述将概要地总结氧化还原生物学中的关键概念、已建立的和新颖的概念,这些概念将向广大观众开放,并可免费下载为PowerPoint幻灯片,用于教学或会议演示。 理想情况下,图形化的Redox评审应该采用3-5种配色方案的格式,包括标题、简短的介绍性段落、扩展的图形图例,并包含最多20个选定的引用。

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Journal of Nucleic Acids 1.46 第29百分位
#285
International Journal of Chemical Kinetics 1.43 第29百分位
#286
Cellular and Molecular Biology 1.40 第28百分位
#287
Journal of Cluster Science 1.40 第28百分位
#288
Archives of Insect Biochemistry and Physiology 1.38 第28百分位
#289
Chromatographia 1.38 第28百分位
#290
International Journal of Peptides 1.36 第27百分位
#291
Journal of Labelled Compounds and Radiopharmaceuticals 1.35 第27百分位
#292
Chemical and Biochemical Engineering Quarterly 1.34 第27百分位
#293
Journal of Integrative Agriculture 1.30 第27百分位
#294
Magnesium Research 1.30 第27百分位
#295
Journal of Solution Chemistry 1.29 第26百分位
#296
Journal of Stem Cells and Regenerative Medicine 1.29 第26百分位
#297
Preparative Biochemistry and Biotechnology 1.28 第26百分位
#298
Bioscience, Biotechnology and Biochemistry 1.26 第25百分位
#299
Fluoride - Quarterly Reports 1.26 第25百分位
#300
Journal of International Medical Research 1.26 第25百分位
#301
Current Protocols in Protein Science 1.25 第25百分位
#302
Folia Biologica 1.23 第24百分位
#303
Molecular Cytogenetics 1.23 第24百分位
#304
Analytical Letters 1.21 第24百分位
#305
Protein Journal 1.19 第24百分位
#306
Chemical Papers 1.14 第24百分位
#307
Helvetica Chimica Acta 1.12 第23百分位
#308
Cell Health and Cytoskeleton 1.10 第23百分位
#309
Genomics Data 1.09 第23百分位
#310
New Negatives in Plant Science 1.09 第23百分位
#311
International Journal of Peptide Research and Therapeutics 1.08 第22百分位
#312
Journal of Huazhong University of Science and Technology - Medical Science 1.08 第22百分位
#313
AIMS Biophysics 1.07 第22百分位
#314
Protein and Peptide Letters 1.07 第22百分位
#315
Journal of Structural and Functional Genomics 1.04 第21百分位
#316
Biochemical Systematics and Ecology 1.01 第21百分位
#317
International Journal of Medicinal Chemistry 1.00 第21百分位
#318
Virology Reports 1.00 第21百分位
#319
Acta Histochemica et Cytochemica 0.99 第20百分位
#320
Biochimie Open 0.96 第20百分位
#321
Current Protocols in Cytometry 0.96 第20百分位
#322
Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids 0.94 第20百分位
#323
Acta Crystallographica Section F:Structural Biology Communications 0.93 第19百分位
#324
Analytical Chemistry Insights 0.93 第19百分位
#325
Biochemistry and Biophysics Reports 0.93 第19百分位
#326
Biochemistry and Molecular Biology Education 0.92 第19百分位
#327
OCL - Oilseeds and fats, Crops and Lipids 0.90 第18百分位
#328
Journal of Bioinformatics and Computational Biology 0.89 第18百分位
#329
Carbohydrate Chemistry 0.87 第18百分位
#330
Indian Journal of Biochemistry and Biophysics 0.87 第18百分位
#331
Biocatalysis and Biotransformation 0.86 第17百分位
#332
Biologia (Poland) 0.86 第17百分位
#333
Journal of Carbohydrate Chemistry 0.86 第17百分位
#334
Advances in Biomembranes and Lipid Self-Assembly 0.85 第17百分位
#335
Annual Reports in Medicinal Chemistry 0.82 第16百分位
#336
Journal of Liquid Chromatography and Related Technologies 0.81 第16百分位
#337
International Journal of Molecular and Cellular Medicine 0.80 第16百分位
#338
Phosphorus, Sulfur and Silicon and the Related Elements 0.74 第15百分位
#339
Russian Journal of Bioorganic Chemistry 0.74 第15百分位
#340
Amino Acids, Peptides and Proteins 0.71 第15百分位
#341
Current Pharmaceutical Analysis 0.70 第15百分位
#342
Journal of Essential Oil-Bearing Plants 0.70 第15百分位
#343
Planta Daninha 0.70 第15百分位
#344
Applied Biochemistry and Microbiology 0.69 第14百分位
#345
Rasayan Journal of Chemistry 0.65 第14百分位
#346
Genes and Genomics 0.64 第14百分位
#347
Journal of Hard Tissue Biology 0.62 第13百分位
#348
Journal of Receptor, Ligand and Channel Research 0.62 第13百分位
#349
Oriental Journal of Chemistry 0.61 第13百分位
#350
Current Chemical Biology 0.60 第12百分位
#351
Doklady Biochemistry and Biophysics 0.60 第12百分位
#352
Current Enzyme Inhibition 0.59 第12百分位
#353
Artificial DNA: PNA and XNA 0.58 第12百分位
#354
Progress on Chemistry and Application of Chitin and its Derivatives 0.58 第12百分位
#355
International Journal Bioautomation 0.56 第11百分位
#356
Journal of Planar Chromatography - Modern TLC 0.56 第11百分位
#357
Current Bioinformatics 0.55 第11百分位
#358
Analytical and Bioanalytical Chemistry Research 0.54 第10百分位
#359
Chinese Journal of Chromatography (Se Pu) 0.54 第10百分位
#360
Current Proteomics 0.54 第10百分位
#361
Pteridines 0.53 第10百分位
#362
Letters in Organic Chemistry 0.52 第10百分位
#363
Genomics Insights 0.50 第9百分位
#364
Journal of Lipids 0.50 第9百分位
#365
Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry 0.49 第9百分位
#366
Iranian Journal of Biotechnology 0.49 第9百分位
#367
Fisheries and Aquatic Sciences 0.48 第8百分位
#368
Comparative Exercise Physiology 0.45 第8百分位
#369
Ukrainian biochemical journal 0.44 第8百分位
#370
Biochemistry (Moscow) Supplement Series A: Membrane and Cell Biology 0.43 第7百分位
#371
Biomolecular NMR Assignments 0.43 第7百分位
#372
American Journal of Biochemistry and Biotechnology 0.42 第7百分位
#373
eMagRes 0.42 第7百分位
#374
Organophosphorus Chemistry 0.40 第6百分位
#375
RSC Green Chemistry 0.40 第6百分位
#376
Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry 0.39 第6百分位
#377
Chem-Bio Informatics Journal 0.38 第6百分位
#378
Current Bladder Dysfunction Reports 0.36 第5百分位
#379
Open Biotechnology Journal 0.36 第5百分位
#380
Phyton 0.36 第5百分位
#381
Journal of Integrated OMICS 0.33 第5百分位
#382
Progress in Biochemistry and Biophysics 0.30 第5百分位
#383
Nuclear Magnetic Resonance 0.27 第4百分位
#384
Current Topics in Peptide and Protein Research 0.25 第4百分位
#385
MolBank 0.25 第4百分位
#386
Turkish Journal of Biochemistry 0.25 第4百分位
#387
Current Issues in Pharmacy and Medical Sciences 0.22 第3百分位
#388
Trends in Glycoscience and Glycotechnology 0.21 第3百分位
#389
Research Journal of Chemistry and Environment 0.20 第3百分位
#390
Synthesis Lectures on Biomedical Engineering 0.20 第3百分位
#391
RSC Soft Matter 0.19 第2百分位
#392
Forum on Immunopathological Diseases and Therapeutics 0.18 第2百分位
#393
Botulinum Journal 0.17 第2百分位
#394
European Pharmaceutical Review 0.12 第2百分位
#395
Malaysian Journal of Biochemistry and Molecular Biology 0.10 第1百分位
#396
Chinese Journal of Biologicals 0.09 第1百分位
#397
Indian Journal of Agricultural Biochemistry 0.09 第1百分位
#398
Journal of Health Research 0.04 第1百分位
#399
Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society 0.04 第1百分位
#400
Biochemical and Cellular Archives 0.03 第0百分位
#401
Journal of Cellular Neuroscience and Oxidative Stress 0.00 第0百分位
#402
Proteomics - Practical Proteomics 0.00 第0百分位
aaa
#4 169
Redox Biology 6.86 第97百分位
排名
来源出版物名称 CiteScore2017 百分位
#1
Progress in Polymer Science 24.94 第99百分位
#2
Journal of Photochemistry and Photobiology C: Photochemistry Reviews 14.29 第99百分位
#3
Natural Product Reports 9.84 第98百分位
#4
Redox Biology 6.86 第97百分位
#5
Organic Letters 6.16 第97百分位
#6
ACS Macro Letters 6.03 第96百分位
#7
Macromolecules 5.86 第96百分位
#8
Carbohydrate Polymers 5.58 第95百分位
#9
Fuel 5.40 第94百分位
#10
Advanced Synthesis and Catalysis 5.01 第94百分位
#11
Polymer Chemistry 4.98 第93百分位
#12
Chemistry - A European Journal 4.97 第93百分位
#13
Organic Chemistry Frontiers 4.85 第92百分位
#14
International Journal of Nanomedicine 4.80 第92百分位
#15
European Journal of Medicinal Chemistry 4.63 第91百分位
#16
Journal of Organic Chemistry 4.55 第90百分位
#17
ChemCatChem 4.47 第90百分位
#18
Bioconjugate Chemistry 4.40 第89百分位
#19
Advances in Organometallic Chemistry 4.27 第89百分位
#20
Macromolecular Rapid Communications 4.08 第88百分位
#21
International Journal of Molecular Sciences 3.90 第87百分位
#22
Journal of Chromatography A 3.81 第86百分位
#23
Journal of Natural Products 3.81 第86百分位
#24
European Polymer Journal 3.75 第85百分位
#25
Organometallics 3.75 第85百分位
#26
Bioorganic Chemistry 3.68 第84百分位
#27
Polymer 3.64 第84百分位
#28
Chemistry - An Asian Journal 3.54 第83百分位
#29
ACS Medicinal Chemistry Letters 3.47 第83百分位
#30
Organic and Biomolecular Chemistry 3.32 第82百分位
#31
Bioactive Carbohydrates and Dietary Fibre 3.30 第81百分位
#32
Pharmaceutical Research 3.30 第81百分位
#33
Molecules 3.29 第80百分位
#34
Advances in Heterocyclic Chemistry 3.14 第80百分位
#35
Current Medicinal Chemistry 3.10 第79百分位
#36
Chemistry and Physics of Lipids 3.06 第78百分位
#37
Progress in Organic Coatings 3.05 第78百分位
#38
ChemMedChem 2.98 第77百分位
#39
Organic Process Research and Development 2.95 第77百分位
#40
Amino Acids 2.94 第76百分位
#41
Express Polymer Letters 2.92 第76百分位
#42
Bioorganic and Medicinal Chemistry 2.90 第75百分位
#43
Topics in Organometallic Chemistry 2.86 第74百分位
#44
Journal of Chemical Technology and Biotechnology 2.73 第74百分位
#45
Macromolecular Materials and Engineering 2.71 第73百分位
#46
Advances in Polymer Science 2.68 第73百分位
#47
European Journal of Organic Chemistry 2.65 第72百分位
#48
ChemBioChem 2.64 第71百分位
#49
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters 2.53 第71百分位
#50
Steroids 2.53 第71百分位
#51
Journal of Polymer Science, Part A: Polymer Chemistry 2.45 第70百分位
#52
Polymer Testing 2.42 第69百分位
#53
Advances in Carbohydrate Chemistry and Biochemistry 2.39 第68百分位
#54
Macromolecular Chemistry and Physics 2.39 第68百分位
#55
Beilstein Journal of Organic Chemistry 2.38 第67百分位
#56
MedChemComm 2.36 第67百分位
#57
Asian Journal of Organic Chemistry 2.35 第66百分位
#58
Tetrahedron 2.33 第65百分位
#59
Synthesis 2.31 第65百分位
#60
Chemical Biology and Drug Design 2.29 第64百分位
#61
Planta Medica 2.25 第63百分位
#62
Polymer International 2.25 第63百分位
#63
Egyptian Journal of Petroleum 2.21 第63百分位
#64
Archives of Pharmacal Research 2.17 第62百分位
#65
Molecular Diversity 2.15 第61百分位
#66
Journal of Peptide Science 2.10 第61百分位
#67
Biophysical Chemistry 2.08 第60百分位
#68
Tetrahedron Letters 2.04 第60百分位
#69
Carbohydrate Research 2.02 第59百分位
#70
Lipids 1.99 第58百分位
#71
Starch/Staerke 1.99 第58百分位
#72
Journal of Natural Medicines 1.98 第57百分位
#73
Journal of Molecular Structure 1.94 第57百分位
#74
Journal of Fluorine Chemistry 1.93 第56百分位
#75
Journal of Organometallic Chemistry 1.92 第55百分位
#76
Biopolymers 1.91 第55百分位
#77
Drug Development and Industrial Pharmacy 1.90 第54百分位
#78
Synlett 1.87 第54百分位
#79
Molecular Informatics 1.86 第53百分位
#80
Rapid Communications in Mass Spectrometry 1.85 第52百分位
#81
Natural Product Research 1.80 第52百分位
#82
Journal of Microencapsulation 1.79 第51百分位
#83
Current Organic Chemistry 1.78 第51百分位
#84
Chinese Journal of Polymer Science (English Edition) 1.77 第50百分位
#85
JAOCS, Journal of the American Oil Chemists' Society 1.72 第50百分位
#86
Bioinorganic Chemistry and Applications 1.69 第49百分位
#87
Chirality 1.69 第49百分位
#88
Aldrichimica Acta 1.68 第48百分位
#89
Tetrahedron Asymmetry 1.67 第47百分位
#90
Current Organic Synthesis 1.62 第47百分位
#91
Medicinal Chemistry Research 1.61 第46百分位
#92
Polycyclic Aromatic Compounds 1.58 第45百分位
#93
Computational Biology and Chemistry 1.55 第44百分位
#94
Macromolecular Research 1.55 第44百分位
#95
Carbon Letters 1.52 第44百分位
#96
Macromolecular Theory and Simulations 1.49 第43百分位
#97
Organic Preparations and Procedures International 1.49 第43百分位
#98
Journal of Flow Chemistry 1.48 第42百分位
#99
Records of Natural Products 1.44 第41百分位
#100
International Journal of Chemical Kinetics 1.43 第40百分位
#101
Organic Reactions 1.43 第40百分位
#102
Cholesterol 1.42 第39百分位
#103
Cereal Chemistry 1.40 第39百分位
#104
Journal of Physical Organic Chemistry 1.40 第39百分位
#105
Chromatographia 1.38 第38百分位
#106
Journal of Polymer Research 1.37 第37百分位
#107
Journal of Labelled Compounds and Radiopharmaceuticals 1.35 第36百分位
#108
Organometallic Chemistry 1.31 第36百分位
#109
Bioscience, Biotechnology and Biochemistry 1.26 第35百分位
#110
Central European Journal of Energetic Materials 1.24 第35百分位
#111
Journal of Asian Natural Products Research 1.21 第34百分位
#112
Protein Journal 1.19 第34百分位
#113
Chinese Journal of Organic Chemistry 1.18 第33百分位
#114
Applied Biological Chemistry 1.17 第32百分位
#115
Journal of Molecular Modeling 1.17 第32百分位
#116
Synthetic Communications 1.15 第31百分位
#117
Advances in Physical Organic Chemistry 1.14 第30百分位
#118
Fullerenes Nanotubes and Carbon Nanostructures 1.14 第30百分位
#119
Macroheterocycles 1.13 第29百分位
#120
Helvetica Chimica Acta 1.12 第29百分位
#121
Advances in Polymer Technology 1.05 第28百分位
#122
High Performance Polymers 1.03 第28百分位
#123
Heterocycles 0.95 第26百分位
#124
Journal of Heterocyclic Chemistry 0.95 第26百分位
#125
Organic Communications 0.95 第26百分位
#126
Combinatorial Chemistry and High Throughput Screening 0.94 第25百分位
#127
Cellular Polymers 0.92 第24百分位
#128
Cellulose Chemistry and Technology 0.92 第24百分位
#129
Chemistry of Heterocyclic Compounds 0.92 第24百分位
#130
Studies in Natural Products Chemistry 0.91 第23百分位
#131
Natural Product Sciences 0.90 第22百分位
#132
Carbohydrate Chemistry 0.87 第21百分位
#133
Protection of Metals and Physical Chemistry of Surfaces 0.87 第21百分位
#134
Journal of Carbohydrate Chemistry 0.86 第21百分位
#135
Canadian Journal of Chemistry 0.85 第20百分位
#136
Grasas y Aceites 0.85 第20百分位
#137
Organic Syntheses 0.84 第19百分位
#138
Annual Reports in Medicinal Chemistry 0.82 第18百分位
#139
Mini-Reviews in Organic Chemistry 0.82 第18百分位
#140
Journal of Photopolymer Science and Technology 0.78 第17百分位
#141
Phosphorus, Sulfur and Silicon and the Related Elements 0.74 第16百分位
#142
Russian Journal of Bioorganic Chemistry 0.74 第16百分位
#143
Polimeros 0.73 第15百分位
#144
Journal of Essential Oil-Bearing Plants 0.70 第15百分位
#145
Arkivoc 0.67 第14百分位
#146
Progress in Heterocyclic Chemistry 0.67 第14百分位
#147
Heterocyclic Communications 0.66 第13百分位
#148
Russian Journal of Organic Chemistry 0.59 第12百分位
#149
Artificial DNA: PNA and XNA 0.58 第11百分位
#150
Progress on Chemistry and Application of Chitin and its Derivatives 0.58 第11百分位
#151
Macromolecular Symposia 0.56 第10百分位
#152
Chinese Journal of Chromatography (Se Pu) 0.54 第10百分位
#153
Letters in Organic Chemistry 0.52 第9百分位
#154
Spectroscopic Properties of Inorganic and Organometallic Compounds 0.50 第9百分位
#155
Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry 0.49 第8百分位
#156
Main Group Chemistry 0.48 第7百分位
#157
Progress in Rubber, Plastics and Recycling Technology 0.46 第7百分位
#158
Targets in Heterocyclic Systems 0.42 第6百分位
#159
Strategies and Tactics in Organic Synthesis 0.41 第6百分位
#160
Organophosphorus Chemistry 0.40 第5百分位
#161
Indian Journal of Chemistry - Section B Organic and Medicinal Chemistry 0.38 第5百分位
#162
Journal of Applied Biological Chemistry 0.34 第4百分位
#163
Yuki Gosei Kagaku Kyokaishi/Journal of Synthetic Organic Chemistry 0.32 第3百分位
#164
MolBank 0.25 第2百分位
#165
Rivista Italiana delle Sostanze Grasse 0.25 第2百分位
#166
Trends in Glycoscience and Glycotechnology 0.21 第2百分位
#167
Medicinal Plants - International Journal of Phytomedicines and Related Industries 0.18 第1百分位
#168
Celulosa Y Papel 0.00 第0百分位
#169
Journal of the Indian Chemical Society 0.00 第0百分位

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