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Introduction of human gammaherpesvirus 8 genotypes A, B, and C into Brazil from multiple geographic regions.
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Abstract:
:Variations in the open reading frame (ORF) K1 gene sequence of human gammaherpesvirus 8 (HHV-8) has led to the identification of 6 major genotypic clades (A, B, C, D, E, and F) in specimens isolated from around the world. These clades exhibit clear clustering among individuals in different ethnic groups and from different geographic regions. The human population of Brazil varies greatly in ethnicity because of multiple immigration events from Africa, Europe, Asia, and indigenous communities. However, there is scant information about the HHV-8 genotypes currently circulating in Brazil. Here, we describe HHV-8 genotypic diversity in isolates from Brazilian HIV-infected patients living with Kaposi's sarcoma (KS) by analysis of the complete ORF-K1 region. We also identified the most likely geographic origins of these different Brazilian genotypes. We extracted HHV-8 DNA (24 positive samples) from individuals with HIV/KS from the states of São Paulo and Rio de Janeiro, amplified the ORF-K1 gene using nested PCR (about 870 base pairs), performed sequencing and phylogenetic analysis, and then calculated the mean genetic distances of Brazilian sequences from sequences in other regions of the world (523 sequences analyzed). Phylogenetic analysis showed that genotypes C, A, and B were present in 45.8 %, 29.2 % and 25 % of the isolates from Brazil, respectively. These isolates grouped into separate clades, rather than a single monophyletic cluster. Mean genetic distance analyses suggested that these genotypes were introduced into the Brazil multiple times from different geographical regions. HHV-8/A isolates appear to be from Ukraine, Russia, and the Tartar ethnic group; HHV-8/B isolates appear to be from Congo and Democratic Republic of the Congo; and HHV-8/C isolates appear to be from Australia, Algeria, England, and French Guiana. These results contribute to a better understanding of the genetic diversity and origins of HHV-8 strains circulating in Brazil, and will provide a foundation for further epidemiological and evolutionary studies of HHV-8.
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VIRUS RESEARCH
VIRUS RES
| 最新影响因子：6.286 | 期刊ISSN：0168-1702 | CiteScore：2.58 |
| 出版周期：Monthly | 是否OA：YES | 出版年份：0 |
期刊官方网址：http://www.elsevier.com/wps/find/journaldescription.cws_home/506054/description#description
期刊投稿地址：https://www.evise.com/evise/faces/pages/navigation/NavController.jspx?JRNL_ACR=VIRUS
| 自引率：3.90% | 研究方向：医学-病毒学 |
| 出版地区：NETHERLANDS |
SCI期刊coverage：Science Citation Index Expanded（科学引文索引扩展）
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VIRUS RESEARCH 期刊简介
英文简介：
Virus Research provides a means of rapid publication for original papers on fundamental research concerning virus structure, replication, and pathogenesis. These include reports describing virus morphology, the function and antigenic analysis of virus structural components, virus genome structure and expression, analysis of virus replication processes, effects of viruses on their host cells, including oncogene activation and transduction, neoplastic transformation, and the pathogenesis of virus infections including tumour induction. The journal also publishes review articles on topics of current interest and occasional book reviews and meeting reports.
中文简介：（来自Google、百度翻译）
病毒研究为有关病毒结构、复制和发病机制的基础研究的原始论文提供了一种快速出版的手段。这些报告包括描述病毒形态、病毒结构成分的功能和抗原分析、病毒基因组结构和表达、病毒复制过程分析、病毒对宿主细胞的影响，包括致癌基因激活和转导、肿瘤转化，以及病毒感染的发病机制，包括肿瘤诱导。该杂志还发表关于当前感兴趣的主题的评论文章，偶尔还发表书籍评论和会议报告。
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VIRUS RESEARCH 期刊中科院评价数据
最新中科院分区
| 大类(学科) | 小类(学科) | 学科排名 |
| 医学 |
VIROLOGY (病毒学) 4区 |
19/35 |
最新公布的期刊年发文量
| 年度总发文量 | 年度论文发表量 | 年度综述发表量 |
| 284 | 246 | 38 |
总被引频次：9137
特征因子：0.013830
影响因子趋势图
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VIRUS RESEARCH 期刊CiteScore评价数据
最新CiteScore值
2.58
=
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文献(2015-2017)
=
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847篇文献
文献总数（2014-2016）：847
被引比率：76%
SJR：1.147
SCLmago期刊等级衡量经过加权后的期刊受引用次数，引用次数的加权值由施引期刊的学科领域和声望(SJR)决定。
SNIP：0.901
每篇文章中来源出版物的标准化影响将实际受引用情况对照期刊所属学科领域中预期的受引用情况进行衡量。
CiteScore排名
| 序号 | 类别 | 排名 | 百分位 |
| 1 |
大类(学科)：Immunology and Microbiology
小类(学科)：Virology
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| 2 |
大类(学科)：Medicine
小类(学科)：Infectious Diseases
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| 3 |
大类(学科)：Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
小类(学科)：Cancer Research
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偏重的研究方向：viral disease (1) vaccine (1) infectious disease (1) 病毒 (1) 病毒与宿主相互作用 (1) virus (1) 生命科学 (1) 植物保护学 (1) 植物病理学 (1) 病毒学 (1)
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审稿速度：平均4.5个月的审稿周期(非官方数据)
最新评论(不代表本站观点)
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liting7111
研究方向：virus
审稿时间： 12个月内 接受率： 中等（50%命中）
1月投稿，修改了两次，三个审稿人都同意接收，不过三个人是依次审稿的，前后7个月，最终在8月份接收了。2020-06-26 -
liting7111
审稿时间： 2个月内 接受率： 中等（50%命中）
我们小组投过两篇，杂志还是不错的，审稿速度很快，也容易接受。2020-04-11 -
liting7111
研究方向：viral disease vaccine infectious disease
审稿时间： 3个月内 接受率： 中等（50%命中）
审稿速度快，投稿一周都在编辑那，第十天开始审稿，二十多天给了小修，花了三天修改上传修改稿，一星期接受。2020-04-11 -
liting7111
11月底投稿，12月1号送审，12月底被拒稿，附上了审稿意见，主要是文章质量不过关，很不错的杂志，速度超乎想象。2019-12-04 -
liting7111
研究方向：病毒 病毒与宿主相互作用
接受率： 中等（50%命中）
投稿一个月不到一审就结束了，审稿意见非常详细，两个月事假你修改，花了半个月上传，上传三个小时就接收了，效率超高！2019-09-01 -
liting7111
研究方向：病毒学
接受率： 中等（50%命中）
速度很快，虽然审稿意见给的不是大修，但是我还是按照大修标准去改的，修回一个月接收，希望能帮助到大家。2019-06-04 -
liting7111
投稿一个月被拒稿，整个人都蒙了。2019-04-27 -
liting7111
研究方向：生命科学 植物保护学 植物病理学
审稿时间： 1个月内
投稿一个月审稿就结束了，修改完立马就接收了。2019-01-07
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