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Development of a Sensitive and Rapid Recombinase Polymerase Amplification Assay for the Detection of Anaplasma phagocytophilum.

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Abstract:

:Human granulocytic anaplasmosis (HGA) is a tick-borne disease caused by the obligate intracellular Gram-negative bacterium, Anaplasma phagocytophilum The disease often presents with nonspecific symptoms with negative serology during the acute phase. Direct pathogen detection is the best approach for early confirmatory diagnosis. Over the years, PCR-based molecular detection methods have been developed, but optimal sensitivity is not achieved by conventional PCR while real-time PCR requires expensive and sophisticated instruments. To improve the sensitivity and also develop an assay that can be used in resource-limited areas, an isothermal DNA amplification assay based on recombinase polymerase amplification (RPA) was developed. To do this, we identified a 171-bp DNA sequence within multiple paralogous copies of msp2 within the genome of A. phagocytophilum Our novel RPA assay targeting this sequence has an analytical limit of detection of one genome equivalent copy of A. phagocytophilum and can reliably detect 125 bacteria/mL in human blood. A high level of specificity was demonstrated by the absence of nonspecific amplification using genomic DNA from human or DNA from other closely-related pathogenic bacteria, such as Anaplasma platys, Ehrlichia chaffeensis, Orientia tsutsugamushi and Rickettsia rickettsii, etc. When applied to patient DNA extracted from whole blood, this new RPA assay was able to detect 100% of previously-diagnosed Aphagocytophilum cases. The sensitivity and rapidness of this assay represent a major improvement for early diagnosis of A. phagocytophilum in human patients and suggest a role for better surveillance in its reservoirs or vectors, especially in remote regions where resources are limited.

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JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY

J CLIN MICROBIOL
最新影响因子：11.677 期刊ISSN：0095-1137 CiteScore：3.55
出版周期：Monthly 是否OA：YES 出版年份：1975

期刊官方网址：http://jcm.asm.org/

期刊投稿地址：

自引率：8.40% 研究方向：医学-微生物学
出版地区：UNITED STATES

SCI期刊coverage：Science Citation Index Expanded（科学引文索引扩展）

NCBI查询：PubMed Central (PMC)链接全文检索(pubmed central)

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JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY 期刊简介

英文简介：

Journal of Clinical Microbiology® (JCM) publishes the most current research related to the laboratory diagnosis of human and animal infections and the role of the laboratory in both the management of infectious diseases and the elucidation of the epidemiology of infections.

中文简介：（来自Google、百度翻译）

《临床微生物学杂志》(JCM)发表了与实验室诊断人类和动物感染以及实验室在传染病管理和阐明感染流行病学方面的作用有关的最新研究。

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SJR：2.256
SCLmago期刊等级衡量经过加权后的期刊受引用次数，引用次数的加权值由施引期刊的学科领域和声望(SJR)决定。
SNIP：1.443
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JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY 投稿经验

(由下方点评分析获得，16人参与，19313人阅读）

最新评论(不代表本站观点)

  • avatar

    liting7111

    研究方向：微生物鉴定 流行病学 临床意义

    审稿时间： 2个月内 接受率： 比较困难（25%命中）

    审稿快，投稿流程简单，版面费不高，会员打折，见刊快。编辑比较尊重审稿人的意见，值得试试。
    2020-06-17
  • avatar

    liting7111

    研究方向：寄生虫学

    审稿时间： 2个月内 接受率： 比较困难（25%命中）

    老牌杂志不错，偏重细菌。投了一篇被拒了，说是投稿量增加，文章更多比较有创意或重大发现。
    2020-06-04
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    liting7111

    研究方向：微生物 肠道微生物

    新人，投这本杂志后，审稿人怎样选择，是不是只能从给的Editorial Board里选择？
    2020-05-02
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    liting7111

    研究方向：微生物 肠道微生物

    审稿时间： 3个月内 接受率： 比较困难（25%命中）

    怀疑命中率，投了一篇2个月了没消息，写了一封信后就被拒了，还是蛮难投的。
    2020-03-04
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    liting7111

    研究方向：医药科学 医学病原微生物与感染 寄生虫 寄生虫感染与宿主免疫

    审稿时间： 2个月内

    杂志不错，是老牌杂志了，具有权威性，偏重细菌。
    2020-02-14
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    liting7111

    新手想投这本杂志，但是不知道reviewers如何寻找？如何知道这些评审是哪个领域的？
    2020-02-12
  • avatar

    liting7111

    研究方向：微生物 肠道微生物

    想知道投这本期刊需要一些什么介绍材料。
    2020-01-15
  • avatar

    liting7111

    研究方向：微生物 肠道微生物

    审稿速度挺快，20天后就收到了审稿意见，不错。
    2020-01-15
  • avatar

    liting7111

    研究方向：微生物 肠道微生物

    效率挺高的，9号投的，11号送审。希望有好的结果。
    2020-01-07
  • avatar

    liting7111

    研究方向：微生物 肠道微生物

    JCM的IF在4已经3个年头了，想知道JCM现在的接受率有多少？投稿有何方法？
    2019-12-01
  • avatar

    liting7111

    研究方向：流感 耐药 监测

    审稿时间： 2个月内

    接收率在80%左右，小修，编辑很好，意见中肯。
    2019-10-07
  • avatar

    liting7111

    研究方向：微生物 肠道微生物

    这本期刊在语言上把控严格，建议要投的一定要找人把好语言关。
    2019-09-12
  • avatar

    liting7111

    研究方向：关节假体感染 病原诊断

    效率高，一个月就修回，发修改稿后6小时就接收了。审稿人的意见和问题都比较尖锐。
    2019-08-24
  • avatar

    liting7111

    研究方向：感染病学 传染病 临床微生物

    审稿时间： 2个月内 接受率： 中等（50%命中）

    影响因子上涨的快，越来越难中。
    2019-06-04
  • avatar

    liting7111

    语言要求高，初审大概两月内，3个审稿人，审稿意见中肯，对细节把握的很严格。
    2019-05-15
  • avatar

    liting7111

    研究方向：微生物 肠道微生物

    审稿快，见刊快。
    2019-01-07

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