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Identification and clinical impact of potentially actionable somatic oncogenic mutations in solid tumor samples.

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Abstract:

BACKGROUND:An increasing number of anti-cancer therapeutic agents target specific mutant proteins that are expressed by many different tumor types. Successful use of these therapies is dependent on the presence or absence of somatic mutations within the patient's tumor that can confer clinical efficacy or drug resistance. METHODS:The aim of our study was to determine the type, frequency, overlap and functional proteomic effects of potentially targetable recurrent somatic hotspot mutations in 47 cancer-related genes in multiple disease sites that could be potential therapeutic targets using currently available agents or agents in clinical development. RESULTS:Using MassArray technology, of the 1300 patient tumors analysed 571 (43.9%) had at least one somatic mutation. Mutations were identified in 30 different genes. KRAS (16.5%), PIK3CA (13.6%) and BRAF (3.8%) were the most frequently mutated genes. Prostate (10.8%) had the lowest number of somatic mutations identified, while no mutations were identified in sarcoma. Ocular melanoma (90.6%), endometrial (72.4%) and colorectal (66.4%) tumors had the highest number of mutations. We noted high concordance between mutations in different parts of the tumor (94%) and matched primary and metastatic samples (90%). KRAS and BRAF mutations were mutually exclusive. Mutation co-occurrence involved mainly PIK3CA and PTPN11, and PTPN11 and APC. Reverse Phase Protein Array (RPPA) analysis demonstrated that PI3K and MAPK signalling pathways were more altered in tumors with mutations compared to wild type tumors. CONCLUSIONS:Hotspot mutational profiling is a sensitive, high-throughput approach for identifying mutations of clinical relevance to molecular based therapeutics for treatment of cancer, and could potentially be of use in identifying novel opportunities for genotype-driven clinical trials.

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Journal of Translational Medicine

J TRANSL MED
最新影响因子:8.44 期刊ISSN:1479-5876 CiteScore:4.1
出版周期:Irregular 是否OA:YES 出版年份:2003

期刊官方网址:http://www.translational-medicine.com/

期刊投稿地址:http://www.translational-medicine.com/manuscript

自引率:1.80% 研究方向:医学-医学:研究与实验
出版地区:ENGLAND

SCI期刊coverage:Science Citation Index Expanded(科学引文索引扩展)

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Journal of Translational Medicine 期刊简介

英文简介:

Published by BioMed Central. ISSN: 1479-5876. Journal of Translational Medicine is an open access journal publishing articles focusing on information derived from human experimentation so as to optimise the communication between basic and clinical science. The journal covers all areas of translational medicine but also has several specialized sections: Cancer microenvironment - Edited by Davide Bedognetti Cardiovascular, metabolic and lipoprotein translation- Edited by Nehal N. Mehta Cell, tissue and gene therapy - Edited by David Stroncek Clinical translation - Edited by Lana Kandalaft Combination strategies - Edited by Paolo A. Ascierto Computational modelling and Epidemiology- Edited by Michael Liebman and Sabrina Molinaro Disease biomarkers - Edited by Xiangdong Wang Illnesses of Unknown Etiology - Edited by Monica Panelli Immunobiology and immunotherapy - Edited by Adrian Bot Immunovirology - Edited by Luigi Buonaguro Medical bioinformatics - Edited by Samir K. Brahmachari Neuroscience - Edited by Luis F. Alguacil Nutrition & metabolism - Edited by Laura Soldati Pain, critical care and anesthesia - Edited by Yasin S. Al Makadma Patient-targeted molecular therapies - Edited by Francesco Chiappelli Personalised medicine - Edited by Lotfi Chouchane Translational imaging - Edited by Ravinder Reddy Translational hematology- Edited by Seah H. Lim Article-processing charges Open access publishing is not without costs. Journal of Translational Medicine therefore levies an article-processing charge of £1370/$2145/€1745 for each article accepted for publication. If the corresponding author''s institution participates in our open access membership program, some or all of the publication cost may be covered (more details available on the membership page). We routinely waive charges for authors from low-income countries. For other countries, article-processing charge waivers or discounts are granted on a case-by-case basis to authors with insufficient funds. Authors can request a waiver or discount during the submission process. For further details, see our article-processing charge page. BioMed Central provides a free open access funding support service to help authors discover and apply for article processing charge funding. Visit our OA funding and policy support page to view our list of research funders and institutions that provide funding for APCs, and to learn more about our email support service.

中文简介:(来自Google、百度翻译)

由生物医学中心出版。ISSN: 1479 - 5876。 《转化医学杂志》是一种开放获取的期刊,主要发表从人体实验中获得的信息,从而优化基础科学和临床科学之间的交流。 该杂志涵盖了转化医学的所有领域,但也有几个专门的部分: 癌症微环境-由Davide Bedognetti编辑 心血管,代谢和脂蛋白翻译-编辑Nehal N. Mehta 细胞,组织和基因治疗-由大卫斯特龙塞克编辑 临床翻译- Lana Kandalaft编辑 组合策略-编辑保罗A.海塞托 计算模型和流行病学-编辑迈克尔利布曼和萨布丽娜莫利纳罗 疾病生物标志物-王向东编辑 病因不明的疾病-由Monica Panelli编辑 免疫生物学和免疫治疗-编辑的阿德里安机器人 免疫病毒学-由Luigi Buonaguro编辑 医学生物信息学-由Samir K. Brahmachari编辑 神经科学-路易斯F.阿尔瓜西尔编辑 营养与代谢-劳拉索尔达蒂编辑 疼痛、重症监护和麻醉- Yasin S. Al Makadma编辑 患者靶向分子治疗-由Francesco Chiappelli编辑 个性化医疗-编辑洛菲乔查内 翻译成像-编辑由Ravinder Reddy 翻译血液学-由Seah H. Lim编辑 Article-processing指控 开放存取出版并非没有成本。因此,《转化医学杂志》对每一篇被接受发表的文章收取1370英镑/ 2145美元/ 1745欧元的论文处理费。如果通讯作者所在的机构参与了我们的开放获取会员计划,部分或全部出版费用可能会被支付(更多详情请参阅会员网页)。我们通常免除低收入国家作者的费用。对于其他国家,文章处理费用的减免或折扣是在个案基础上给予资金不足的作者。作者可以在提交过程中要求弃权或折扣。详情请参阅我们的文章处理收费页面。 BioMed Central提供免费的开放获取资助支持服务,帮助作者发现和申请文章处理费用资助。访问我们的OA资助和政策支持页面,查看我们的研究资助者和为APCs提供资助的机构列表,并了解更多关于我们的电子邮件支持服务。

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Journal of Translational Medicine 期刊中科院评价数据

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Journal of Translational Medicine 投稿经验

(由下方点评分析获得,14人参与,53747人阅读)

最新评论(不代表本站观点)

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    liting7111

    审稿太拖了,着急发的人不要投了,我投了两个月还在editor assigned!
    2020-06-11
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    liting7111

    接受率: 中等(50%命中)

    审稿人很专业,给的意见也比较中肯,小修两次接收,杂志IF看涨!
    2020-04-12
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    liting7111

    研究方向:translational medicine cancer therapy

    审稿时间: 6个月内 接受率: 中等(50%命中)

    投稿到接受4个月左右,稿件状态大多数显示editor assigned,返修之后一个月不到就显示接收了。
    2020-03-21
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    liting7111

    已经投稿快五个月了,一点消息都没。
    2020-03-10
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    liting7111

    研究方向:白血病 生物信息

    接受率: 中等(50%命中)

    刚通知接收,8月底投稿,9月底给了大修,要求一个月大修。有一点不好就是通知没发邮箱,我在十一假期后才发现要求修改,跟编辑申请延期一个月,编辑也很爽快的大约了。审稿人的意见不是很明确,其中一个说样本量比较少,需要进一步生信分析,另外一个居然说图片分辨率太低。11月20日修回,其中改了几次,12月编辑直接接受了。效率很高,态度也不错,现在正在弄版面费,要2200美刀。
    2020-02-18
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    liting7111

    审稿时间: 2个月内 接受率: 中等(50%命中)

    一审一个月出头,大修,审稿人都很专业,补好实验修回一周就接收了,效率还是挺高的,杂志比较侧重临床转化。
    2020-02-03
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    liting7111

    投稿后一审时间有点长,但是review之后速度就很快了。
    2020-01-02
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    liting7111

    杂志收偏临床文章吗?我有一篇直肠癌结合影像组学文章不知道好不好投。
    2020-01-02
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    liting7111

    研究方向:肠癌

    审稿时间: 2个月内 接受率: 中等(50%命中)

    审稿三个月,大修一次后,两个审稿人一个想拒稿,另外一个给了大修,回答二十多个意见后,修回半个月直接拒稿了。因为给大修的审稿人对修回稿子不是很满意。
    2019-12-04
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    liting7111

    一审花了两个月,两个月修稿,修回半个月了还是在editor assigned,二审需要多久?
    2019-11-27
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    liting7111

    杂志版面费收多少?
    2019-09-19
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    liting7111

    审稿效率很高,一审一个月都没有,大修修回三天接受,杂志还是很不错的,审稿人都是专家。
    2019-09-06
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    liting7111

    研究方向:肝癌 分子

    审稿时间: 6个月内 接受率: 比较困难(25%命中)

    泪流满面,这杂志速度太慢了。一审审了一个月,修回一个月,又给了大修修了一个月,现在三审,已经过去三个月了。
    2019-03-19
  • avatar

    liting7111

    投稿快一个月了,还显示在editor assigned,这速度真是伤不起!
    2019-01-06

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