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计算癌细胞模型指导精准乳腺癌医学

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Abstract:

背景: 在癌细胞模型上大规模筛选药物敏感性可以模拟体内细胞行为,为癌症的生物学研究提供了更广泛的范围。由于单一药物或药物组合的治疗效果取决于个体患者的基因组特征和癌细胞整合反应,通过使用大量癌细胞模型在体外模型中鉴定有效药物是开发靶向治疗的一种很有前途的方法。精准癌症医学是为个体患者选择最合适的治疗或治疗方法。然而,它仍然缺乏工具来弥合传统的体外癌细胞模型和临床患者对抑制剂的反应之间的差距。方法: 开发了一个最佳的两层决策系统模型,以确定最接近个体肿瘤的癌细胞,以便在精准癌症医学中进行最佳治疗干预。因此,设计了一个最佳的网格参数选择,以寻求最高的治疗选择依据患者对药物反应和体外癌细胞药物筛选的偏好。最优的两层决策系统模型克服了肿瘤和癌细胞之间的异质性数据比较的挑战,以及体外药物反应的持续变化与临床实践中的离散反应之间的变化。我们使用 681 个癌细胞的 mRNA 和相关的 481 个药物筛选模拟了模型的准确性,并验证了我们在 315 名乳腺癌患者中 7 种药物 (多西他赛、多柔比星、氟尿嘧啶、紫杉醇、他莫昔芬、环磷酰胺,拉波替尼)。结果: 与药物在临床患者中的真实反应相比,新模型获得了 7 种药物的总体平均符合率超过 90.8%。同时,推荐最佳癌细胞和相关的癌症药物的最佳治疗效果。新的最优两层决策系统模型用于 1097 例乳腺癌患者指导精准医疗,以推荐其最佳癌细胞 (30 个癌细胞) 和某些癌症药物的相关疗效。我们的模型可以检测每个患者最相似的癌细胞。结论: 首次开发了成功的临床翻译模型 (最优两层决策系统模型),将体外基础科学与治疗干预应用中的临床实践联系起来。这个新颖的工具一举两得。它可以帮助基础科学为单个肿瘤寻求最佳的癌细胞模型,同时在实践中优先考虑临床药物的建议。工具相关平台网站: 我们将乳腺癌研究扩展到跨 45 个治疗预测的 32 种以上的癌症。网站已经建立,可以通过链接访问: https://pcm2019.shinyapps.io/drug_response_prediction/ 。

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Genes

GENES-BASEL
最新影响因子:4.141 期刊ISSN:2073-4425 CiteScore:3.55
出版周期: 是否OA:YES 出版年份:0

期刊官方网址:http://www.mdpi.com/journal/genes

自引率:5.40% 研究方向:GENETICS & HEREDITY-
出版地区:SWITZERLAND

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Genes 期刊简介

英文简介:

Genes (ISSN 2073-4425; CODEN: GENEG9) is a peer-reviewed open access journal of genetics and genomics published monthly online by MDPI. The Spanish Society for Biochemistry and Molecular Biology (SEBBM) is affiliated with Genes and their members receive discounts on the article processing charges. Open Access Free for readers, with article processing charges (APC) paid by authors or their institutions. High visibility: Covered by Science Citation Index Expanded (Web of Science) and Scopus. Citations are available in PubMed, full-text archived in PubMed Central. Rapid publication: Manuscripts are peer-reviewed and a first decision provided to authors approximately 19.7 days after submission; acceptance to publication is undertaken in 5.8 days (median values for papers published in this journal in the second half of 2018). Recognition of reviewers: Reviewers who provide timely, thorough peer-review reports receive vouchers entitling them to a discount on the APC of their next publication in any MDPI journal, in appreciation of the work done. Impact Factor: 3.191 (2017) ; 5-Year Impact Factor: 3.286 (2017)

中文简介:(来自Google、百度翻译)

基因(ISSN 2073 - 4425;CODEN: GENEG9)是一个同行评审的开放获取遗传学和基因组学杂志,由MDPI每月在线出版。西班牙生物化学和分子生物学协会(SEBBM)隶属于基因协会,其成员在论文处理费上享受折扣。 读者免费开放获取,文章处理费(APC)由作者或他们的机构支付。 高可视性:被科学引文索引扩展(Web of Science)和Scopus覆盖。引文可在PubMed中找到,全文存档于PubMed Central。 快速出版:稿件经过同行评审,并在投稿后约19.7天向作者提供第一个决定;接受发表需要5.8天(2018年下半年发表论文的中值)。 评审人员的认可:提供及时、全面的同行评审报告的评审人员将收到相应的凭证,以表彰他们所做的工作,使他们有权在任何MDPI期刊的下一篇文章的APC上获得折扣。 影响因素:3.191 (2017);5年影响因子:3.286 (2017)

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Vitis - Journal of Grapevine Research 0.83 第16百分位
#259
Animal Science Papers and Reports 0.81 第16百分位
#260
International Journal of Molecular and Cellular Medicine 0.80 第16百分位
#261
HLA 0.75 第15百分位
#262
Journal of Horticultural Science and Biotechnology 0.75 第15百分位
#263
Journal of Genetics 0.74 第15百分位
#264
Plant Genetic Resources: Characterisation and Utilisation 0.72 第15百分位
#265
Journal of Plant Registrations 0.71 第14百分位
#266
Czech Journal of Genetics and Plant Breeding 0.67 第14百分位
#267
Human Biology 0.66 第14百分位
#268
Forensic Science International: Genetics Supplement Series 0.65 第13百分位
#269
Stem Cell Investigation 0.65 第13百分位
#270
Genes and Genomics 0.64 第13百分位
#271
Cereal Research Communications 0.62 第12百分位
#272
Caryologia 0.59 第12百分位
#273
Conservation Genetics Resources 0.59 第12百分位
#274
Maydica 0.59 第12百分位
#275
International Journal Bioautomation 0.56 第11百分位
#276
Current Bioinformatics 0.55 第11百分位
#277
Balkan Journal of Medical Genetics 0.51 第10百分位
#278
Journal of Crop Improvement 0.51 第10百分位
#279
Molluscan Research 0.51 第10百分位
#280
Genomics Insights 0.50 第9百分位
#281
Genetika 0.49 第9百分位
#282
Iranian Journal of Biotechnology 0.49 第9百分位
#283
Russian Journal of Genetics 0.49 第9百分位
#284
Indian Journal of Genetics and Plant Breeding 0.45 第8百分位
#285
Cytologia 0.42 第8百分位
#286
Sabrao Journal of Breeding and Genetics 0.41 第7百分位
#287
Nucleus (India) 0.40 第7百分位
#288
Genome Integrity 0.38 第7百分位
#289
Gene Reports 0.37 第6百分位
#290
Revista Fitotecnia Mexicana 0.36 第6百分位
#291
Agri Gene 0.35 第6百分位
#292
Chinese Journal of Applied and Environmental Biology 0.35 第6百分位
#293
Ecological Genetics and Genomics 0.33 第5百分位
#294
Journal of Integrated OMICS 0.33 第5百分位
#295
Russian Journal of Genetics: Applied Research 0.32 第5百分位
#296
Mitochondrial DNA Part B: Resources 0.30 第4百分位
#297
Cytology and Genetics 0.28 第4百分位
#298
Mitochondrial DNA Part A: DNA Mapping, Sequencing, and Analysis 0.25 第3百分位
#299
Molecular Genetics, Microbiology and Virology 0.25 第3百分位
#300
Journal of Biotech Research 0.22 第3百分位
#301
In Silico Biology 0.20 第3百分位
#302
Forum on Immunopathological Diseases and Therapeutics 0.18 第2百分位
#303
Medizinische Genetik 0.17 第2百分位
#304
Analele Universitatii din Oradea, Fascicula Biologie 0.13 第1百分位
#305
Epigenetics and Human Health 0.13 第1百分位
#306
Current Pharmacogenomics and Personalized Medicine 0.11 第1百分位
#307
Genetics in the Third Millennium 0.09 第1百分位
#308
Iranian Journal of Plant Physiology 0.06 第0百分位
#309
Japanese Journal of Crop Science 0.06 第0百分位
#310
Cardiogenetics 0.00 第0百分位
aaa
#21 89
Genes 3.55 第76百分位
排名
来源出版物名称 CiteScore2017 百分位
#1
Nature Reviews Genetics 17.21 第99百分位
#2
Genome Research 11.65 第98百分位
#3
Annual Review of Genomics and Human Genetics 9.77 第97百分位
#4
American Journal of Human Genetics 8.34 第96百分位
#5
Genome Medicine 6.61 第94百分位
#6
Genetics in Medicine 6.36 第93百分位
#7
PLoS Genetics 5.57 第92百分位
#8
Journal of Medical Genetics 5.46 第91百分位
#9
Clinical Epigenetics 5.44 第90百分位
#10
Human Molecular Genetics 5.31 第89百分位
#11
Application of Clinical Genetics 5.15 第88百分位
#12
Genes and Diseases 4.74 第87百分位
#13
Journal of Molecular Medicine 4.54 第85百分位
#14
Human Mutation 4.52 第84百分位
#15
Human Genetics 4.37 第83百分位
#16
American Journal of Medical Genetics, Part C: Seminars in Medical Genetics 4.28 第82百分位
#17
Circulation: Cardiovascular Genetics 3.95 第81百分位
#18
Frontiers in Genetics 3.78 第80百分位
#19
Heredity 3.75 第79百分位
#20
Chromosoma 3.69 第78百分位
#21
Genes 3.55 第76百分位
#22
Autism Research 3.48 第75百分位
#23
BMC Medical Genomics 3.41 第74百分位
#24
npj Genomic Medicine 3.41 第74百分位
#25
Molecular Medicine 3.38 第72百分位
#26
Orphanet Journal of Rare Diseases 3.35 第71百分位
#27
Journal of Inherited Metabolic Disease 3.30 第70百分位
#28
Environmental and Molecular Mutagenesis 3.27 第69百分位
#29
Cytotherapy 3.26 第67百分位
#30
European Journal of Human Genetics 3.05 第66百分位
#31
American Journal of Medical Genetics, Part B: Neuropsychiatric Genetics 2.80 第65百分位
#32
Neurogenetics 2.74 第64百分位
#33
BMC Genetics 2.67 第63百分位
#34
G3: Genes, Genomes, Genetics 2.66 第62百分位
#35
Clinical Genetics 2.62 第61百分位
#36
Mutagenesis 2.61 第60百分位
#37
Genes and Immunity 2.53 第58百分位
#38
Pharmacogenetics and Genomics 2.50 第57百分位
#39
Journal of Assisted Reproduction and Genetics 2.49 第56百分位
#40
Journal of Human Genetics 2.47 第55百分位
#41
Neuromuscular Disorders 2.43 第54百分位
#42
Journal of Heredity 2.33 第53百分位
#43
BMC Medical Genetics 2.31 第52百分位
#44
Human gene therapy methods 2.30 第51百分位
#45
Genetics Research International 2.26 第50百分位
#46
Genetic Epidemiology 2.24 第48百分位
#47
Prenatal Diagnosis 2.24 第48百分位
#48
European Journal of Medical Genetics 2.21 第46百分位
#49
Hereditary Cancer in Clinical Practice 2.21 第46百分位
#50
Public Health Genomics 2.17 第44百分位
#51
Current Genomics 2.15 第42百分位
#52
Journal of Cardiovascular Translational Research 2.15 第42百分位
#53
Behavior Genetics 2.10 第41百分位
#54
Familial Cancer 2.03 第39百分位
#55
Current Gene Therapy 2.00 第38百分位
#56
American Journal of Medical Genetics, Part A 1.86 第37百分位
#57
Human gene therapy. Clinical development 1.86 第37百分位
#58
Current Protocols in Human Genetics 1.83 第35百分位
#59
Haemophilia 1.77 第34百分位
#60
Annals of Human Genetics 1.72 第33百分位
#61
Journal of Gene Medicine 1.69 第32百分位
#62
Journal of Genetic Counseling 1.66 第30百分位
#63
Molecular Syndromology 1.65 第29百分位
#64
Meta Gene 1.57 第28百分位
#65
Cytogenetic and Genome Research 1.51 第26百分位
#66
Psychiatric Genetics 1.51 第26百分位
#67
Clinical Respiratory Journal 1.48 第25百分位
#68
Twin Research and Human Genetics 1.39 第24百分位
#69
Journal of Community Genetics 1.35 第23百分位
#70
CONTINUUM Lifelong Learning in Neurology 1.31 第21百分位
#71
Molecular Cytogenetics 1.23 第20百分位
#72
Ophthalmic Genetics 1.20 第19百分位
#73
Genetic Testing and Molecular Biomarkers 1.18 第18百分位
#74
Human Heredity 1.14 第17百分位
#75
International Journal of Immunogenetics 0.95 第16百分位
#76
Hemoglobin 0.72 第15百分位
#77
Recent advances in DNA 0.69 第14百分位
#78
Human Biology 0.66 第12百分位
#79
Egyptian Journal of Medical Human Genetics 0.53 第11百分位
#80
Balkan Journal of Medical Genetics 0.51 第10百分位
#81
Clinical Dysmorphology 0.42 第9百分位
#82
New Bioethics 0.31 第8百分位
#83
Cytology and Genetics 0.28 第7百分位
#84
Chinese Journal of Medical Genetics 0.24 第6百分位
#85
Medizinische Genetik 0.17 第5百分位
#86
Genetic Counseling 0.14 第3百分位
#87
Current Pharmacogenomics and Personalized Medicine 0.11 第2百分位
#88
Cardiogenetics 0.00 第1百分位
#89
Monographs in human genetics 0.00 第1百分位

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