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骨骼肌模型的比较分析揭示了转录组和代谢的异质性。

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Abstract:

: 大鼠 L6 、小鼠 C2C12 和原代人骨骼肌细胞 (HSMCs) 常用于研究骨骼肌中的生物学过程，关于这些模型的实验数据丰富。然而，一致匹配的实验数据很少，不同细胞类型和成年组织之间的比较也有问题。我们假设这些细胞模型之间的代谢差异可能反映在 mRNA 水平。公开可用的数据集用于描述肌管和骨骼肌组织中的 mRNA 水平。L6 、 C2C12 和 HSMC 肌管评估增殖、葡萄糖摄取、糖原合成、线粒体活性和底物氧化，以及对体外收缩的反应。转录组学分析发现，编码肌动蛋白和肌球蛋白的基因的 mRNA 在 C2C12 中富集，而 L6 肌管具有最高水平的编码葡萄糖转运蛋白的基因和线粒体电子传递链的 5 个复合物。一致地，胰岛素刺激的葡萄糖摄取和氧化能力在 L6 肌管中最大。胰岛素诱导的糖原合成在 HSMCs 中最高，但 C2C12 肌管有较高的基线葡萄糖氧化。所有模型对电脉冲刺激诱导的葡萄糖摄取和基因表达均有反应，但方式略有不同。我们的分析揭示了 L6 、 C2C12 或原代人肌管的转录组学和代谢特征存在很大程度的异质性。基于这些不同的特征，我们根据科学假设和生物学相关性提供了适当使用这些模型的建议。

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AMERICAN JOURNAL OF PHYSIOLOGY-CELL PHYSIOLOGY

AM J PHYSIOL-CELL PH
最新影响因子：5.282 期刊ISSN：0363-6143 CiteScore：3.2
出版周期：Monthly 是否OA：YES 出版年份：1977

期刊官方网址：http://ajpcell.physiology.org/

自引率：3.60% 研究方向：生物-生理学
出版地区：UNITED STATES

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AMERICAN JOURNAL OF PHYSIOLOGY-CELL PHYSIOLOGY 期刊简介

英文简介：

The American Journal of Physiology: Cell Physiology publishes peer-reviewed papers on the structure and function of cell membranes, contractile systems, and cellular organelles, as well as mechanisms of development, cell-to-cell interaction, gene expression, and neural, endocrine, and metabolic control.

中文简介：（来自Google、百度翻译）

《美国生理学杂志：细胞生理学》发表了关于细胞膜、收缩系统和细胞器的结构和功能，以及发育机制、细胞间相互作用、基因表达和神经、内分泌和代谢控制的同行评论论文。

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International Journal of Stem Cells 2.83 第51百分位
#129
Prostaglandins and Other Lipid Mediators 2.79 第51百分位
#130
Differentiation 2.77 第50百分位
#131
Molecular and Cellular Biochemistry 2.71 第50百分位
#132
Mycologia 2.70 第50百分位
#133
Bioscience Reports 2.69 第49百分位
#134
Comparative Biochemistry and Physiology Part - C: Toxicology and Pharmacology 2.69 第49百分位
#135
Plant Reproduction 2.69 第49百分位
#136
Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology 2.64 第48百分位
#137
Biochemical and Biophysical Research Communications 2.62 第47百分位
#138
BMC Cell Biology 2.62 第47百分位
#139
Cell Stress and Chaperones 2.61 第47百分位
#140
Prostaglandins Leukotrienes and Essential Fatty Acids 2.61 第47百分位
#141
Cytoskeleton 2.60 第46百分位
#142
Virchows Archiv 2.60 第46百分位
#143
Journal of Chromatography B: Analytical Technologies in the Biomedical and Life Sciences 2.57 第45百分位
#144
Microvascular Research 2.52 第45百分位
#145
Current Protein and Peptide Science 2.48 第45百分位
#146
Journal of Anatomy 2.46 第44百分位
#147
Experimental Hematology 2.45 第44百分位
#148
Results and Problems in Cell Differentiation 2.42 第43百分位
#149
Genesis 2.41 第43百分位
#150
Molecular Reproduction and Development 2.41 第43百分位
#151
Journal of Interferon and Cytokine Research 2.40 第42百分位
#152
Protoplasma 2.38 第42百分位
#153
Stem Cell Research 2.37 第42百分位
#154
Innate Immunity 2.34 第41百分位
#155
DNA and Cell Biology 2.31 第41百分位
#156
Cell Cycle 2.30 第40百分位
#157
Journal of Bioenergetics and Biomembranes 2.26 第40百分位
#158
Journal of Molecular Histology 2.20 第40百分位
#159
Nucleus 2.19 第39百分位
#160
Archives of Oral Biology 2.17 第39百分位
#161
Analytical Biochemistry 2.16 第38百分位
#162
Molecular Membrane Biology 2.16 第38百分位
#163
Genes to Cells 2.15 第38百分位
#164
Bioarchitecture 2.14 第37百分位
#165
Glycoconjugate Journal 2.14 第37百分位
#166
Science Signaling 2.14 第37百分位
#167
Current Plant Biology 2.13 第36百分位
#168
Cell Journal 2.12 第36百分位
#169
Cell Structure and Function 2.12 第36百分位
#170
Prion 2.11 第35百分位
#171
European Journal of Histochemistry 2.10 第35百分位
#172
Sub-Cellular Biochemistry 2.09 第34百分位
#173
Anemia 2.08 第34百分位
#174
Connective Tissue Research 2.06 第34百分位
#175
Cell Biochemistry and Function 2.05 第33百分位
#176
Cytometry Part B - Clinical Cytometry 2.02 第33百分位
#177
Histochemistry and Cell Biology 2.01 第32百分位
#178
International Journal of Experimental Pathology 2.01 第32百分位
#179
Journal of Muscle Research and Cell Motility 2.01 第32百分位
#180
Biochemistry and Cell Biology 2.00 第31百分位
#181
Human Cell 2.00 第31百分位
#182
Lipids 1.99 第30百分位
#183
Redox Report 1.99 第30百分位
#184
Journal of Chemical Biology 1.98 第30百分位
#185
Analytical Cellular Pathology 1.97 第30百分位
#186
Toxicologic Pathology 1.95 第29百分位
#187
Micron 1.92 第29百分位
#188
Cell Biology International 1.91 第28百分位
#189
Development Growth and Differentiation 1.91 第28百分位
#190
Growth Factors 1.88 第27百分位
#191
Journal of Cell Communication and Signaling 1.88 第27百分位
#192
Experimental and Toxicologic Pathology 1.79 第27百分位
#193
Journal of Membrane Biology 1.77 第26百分位
#194
Acta Histochemica 1.74 第26百分位
#195
Brazilian Journal of Medical and Biological Research 1.69 第26百分位
#196
Cellular Reprogramming 1.66 第25百分位
#197
Journal of Molecular Signaling 1.65 第25百分位
#198
Biopreservation and Biobanking 1.63 第25百分位
#199
Molecular and Cellular Probes 1.61 第24百分位
#200
Pathobiology 1.61 第24百分位
#201
Blood Cells, Molecules, and Diseases 1.59 第23百分位
#202
In Vitro Cellular and Developmental Biology - Animal 1.59 第23百分位
#203
Indian Journal of Experimental Biology 1.57 第23百分位
#204
Cell Biochemistry and Biophysics 1.55 第22百分位
#205
Physical Biology 1.54 第22百分位
#206
Journal of Receptor and Signal Transduction Research 1.53 第22百分位
#207
Cellular and Molecular Biology Letters 1.52 第21百分位
#208
Current Protocols in Cell Biology 1.51 第21百分位
#209
Methods in Cell Biology 1.51 第21百分位
#210
Advances in Anatomy Embryology and Cell Biology 1.48 第20百分位
#211
Current Protocols in Stem Cell Biology 1.48 第20百分位
#212
Cytotechnology 1.46 第19百分位
#213
Journal of Food Biochemistry 1.44 第19百分位
#214
Pathology Research and Practice 1.44 第19百分位
#215
Tissue and Cell 1.44 第19百分位
#216
Cell and Tissue Banking 1.41 第18百分位
#217
Anatomy and Cell Biology 1.40 第17百分位
#218
Cellular and Molecular Biology 1.40 第17百分位
#219
Cell Communication and Adhesion 1.39 第17百分位
#220
Journal of Stem Cells and Regenerative Medicine 1.29 第16百分位
#221
Journal of International Medical Research 1.26 第16百分位
#222
Bone Marrow Research 1.25 第16百分位
#223
Folia Biologica 1.23 第15百分位
#224
Synergy 1.22 第15百分位
#225
Cilia 1.13 第14百分位
#226
American Journal of Blood Research 1.12 第14百分位
#227
Cell Health and Cytoskeleton 1.10 第14百分位
#228
Journal of Biological Physics 1.06 第13百分位
#229
Acta Zoologica 1.02 第13百分位
#230
Journal of Stem Cells 1.02 第13百分位
#231
Acta Histochemica et Cytochemica 0.99 第12百分位
#232
Archives Italiennes de Biologie 0.97 第12百分位
#233
Zygote 0.96 第11百分位
#234
Biochemistry and Biophysics Reports 0.93 第11百分位
#235
Plant Cell Monographs 0.90 第11百分位
#236
Romanian Journal of Morphology and Embryology 0.89 第10百分位
#237
Biologia (Poland) 0.86 第10百分位
#238
Current Cardiovascular Imaging Reports 0.86 第10百分位
#239
IET Systems Biology 0.86 第10百分位
#240
Turkish Journal of Biology 0.85 第9百分位
#241
MCB Molecular and Cellular Biomechanics 0.83 第8百分位
#242
International Journal of Molecular and Cellular Medicine 0.80 第8百分位
#243
Journal of Investigative Dermatology Symposium Proceedings 0.69 第8百分位
#244
Stem Cell Investigation 0.65 第7百分位
#245
Journal of Hard Tissue Biology 0.62 第7百分位
#246
Journal of Receptor, Ligand and Channel Research 0.62 第7百分位
#247
Malaysian Journal of Pathology 0.58 第6百分位
#248
Current Regenerative Medicine 0.53 第6百分位
#249
Genomics Insights 0.50 第5百分位
#250
Journal of Biological Sciences 0.50 第5百分位
#251
Reproductive Medicine and Biology 0.47 第5百分位
#252
Biochemistry (Moscow) Supplement Series A: Membrane and Cell Biology 0.43 第4百分位
#253
Cytologia 0.42 第4百分位
#254
Nucleus (India) 0.40 第3百分位
#255
Cell and Tissue Biology 0.31 第3百分位
#256
Biologicheskie Membrany 0.23 第3百分位
#257
Genes and Cells 0.21 第2百分位
#258
Journal of Mammalian Ova Research 0.21 第2百分位
#259
Biocell 0.17 第2百分位
#260
Journal of Morphological Sciences 0.15 第1百分位
#261
Anales de la Real Academia Nacional de Farmacia 0.13 第1百分位
#262
Annals of the Romanian Society for Cell Biology 0.09 第0百分位
#263
Biochemical and Cellular Archives 0.03 第0百分位
#264
Journal of Cellular Neuroscience and Oxidative Stress 0.00 第0百分位

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