肺腺癌 RNA 结合蛋白相关预后模型的开发和验证。
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Abstract:
: RNA 结合蛋白 (RBPs) 失调在多种恶性肿瘤中均有报道，并与癌症的发生发展相关。然而，RBPs 在肺腺癌 (LUAD) 中的作用知之甚少。我们从癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库中下载了 LUAD 的 RNA 测序数据，并确定了正常和癌组织之间不同表达的 rbp。该研究随后通过一系列生物信息学分析系统研究了这些 rbp 的表达和预后价值。共鉴定出 223 个不同表达的 RBPs，包括 101 个上调和 122 个下调的 RBPs。确定 8 个 RBPs (IGF2BP1 、 IFIT1B 、 PABPC1 、 TLR8 、 GAPDH 、 PIWIL4 、 RNPC3 和 ZC3H12C) 为预后相关 hub 基因，并用于构建预后模型。进一步的分析表明，与基于模型的低风险亚组相比，高风险亚组的患者总生存期 (OS) 较差。预后模型的时间依赖性受试者操作者特征曲线下面积在 TCGA 队列中为 0.775，在 GSE31210 队列中为 0.814，证实了良好的预后模型。我们还在 TCGA 队列中建立了基于 8 个 RBPs mRNA 和内部验证的列线图，对肺腺癌显示出良好的判别能力。
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Aging-US
AGING-US
| 最新影响因子：4.831 | 期刊ISSN：1945-4589 | CiteScore： |
| 出版周期：Monthly | 是否OA：YES | 出版年份：2008 |
期刊官方网址：http://www.aging-us.com/
期刊投稿地址：http://aging.msubmit.net/
| 自引率：7.40% | 研究方向：CELL BIOLOGY- |
| 出版地区：UNITED STATES |
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