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短小芽孢杆菌 BA06 中鉴定的一个新的 DNA 甲基化基序及其在基因表达调控中的可能作用。

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Abstract:

: 单分子实时 (SMRT) 测序可用于鉴定基因组的各种化学修饰,如甲基化。在这里,我们应用这种方法来鉴定短小芽孢杆菌 ba06 基因组中的 N6-methyl-adenine (m6A) 和 N4-methyl-cytosine (m4C) 修饰。确定了 I 型限制性修饰系统 (R-M) 的典型甲基化识别基序,5 '-TCm6AN8TTGG-3'/3 '-AGTN8m6AACC-5'。我们使用 REBASE 分析证实该 motif 是一个新的 I 型甲基化位点,并且它被 I 型 R-M 系统 Bpu6ORFCP 识别, 根据体内和体外甲基化敏感性试验。此外,我们发现 R-M 系统 Bpu6ORFCP 的缺失诱导了许多基因的转录变化,并导致与 ABC 转运蛋白、硫代谢、核糖体、半胱氨酸和蛋氨酸的代谢与淀粉和蔗糖的代谢有关,提示 R-M 系统在 B。Pumilus BA06 除了保护 B.pumilus BA06 基因组免受外源 DNA 的影响外,还有其他重要的生物学功能。

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APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY

APPL MICROBIOL BIOT
最新影响因子:3.53 期刊ISSN:0175-7598 CiteScore:3.64
出版周期:Semimonthly 是否OA:YES 出版年份:1984

期刊官方网址:http://www.springer.com/chemistry/biotechnology/journal/253

期刊投稿地址:http://www.editorialmanager.com/amab/

自引率:6.30% 研究方向:工程技术-生物工程与应用微生物
出版地区:GERMANY

SCI期刊coverage:Science Citation Index Expanded(科学引文索引扩展)

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APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY 期刊简介

英文简介:

Applied Microbiology and Biotechnology focusses on prokaryotic or eukaryotic cells, relevant enzymes and proteins; applied genetics and molecular biotechnology; genomics and proteomics; applied microbial and cell physiology; environmental biotechnology; process and products and more. The journal welcomes full-length papers and mini-reviews of new and emerging products, processes and technologies.

中文简介:(来自Google、百度翻译)

应用微生物学和生物技术主要研究原核或真核细胞、相关酶和蛋白质;应用遗传学和分子生物技术;基因组学和蛋白质组学;应用微生物和细胞生理学;环境生物技术;过程和产品等等。该杂志欢迎新产品、新工艺和新技术的长篇论文和小型评论。

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Microbial Cell Factories 4.20 第86百分位
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Applied and Environmental Microbiology 3.99 第84百分位
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Molecular Biotechnology 1.75 第47百分位
#51
Mycopathologia 1.75 第47百分位
#52
Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology 1.72 第45百分位
#53
Journal of Basic Microbiology 1.61 第44百分位
#54
Annals of Microbiology 1.57 第43百分位
#55
Canadian Journal of Microbiology 1.52 第42百分位
#56
Current Microbiology 1.48 第41百分位
#57
International Journal of Medicinal Mushrooms 1.38 第40百分位
#58
Biotechnology and Applied Biochemistry 1.37 第39百分位
#59
Avicenna Journal of Medical Biotechnology 1.30 第37百分位
#60
Biotechnology and Bioprocess Engineering 1.30 第37百分位
#61
Bioscience, Biotechnology and Biochemistry 1.26 第36百分位
#62
Journal of General and Applied Microbiology 1.06 第34百分位
#63
Polish Journal of Microbiology 1.06 第34百分位
#64
Water S.A. 1.06 第34百分位
#65
Applied Food Biotechnology 1.03 第31百分位
#66
Bioengineered 1.03 第31百分位
#67
Food Biotechnology 0.95 第29百分位
#68
Health and Technology 0.95 第29百分位
#69
Recent Patents on Biotechnology 0.92 第27百分位
#70
Food Science and Biotechnology 0.90 第26百分位
#71
Current Cardiovascular Imaging Reports 0.86 第25百分位
#72
Journal of the American Society of Brewing Chemists 0.86 第25百分位
#73
Microbiology 0.84 第23百分位
#74
Biocontrol Science 0.77 第22百分位
#75
BrewingScience 0.77 第22百分位
#76
Emirates Journal of Food and Agriculture 0.74 第20百分位
#77
Applied Biochemistry and Microbiology 0.69 第19百分位
#78
Korean Journal of Food Science and Technology 0.60 第18百分位
#79
Journal of Insect Biotechnology and Sericology 0.52 第17百分位
#80
Indian Journal of Biotechnology 0.51 第16百分位
#81
Microbiology and Biotechnology Letters 0.38 第15百分位
#82
Minerva Biotecnologica 0.36 第14百分位
#83
Chinese Journal of Applied and Environmental Biology 0.35 第13百分位
#84
Shengwu Gongcheng Xuebao/Chinese Journal of Biotechnology 0.22 第12百分位
#85
Biotecnologia Aplicada 0.21 第11百分位
#86
Research Journal of Biotechnology 0.19 第10百分位
#87
Journal of Pure and Applied Microbiology 0.14 第8百分位
#88
Chinese Journal of Biologicals 0.09 第7百分位
#89
Asian Journal of Microbiology, Biotechnology and Environmental Sciences 0.07 第6百分位
#90
Vitae 0.05 第5百分位
#91
Asian Biotechnology and Development Review 0.04 第4百分位
#92
Chinese Journal of Pharmaceutical Biotechnology 0.03 第3百分位
#93
Taiwanese Journal of Agricultural Chemistry and Food Science 0.02 第2百分位
#94
Australasian Biotechnology 0.01 第1百分位
#95
Seibutsu-kogaku Kaishi 0.01 第1百分位

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