与子宫内膜癌进展和预后相关的分子标志物的鉴定: 一项生物信息学研究
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【摘要】背景子宫内膜癌 (EC) 是女性癌症的一种。生物信息学技术可以筛选出相关基因,使靶向治疗成为常规治疗。方法从 GEO 下载 GSE17025。基因组数据和临床数据来自 TCGA。R 软件和 bioconductor 包用于鉴定 DEGs。Clusterprofiler 用于功能分析。使用 STRING 评估 PPI 信息和插件 MCODE 筛选 Cytoscape 中的 hub 模块。选择的基因进行功能分析。CMap 可以找到可能具有潜在作用的 EC 相关药物。进行单变量和多变量 Cox 比例风险回归分析以预测每个患者的风险。Kaplan-Meier 曲线分析可比较生存时间。进行 ROC 曲线分析以预测基因的价值。完成了 TCGA 数据库中的突变和生存分析以及 UALCAN 验证。免疫组织化学染色来自人蛋白图谱数据库。还进行了 GSEA 、 ROC 曲线分析、 Oncomine 和 qRT-PCR。结果功能分析显示,上调的 DEGs 显著富集趋化因子活性,糖胺聚糖结合中 DEGs 下调。PPI 网络提示 NCAPG 是最相关的蛋白。CMap 确定了 10 个小分子作为可能的药物来治疗 EC。Cox 分析显示 BCHE 、 MAL 、 ASPM 与 EC 预后相关。TCGA 数据集分析显示显著突变的 BHCE 与 EC 预后呈正相关。在 UALCAN 中进一步验证了 MAL 和 ASPM。所有结果表明,这两个基因可能促进 EC 进展。免疫组化结果证实了 ASPM 的轮廓。ROC 曲线显示两个基因的 mRNA 水平在正常和肿瘤组织之间表现出差异,表明它们的诊断效率。QRT-PCR 结果支持上述结果。Oncomine 结果显示 MAL 的 DNA 拷贝数变异在不同 EC 亚型中显著高于健康组织。GSEA 提示这两个基因在细胞周期中起着至关重要的作用。结论 BCHE 、 MAL 和 ASPM 是肿瘤相关基因,可作为 EC 治疗的潜在生物标志物。
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Cancer Cell International
CANCER CELL INT
最新影响因子:6.429 | 期刊ISSN:1475-2867 | CiteScore:3.36 |
出版周期:Irregular | 是否OA:YES | 出版年份:2001 |
自引率:1.60% | 研究方向:ONCOLOGY- |
出版地区:ENGLAND |
SCI期刊coverage:Science Citation Index Expanded(科学引文索引扩展)
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Cancer Cell International 期刊简介
英文简介:
Cancer Cell International publishes articles on all aspects of cancer cell biology, originating largely from, but not limited to, work using cell culture techniques. The journal focuses on cancer studies reporting data from biological experiments performed on cells grown in vitro, in two- or three-dimensional systems, and/or in vivo (animal experiments). These types of experiments have provided crucial data in many fields, from cell proliferation and transformation, to epithelial-mesenchymal interaction, to apoptosis, and host immune response to tumors. Cancer Cell International also considers manuscripts reporting translational cancer research studies where in vitro discoveries are bridged to the clinic. As such, Cancer Cell International is interested in laboratory and animal studies reporting on novel biomarkers of tumor progression and response to therapy and on their applicability to human cancers. As an established journal, Cancer Cell International publishes many interesting articles from all over the world. It serves a particular need where wide communication of data is required, especially from countries that have a lower profile than many Western countries in biomedical publishing.
中文简介:(来自Google、百度翻译)
《癌细胞国际》发表了有关癌细胞生物学各个方面的文章,主要来源于但不限于使用细胞培养技术的工作。 该杂志关注癌症研究,报告了在体外、二维或三维系统和/或体内(动物实验)生长的细胞的生物学实验数据。这些类型的实验在许多领域提供了重要的数据,从细胞增殖和转化,到上皮间充质相互作用,到细胞凋亡,以及宿主对肿瘤的免疫反应。 《癌细胞国际》还考虑了报告转化性癌症研究的手稿,在这些研究中,体外发现被桥接到了临床。因此,国际癌症细胞组织(Cancer Cell International)对实验室和动物研究感兴趣,这些研究报告了肿瘤进展和治疗反应的新生物标志物,以及它们对人类癌症的适用性。 《癌细胞国际》作为一本公认的杂志,发表了许多来自世界各地的有趣文章。在需要广泛的数据交流的地方,特别是在生物医学出版方面,比许多西方国家的知名度要低的国家,它满足了特殊的需要。
Cancer Cell International 期刊中科院评价数据
最新中科院分区
大类(学科) | 小类(学科) | 学科排名 |
医学 |
ONCOLOGY (肿瘤学) 3区 |
74/223 |
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年度总发文量 | 年度论文发表量 | 年度综述发表量 |
118 | 108 | 10 |
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Cancer Cell International 期刊CiteScore评价数据
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1 |
大类(学科):Medicine
小类(学科):Oncology
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#82/325
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2 |
大类(学科):Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
小类(学科):Genetics
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3 |
大类(学科):Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
小类(学科):Cancer Research
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最新评论(不代表本站观点)
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liting7111
审稿时间: 2个月内 接受率: 中等(50%命中)
投稿后,竟然分配了6个审稿人审稿。2020-05-11 -
liting7111
研究方向:肿瘤 乳腺癌
审稿时间: 2个月内 接受率: 中等(50%命中)
10月21号投稿,修了一次,12月10号就接收了,效率还是可以的,就是国人投稿很多。2020-03-01 -
liting7111
研究方向:肿瘤
审稿时间: 3个月内 接受率: 一般容易(75%命中)
我是在6月份投稿的,10月份要求修改,因为其他事情耽误了下,到一月接受了,交完费就出版了,后期速度很快。2020-02-16 -
liting7111
投稿到接受只花了两个月时间,感觉还可以啊。2020-01-28 -
liting7111
接受率: 中等(50%命中)
投稿后初审一个月,小修不到一周就接收了,杂志很给力!2020-01-25 -
liting7111
研究方向:妇科肿瘤
审稿时间: 2个月内 接受率: 中等(50%命中)
因为是英国杂志,要求很严,也很严谨。版面费要1270英镑,挺贵的。投稿后严格按照审稿人意见修改,由于补实验速度比较慢,导致投回时间很长,前后十个月,大修两次补了五个实验,小修五次。2019-07-03 -
liting7111
研究方向:肿瘤
投稿后一审一个月时间,给了小修,修回去意见两个月了,就没消息了,状态一直显示reviews completed,希望能快点接受。2019-06-05
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