头颈癌驱动基因的性别差异: TCGA 数据集的分析。
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Abstract:
目的: 头颈部鳞状细胞癌 (HNSCC) 的生存率与患者性别相关，通常男性预后较差。目前还不清楚这种差异是否基于不同的肿瘤生物学。我们分析了 TCGA HNSCC 队列，以发现男性和女性之间体细胞单核苷酸变异 (SNV) 、拷贝数改变 (CNA) 和 mRNA 丰度谱的差异。至关重要的是，我们通过肿瘤 HPV 状态对我们的结果进行分层，以控制这种显著的混杂因素。 方法: 分别比较 HPV 阳性 (n = 67) 和阴性 (n = 431) TCGA HNSCC 队列中男性和女性的 SNV 、 CNA 和 mRNA 丰度差异。比较了 HPV 阳性和 HPV 阴性患者亚群中男性和女性的总生存结局。 结果: 发现女性的总生存率比男性差 (p = 0.048)，这主要是由于男性 HPV 阳性率较高。SNV 分析显示，在 HPV 阳性疾病中，解释了假发现率 (FDR) 后，性别无差异。在 HPV 阴性肿瘤中，校正 FDR 后，女性患者肿瘤中 BRWD3 突变的发生率高于男性 (p = 0.02)。此外，多变量分析发现 HPV 阴性 BRWD3 突变肿瘤与野生型相比，5 年总生存率显著更差 (p = 0.02)。有 88 个杂合缺失和 14 个扩增在男性和女性 HPV 阴性肿瘤之间存在差异改变，并与表达变化相关。对这些基因的通路分析发现，来自男性的肿瘤富集了包括趋化因子和磷酸肌醇信号的 5 条通路。 结论: 对按性别分层的 TCGA HNSCC 数据集进行再分析发现，由于 HPV 阳性疾病比例较高，该队列中的男性具有显著的生存优势。BRWD3 突变在女性 HPV 阴性肿瘤中更常见，且与较差的总生存期相关。BRWD3 可能代表了患者结局的一种新型生物标志物，但需要额外的验证。
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ORAL ONCOLOGY
ORAL ONCOL
| 最新影响因子：5.972 | 期刊ISSN：1368-8375 | CiteScore：3.68 |
| 出版周期：Monthly | 是否OA：YES | 出版年份：1997 |
| 自引率：8.40% | 研究方向：医学-牙科与口腔外科 |
| 出版地区：ENGLAND |
SCI期刊coverage：Science Citation Index Expanded（科学引文索引扩展）
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ORAL ONCOLOGY 期刊简介
英文简介：
Oncogene covers all aspects of the structure and function of oncogenes, especially: Cellular oncogenes and their mechanism of activation Structure and function of their encoded proteins Oncogenes of the DNA and RNA tumour viruses The molecular oncology of human tumours Tumour suppressor genes Growth regulatory genes Cell cycle control Growth factors and receptors Apoptosis.
中文简介：（来自Google、百度翻译）
由爱思唯尔科学出版。国际标准书号：1368-8375。 口腔肿瘤学是一种国际性跨学科期刊，首次汇集了口腔和口腔周肿瘤的发病机制、流行病学、预防和管理以及恶性肿瘤患者口腔疾病的相关问题。请就下列方面发表论文：唇、舌、口、唾液腺、咽部及相关骨骼、软组织和淋巴腺的癌症。（1）口腔癌和癌前自然史，基本病理学，近静态机制。（2）诊断和预后的细胞和分子标记物、癌基因、病毒、生长因子和粘附分子。（三）流行病学、危险因素、预防、筛查和干预。（四）影像学及其他功能性诊断方法的研究进展。（5）外科进展、激光、光动力疗法、Cyro手术、微血管手术。（6）多模式治疗、放疗、化疗、免疫治疗、基因治疗。（7）重建与康复、移植物移植、同种异体移植、骨与结缔组织生物学、骨放射性坏死等方面的进展。（8）癌症护理、生活质量、护理、言语和吞咽疗法、营养、咨询、疼痛控制、终末期护理方面的团队合作。（9）局部和远处肿瘤的口腔效应及其治疗。研究数据可以以论文、简短的交流或信函的形式提交。《华尔街日报》将考虑精心设计的研究得出的负面结果，这些研究可能会以简短的交流或信件的形式发表。信件可以作为简短的交流发表。还邀请对先前发表在同一期刊上的文章发表评论或表达有关肿瘤学观点的信件。所有发表的论文和简短的交流，以及包含研究数据的精选信件都经过同行评审。
ORAL ONCOLOGY 期刊中科院评价数据
最新中科院分区
| 大类(学科) | 小类(学科) | 学科排名 |
| 医学 |
DENTISTRY, ORAL SURGERY & MEDICINE (牙科与口腔外科) 1区 ONCOLOGY (肿瘤学) 2区 |
3/91 55/223 |
最新公布的期刊年发文量
| 年度总发文量 | 年度论文发表量 | 年度综述发表量 |
| 243 | 209 | 34 |
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ORAL ONCOLOGY 期刊CiteScore评价数据
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文献(2015-2017)
2460次引用
668篇文献
CiteScore排名
| 序号 | 类别 | 排名 | 百分位 |
| 1 |
大类(学科)：Dentistry
小类(学科)：Oral Surgery
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#2/43
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| 2 |
大类(学科)：Medicine
小类(学科)：Oncology
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#69/325
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|
| 3 |
大类(学科)：Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
小类(学科)：Cancer Research
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#60/191
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liting7111
研究方向：肿瘤 癌症
审稿时间： 2个月内 接受率： 中等（50%命中）
一月份投稿，一个月后第一次反馈意见，修了两次，第一次修回后外审，二审修回后十天杂志社接收，前后三个月。2020-05-09 -
liting7111
研究方向：肿瘤 癌症
这本杂志优点之一就是拒稿速度快，一般如果文章不行的话，一周就会通知你。我之前有篇三天就被拒稿了，最近接收的一篇，with editor两哥星期，外审一个月，修回一周就接收。对编辑的要求要认真对待，信息给全还是很容易接收的。2020-05-03 -
liting7111
研究方向：头颈肿瘤 meta分析
审稿时间： 3个月内
投搞两天开始审稿，两个月不到返回意见，大部分问题比较简单，有些回答不了的也认真回复原因，大修修回两周接收。2020-04-03 -
liting7111
审稿时间： 2个月内 接受率： 中等（50%命中）
投稿后一个月要求修改，还是挺快的。2020-03-04 -
liting7111
研究方向：肿瘤 癌症
3月初投稿，现在都月底了，还在 with editor这是什么情况啊，还要等多久啊？2020-02-06 -
liting7111
审稿时间： 2个月内 接受率： 比较困难（25%命中）
杂志基本比较喜欢好的好结果，如果结果是比较负面的，基本不会送审，三五天编辑就会直接拒稿。2019-07-15 -
liting7111
研究方向：肿瘤 癌症
审稿时间： 2个月内 接受率： 比较困难（25%命中）
杂志要求高，整理好材料发过去两个月，有四个审稿人给了意见，最后被拒稿了。2019-01-26 -
liting7111
研究方向：肿瘤 癌症
投稿一篇，稿件现在还在with editor，不知道需要多久？2019-01-05
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