基于构建 ceRNA 调控网络的膀胱癌相关特征生物分子的筛选
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Abstract:
目的本研究的目的是通过结合 lncRNA 、 miRNA 和膀胱癌 mRNA 表达谱筛选膀胱癌相关生物标志物, 并通过构建 ceRNA 调控网络探索膀胱癌相关肿瘤标志物。方法从 TCGA 数据库下载膀胱癌 mRNA 和 miRNA 样本; 使用 HUGO 基因命名委员会数据库鉴定 RNA-seq 表达谱中检测到的 lncRNA 和 mRNA。结果筛选显著差异表达 RNA 产生 1693 个 mRNAs 、 66 个 lncRNAs 和 130 个 miRNAs。然后,对来自筛选的显著不同表达的 rna 进行 GO 功能节点和 KEGG 信号通路的注释分析。通过合成 lncRNA-miRNA 和 miRNA-mRNA 构建了由 lncRNA-miRNA-mRNA 组成的 ceRNA 调控网络。最后,获得了由两个 lncRNAs 、一个 miRNA 和三个 mRNAs 组成的 ceRNA 调控网络。对每个因素进行 KM 重塑曲线分析。结论在膀胱癌肿瘤样本中,LINC01198 、 PPTRD-AS1 、 has-miR-216a 、 SEMA3D 、 EPHA5 、 DCLK1 下调的样本总体生存预后良好。表明这几个特征性的靶分子被发现是膀胱癌肿瘤的高危因素。
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WORLD JOURNAL OF UROLOGY
WORLD J UROL
最新影响因子:3.661 | 期刊ISSN:0724-4983 | CiteScore:2.62 |
出版周期:Quarterly | 是否OA:YES | 出版年份:1983 |
自引率:7.10% | 研究方向:医学-泌尿学与肾脏学 |
出版地区:UNITED STATES |
SCI期刊coverage:Science Citation Index Expanded(科学引文索引扩展)
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WORLD JOURNAL OF UROLOGY 期刊简介
英文简介:
Official Journal of the Urological Research Society The World Journal of Urology conveys regularly the essential results of urological research and their practical and clinical relevance to a broad audience of urologists in research and clinical practice. In order to guarantee a balanced program articles are published to reflect the developments in all fields of urology on an internationally advanced level. Each issue treats a main topic in review articles of invited international experts.
中文简介:(来自Google、百度翻译)
《世界泌尿学杂志》定期向广大泌尿科医生介绍泌尿学研究的基本成果及其在临床和研究中的实际意义。为了保证一个平衡的计划文章发表,以反映在国际先进水平的泌尿学各领域的发展。每一期都在邀请的国际专家的评论文章中讨论一个主题。
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liting7111
研究方向:基础
审稿时间: 6个月内 接受率: 中等(50%命中)
审了三个月,修回两个月给拒了,说文章不符合杂志要求,真是服了。2020-03-22 -
liting7111
投稿两天后拒稿,建议转投其他杂志。2019-12-23
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