下一代测序数据的质量控制研究

目的：对下一代测序数据质量控制的几个主要问题进行分析，设计数据清理和质量控制软件，为下游的数据分析提供保障。方法基于Bioconducter 软件包，开发了一个数据清理软件（ Fastq_clean ）。结果该软件在一组已发表的菊花转录组数据集上测试，得到了清理后的测序数据，同时输出了质量控制信息。结论该软件在充分利用Illumina序列特征的基础上，可以非常精确地去除低质量残基、接头、rRNA和病毒等污染，大限度保留了高质量数据。

中国人群肺结核发病危险因素的荟萃分析

目的：研究我国肺结核发病的主要危险因素，为今后肺结核的防治工作提供方向和依据。方法利用荟萃（ Meta）分析的方法对2000～2012年国内外关于中国人群肺结核发病危险因素的25篇研究文献进行定量综合分析。结果肺结核接触史、吸烟、婚姻状况、人际交往、卡痕、卡介苗接种史、低体质量指数（ BMI ）、结核病家族史、工作暴露于粉尘环境和接触化学气雾的合并OR值（95％CI）分别为3．14（2．74～3．59），1．23（1．14～1．33），3．05（2．10～4．45），2．08（1．76～2．26），0．39（0．32～0．47），0．58（0．46～0．73），2．95（2．40～3．64），2．56（1．82～3．59），2．58（2．04～3．26），4．81（1．99～11．60）。结论肺结核接触史、吸烟、单身、人际交往频繁、低BMI、结核病家族史、工作暴露于粉尘环境和接触化学气雾是肺结核患病的危险因素，卡痕和卡介苗接种史是肺结核患病的保护因素。

一起肺炎支原体感染暴发疫情的流行病学调查分析

目的：调查分析某部发生的一起肺炎支原体感染暴发疫情的流行特征和防控效果，提出进一步防控建议。方法采用流行病学现况研究方法，对所有病例的基本特征、临床表现和聚集性活动等进行个案调查。根据血清学检查和流行病学调查结果判定肺炎支原体感染情况。结果在2013年5月16日至2013年6月11日期间，某部队共出现49名确诊病例和38名疑似病例，均为男性，总体罹患率为7．8％。疫情高峰时间段为5月27日至6月2日（7 d），病例总数66人（占75．9％）。在疫情暴发期间，学兵10队、其他学兵队和非学兵队人群的罹患率分别为47．5％、4．5％和1．2％，其差异具有统计学意义（P＜0．01）。49名确诊患者年龄为17～26岁，不同年龄组人群罹患率无统计学差异。患者籍贯和兵源地无明显聚集性。感染病例常出现的临床症状为发热和咳嗽，62．5％确诊病例出现了单侧或双侧肺部炎性改变，肺部阳性体征少见。所有确诊病例均住院治疗，无重症或危重病例出现。在采取病例监测、隔离观察、取消密集性活动、分散居住以及预防性服用阿奇霉素等防控措施之后，疫情得到有效控制。结论封闭、密集的学习和训练部队易出现肺炎支原体感染暴发，有必要进一步提高防病意识，加强病例管理，尽量分散居住，减少密集活动，落实个人卫生制度。

基于差异蛋白质组学技术解析xCT缺陷诱导的细胞死亡机制

目的：对Sut黑色素细胞和野生型黑色素细胞进行高分辨率差异蛋白质组学分析，探讨xCT缺陷引起细胞生长抑制的机制。方法分离Sut黑色素细胞和野生型黑色素细胞总蛋白，进行双向电泳和串联质谱分析，获得数值经Mascot软件处理后通过NCBI及Swiss-Prot蛋白质数据库检索，结合双向凝胶电泳相应点的表观等电点、相对分子质量、匹配肽段的多少和序列覆盖率等综合分析筛选差异蛋白质；逆转录-PCR分析Sut细胞差异蛋白mRNA表达水平，用蛋白免疫印迹法对xCT缺陷的Sut黑色素细胞进行自体吞噬分析。结果与结论得到20个明显上调或下调的蛋白，经MALDI-TOF质谱分析鉴定差异蛋白质，发现与自体吞噬和囊泡运输相关的调控因子（ Anxa3、Hist 1h2bk、NDRG1、CaM）以及与细胞转移相关的调控因子（S100A-4、S100A-6、波形蛋白）表达发生了改变；对自噬标志蛋白分析发现，在xCT缺陷的Sut细胞中发生了自体吞噬。结果表明，xCT缺陷可能通过与细胞外基质的黏附异常以及激活Sut黑色素细胞中自噬相关的信号通路，从而导致细胞的生长抑制和自噬性死亡。

硫辛酸和左甲状腺素钠联合治疗对甲状腺功能减退大鼠认知功能和氧化应激的影响

目的：研究甲状腺素、硫辛酸及两药联合治疗对甲状腺功能减退大鼠认知功能损伤的改善，以及血清、海马组织中超氧化物歧化酶（ superoxide dismutase ， SOD）、丙二醛（ malondialdehyde ， MDA）的变化。方法成年SD雄性大鼠50只，每组10只，随机分为5组，对照组、甲减组[丙硫氧嘧啶（PTU）组]、左甲状腺素钠（L-T4）组（PTU＋L-T4组）、硫辛酸（ LA）组（ PTU＋LA组）、联合用药组（ PTU＋L-T4＋LA组）。8周后以Morris 水迷宫试验检测大鼠空间学习记忆能力，采用黄嘌呤氧化酶法测定血清和海马组织SOD活力，采用硫代巴比妥酸法测定血清和海马组织MDA含量。结果与对照组比较，PTU组定位航向实验逃避潜伏期明显延长，差异有统计学意义（P＜0．05）；空间探索能力成绩降低，但差异无统计学意义；SOD 活性降低（P＜0．001），MDA 含量升高（P＜0．001）。与 PTU 组比较，PTU＋L-T4组、PTU＋LA组、PTU＋L-T4＋LA组大鼠逃避潜伏期均缩短，SOD 活力升高，MDA 含量降低（ P＜0．05）。结论 LA和L-T4联合治疗改善氧化应激，显著改善甲状腺功能减退大鼠的认知功能。

2012～2013年军事医学科学院附属医院主要病原菌分布及耐药性分析

目的：探讨军事医学科学院附属医院感染性疾病中主要菌群分布特点及耐药现状，为临床医师经验用药提供参考依据。方法回顾性分析近1年该院住院患者病原菌的感染情况。结果3815株病原菌中，革兰阴性杆菌占63．6％，革兰阳性菌占36．4％。常见的细菌种类依次为大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、鲍氏不动杆菌、铜绿假单胞菌和表皮葡萄球菌。肠杆菌科细菌对碳青霉烯类抗生素仍高度敏感，总耐药率为2％～5％。鲍氏不动杆菌对亚胺培南和美罗培南的耐药率为60％。肺炎克雷伯菌、鲍氏不动杆菌和铜绿假单胞菌中仍有少数泛耐药株。葡萄球菌属中未发现万古霉素、替加环素和利奈唑胺耐药株。耐万古霉素屎肠球菌为9％，主要分布于呼吸重症监护、血液和肿瘤科。标本来源以痰标本为主。结论病原菌分布的科室较为集中与该院收治的患者病种有关；病原菌的检出以下呼吸道标本为主，种类繁多，细菌耐药现象较为普遍，耐万古霉素肠球菌、耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌检出率较高。

高压氧对重型颅脑损伤患者脑血流动力学及颅内压的影响研究

目的：探讨高压氧对重型颅脑损伤患者脑血流动力学及颅内压（ ICP）影响。方法采用回顾性分析方法，将解放军第三〇九医院2013年1月至2014年1月收治的82例重型颅脑损伤患者，按照1∶1比例分为两组，每组各41例，对照组给予常规治疗，观察组在对照组基础上给予高压氧持续治疗，并对两组患者治疗前后的血流动力学参数及ICP进行比较分析。结果高压氧组患者大脑中动脉收缩期峰流速（ Vs）、平均血流速度（ Vm）均快于对照组（P＜0．05），搏动指数（PI）低于对照组（P＜0．05）；观察组高压氧治疗后ICP值为（11．20±3．39）mmHg明显低于对照组的（15．24±3．13）mmHg，差异具有统计学意义（P＜0．05）；且观察组总有效率为85．37％，对照组总有效率为68．29％，明显优于对照组（ P＜0．05）。结论高压氧早期治疗可明显改善重型颅脑损伤患者的免疫功能，增强危重病患者抵抗感染能力，提高患者治疗效果，全面改善患者的预后及生活质量。

肿瘤学与军事医学关系初探

目的：初步探究肿瘤学与军事医学的关系，以消除军队肿瘤学创新发展的理论障碍。方法基于引文网络的文献证据获取。结果我军及外军都有肿瘤学的应用性研究，包括军队中的淋巴组织肿瘤问题、第二次世界大战中388名何杰金病军队患者的长期存活问题、原西德军队中的白血病问题、军队中的黑色素瘤等。外军还有一些文献特别关注了特种武器装备、特别军事行动、特殊军事环境相关的肿瘤流行病学问题，如核武器试验后的癌症问题，越南战争、海湾战争后的肿瘤发生问题。美国还设有专门的军事癌症研究所，2001～2013年共发表了206篇文献。结论密切肿瘤学与军事医学的关系，应当准确把握军队医学与军事医学的关系，充分借鉴外军发展肿瘤学的有益经验，深入挖掘肿瘤学的军事医学价值。

动态视功能差异性的探究

目的：通过检测前庭习服前后受试者的动态视力功能，以优化和完善动态视力相关评估标准。方法应用前庭功能检查系统检测16名健康受试者静态及动态视功能。结果当向左、向右摆头速度达到一定速率时，前庭习服前后受试者动态视力存在差异。结论受试者通过前庭习服，前庭系统预刺激后敏感性降低，其动态视力变化情况明显优于习服前，前庭功能适应性锻炼及地面训练对动态视力可能存在影响。

人类辅助生殖医学中心患者管理虹膜识别系统的开发与应用

目的：开发虹膜识别在人类辅助生殖技术中的应用，建立虹膜识别辅助生殖患者登记平台和虹膜识别患者治疗管理平台。方法以虹膜作为唯一代码管理患者，通过建立虹膜识别数字化服务平台取代每次就诊繁琐的身份证和准生证验证环节，并且将生殖中心的患者基本信息、电子化治疗方案和随访记录进行集中管理。结果与结论虹膜数字化系统操作方便、快捷，较其他身份验证系统能更有效地杜绝顶替现象，顶替发生率降为零，有效预防了医疗纠纷；同时提高了工作效率，核对每位患者信息的时间由5 min缩短为20 s，减轻了医护工作负担。

自体瓣膜感染性心内膜炎治疗方案的临床分析

目的：总结自体瓣膜感染性心内膜炎（ NVE）患者的治疗经验，探讨手术时机的选择对患者感染控制、心功能恢复以及远期死亡率的影响。方法对2006年1月至2013年5月入选的80例NVE患者均应用抗生素治疗，并根据手术时机分为早期手术组38例，晚期手术组42例。同时将患者手术前、后感染相关指标，心功能指标以及术后1年、3年及5年的死亡率进行对比分析。结果早期手术组患者感染控制、心功能的恢复较晚期手术组好（P＜0．05），差异有统计学意义，而且术后3年及5年的死亡率两组比较，差异具有统计学意义。结论对于NVE患者除常规应用抗生素治疗外，早期手术组患者的治疗效果及远期生存率均明显优于晚期手术组。

人工关节假体材料表面物理特性对结核分枝杆菌黏附的影响研究

目的：探讨不同人工关节假体材料表面物理特性对结核分枝杆菌（ MTB ）黏附的影响。方法以表面抛光涂层、钛涂层和羟基磷灰石涂层为实验材料，对材料进行表面形貌分析以及表面粗糙度、接触角和表面能的测定。选用MTB为研究菌株，体外共培养法培养，通过扫描电镜对MTB的形态、在材料表面的黏附情况和黏附量进行观察。综合评价人工关节假体材料的表面物理特性对细菌增殖和黏附的影响。结果钛涂层和羟基磷灰石涂层材料表面为疏水性材料，抛光涂层为亲水性材料，接触角及表面能存在显著性差异（P＜0．05）。细菌培养过程中3种材料菌液的D值无显著性差异（P＞0．05）。 MTB在钛涂层介面黏附量多，羟基磷灰石涂层次之，抛光涂层介面低，且各种材料间差异有统计学意义（P＜0．05）。结论 MTB在人工关节假体材料表面的黏附与其表面物理特性有关，在粗糙度高及疏水性低的材料表面有较高的黏附性。

星点设计-效应面法优化琥珀酸美托洛尔缓释微丸处方

目的：通过星点设计-效应面法优化琥珀酸美托洛尔（ MS）缓释微丸处方工艺。方法采用蔗糖丸芯，以乙基纤维素为包衣材料，模型药物MS为致孔剂，通过流化床底喷工艺制备MS缓释微丸。以致孔剂比例和包衣增重为考察因素（自变量），微丸1，4，8，12，16 h的释放度为考察指标（因变量），采用两因素五水平星点设计对处方进行优化。根据自变量和因变量数据，进行数学方程拟合并描绘效应面，选择佳处方工艺进行验证实验。结果与结论数学方程拟合结果表明二项式方程拟合度较高。根据效应面优化的佳自变量范围可知，致孔剂比例为16％～18％，包衣增重为20％～25％。优化的缓释微丸药物释放度1 h达到9．15％，消除了释放初期的迟滞相，且能够在较长时间内维持良好的缓释作用。通过星点设计-效应面法优化的MS缓释微丸处方工艺稳定可行。

抗体可变区稳定性评价及其初步应用

目的：通过研究抗体轻、重链间的结合能与其构象特征、理化性质间的内在关系，建立相应的数学模型，合理评价抗体分子的热稳定性，为抗体分子的设计、合理改造及亲和力成熟奠定基础。方法采用生物信息学和计算生物学相关方法对已有晶体结构的抗体结构信息进行分析，通过距离几何学、计算机图形学技术对抗体可变区的构象特征进行研究；基于分子间氢键形成理论、反应自由能理论，从热力学、动力学对抗体分子轻、重链可变区相互作用的动态结构及能量特征进行探讨；借助统计学原理、非线性拟合、回归分析等分析手段对抗体轻、重链作用能与其构象特征、理化性质建立相关性分析。结果通过分子模拟与统计学分析，抗体的轻、重链可变区结合能与其轻、重链间的氢键形成数目、范德华作用均存在线性相关性；与抗体理化性质存在基于多项式的非线性相关性。基于关键位置氨基酸的使用频率以及建立的分析模型，针对无法获得稳定工程细胞株的抗蓖麻毒素人源化功能抗体进行合理的评价及优化，借助理论指导，获得抗蓖麻毒素人源化抗体稳定的工程细胞株。结论抗体可变区的自身结构（构象、理化性质）对其稳定性有很大影响，可以通过抗体结构优化来提高抗体的稳定性。

芥子气所致氧化应激相关生物标志物研究进展

芥子气[bis（2-chloroethyl） sulfide， sulfur mustard， SM]是一种强效化学战剂，其作用机制复杂，尚无特效解毒剂。研究芥子气的中毒机制及病理生理学变化过程，是制定合理有效的治疗方案的关键。氧化应激作为芥子气中毒后的重要病理生理学改变，是芥子气产生毒性效应的重要原因之一，对其相应生物标志物的观察和研究能够更好地揭示氧化应激在芥子气中毒中的作用，从而对揭示芥子气中毒机制及制定具有针对性的防治措施产生重要意义。该文综述了芥子气氧化应激相关标志物的研究进展。

抗菌肽的分子设计研究进展

抗菌肽是一类具有抗菌、抗病毒、抗肿瘤等生物活性的小分子多肽，与传统抗生素相比，不易产生耐药性；但因其毒性强、稳定性差、合成成本高等原因，抗菌肽还不能广泛应用于临床。为此，药物学家们对其进行了结构改造，获得了高活性、低毒性的抗菌肽。该文综述了抗菌肽分子设计的研究进展及发展方向。

利用2，3，5-三苯基氯化四氮唑（TTC）测定细胞活力的方法与应用

目的：利用细胞内脱氢酶对2，3，5-三苯基氯化四氮唑（TTC）的催化作用建立比目前常用的3-（4，5-二甲基-2-噻唑）-2，5-二苯基溴化四氮唑（噻唑蓝，MTT）法更可靠的测定细胞活力的方法。方法使用不同浓度的TTC溶液测定细胞活力，并确定TTC的有效浓度范围。在计算所测定值与细胞数量函数关系的基础上，通过与传统测定细胞活力的MTT法进行比较，分析该方法的可行性。结果0．5％～1．0％浓度范围内的TTC溶液可用来测定细胞活力，测定值与细胞数量之间存在线性关系，与MTT法得到的结果基本一致，可避免MTT法测定过程中来自于细胞培养体系中其他抗氧化物质的非特异性干扰。结论 TTC可用于测定细胞活力，可替代常规的MTT法，具有操作简便，费用经济，结果可靠等优点。

人力要素在军队重大活动食品安全保障中的作用

为保证重大活动期间的食品安全，该文探讨了在部队重大活动中，人力要素（主要由餐饮服务管理者、从业人员和监督管理者组成）所发挥的作用：三者的职责是确保重大活动食品安全保障工作顺利进行的关键；三者的工作状态对重大活动的食品安全具有重要影响；加强三者工作间的配合，各尽其职，利于重大活动保障的圆满完成。

参考文献类型及其标识