2013-2014年云南省剑川县野鼠鼠疫疫源地小肠结肠炎耶尔森菌的调查分析

目的 对剑川县野鼠鼠疫疫源地小肠结肠炎耶尔森菌分布情况调查分析.方法 从剑川采集鼠盲结肠标本进行小肠结肠炎耶尔森菌分离培养、表型鉴定和特异基因分析.结果 从采集的645份鼠类标本中,分离到34株小肠结肠炎耶尔森菌,分离率为5.27％ (34/645);其中致病株1株、非致病株33株.鼠类标本分别是大绒鼠、贝氏树嗣、褐家鼠、齐氏姬鼠、小林姬鼠等,其中大绒鼠采集率和检出率高(2.79％),其次为齐氏姬鼠(1.55％).结论 剑川县野鼠鼠疫疫源地中,小肠结肠炎耶尔森菌的主要宿主与鼠疫菌主要宿主基本一致,推测小肠结肠炎耶尔森菌的存在与鼠疫的相对静息相关.

季节性求和自回归移动平均模型在北京市房山区感染性腹泻发病趋势预测中的应用

目的 构建北京市房山区感染性腹泻发病的季节性求和自回归移动平均(seasonal autoregressive integrated moving average,SARIMA)模型并进行预测.方法 应用R3.0.1软件程序包中的TSA对2004-2013年房山区感染性腹泻月发病率构建模型,并对2014年各月感染性腹泻月发病率进行预测和评价.结果 SARIMA(0,0,2)(0,1,1)12模型较好地拟合既往时间段月发病率,对2014年发病趋势拟合平均相对误差为19.164％,对年发病率拟合平均相对误差为2.303％.结论 SARIMA(0,0,2)(0,1,1)12模型能够很好拟合感染性腹泻月发病率数据,可用于房山区感染性腹泻发病趋势的短期预测,为下一步采取针对性防控措施提供科学依据.

2004-2014年重庆市三峡库区县和非三峡库区县流行性乙型脑炎流行特征分析

目的 分析2004-2014年重庆市流行性乙型脑炎(乙脑)流行病学特征,初步了解三峡库区县和非三峡库区县乙脑的发病特征,为乙脑预防控制措施的制定提供参考依据.方法 收集“全国传染病信息报告系统”乙脑发病数据,采用描述流行病学方法,将重庆市分为三峡库区县和非三峡库区县,按2008年乙脑疫苗纳入计划免疫前后(2004-2008年、2009-2014年)分段进行乙脑发病特征的分析比较.结果 重庆市三峡库区县和非库区县乙脑年均发病率分别为0.82/10万和1.12/10万,病死率分别为3.25％和2.82％.11年间两地区发病率变化趋势相同,病例中男性均多于女性,发病均集中在7-8月,均以15岁以下病例为主(98.77％).库区县乙脑发病率从2004-2008年的1.34/10万降至2009-2014年的0.36/10万,非库区县的发病率从1.62/10万降至0.68/10万,库区县下降幅度明显大于非库区县(P＜0.01).疫苗常规接种前后非库区县的病死率分别为3.96％和0.45％,而库区县病死率分别为3.54％和2.36％.疫苗常规免疫后,0 ～ 14岁各年龄组发病率库区县除3岁和4岁年龄组外均低于0.05/10万,非库区县均低于0.10/10万.结论 重庆市三峡库区县与非库区县11年间乙脑发病趋势及季节分布与全国相近.2008年乙脑疫苗常规免疫后库区县0～14岁组发病率显著下降,提示三峡水库周边环境因素对乙脑发病未造成明显影响,库区县乙脑疫苗预防措施取得明显成效,但仍需加强易感人群保护及病例救治工作.

2015年全球疟疾防控概况

疟疾是由疟原虫引起的寄生虫病,通过传播媒介雌性按蚊叮咬传播给人类.人类疟疾疟原虫有5种,其中恶性疟原虫和间日疟原虫威胁大,难防治.恶性疟原虫在非洲大陆普遍,而且全球疟疾死亡多的是恶性疟.间日疟分布比恶性疟广泛,除了非洲,许多热带和亚热带国家都是间日疟占优势.

2015年北京一起鼠伤寒沙门菌暴发流行的病原学检测分析

2015年5月北京一家大型企业发生聚集性腹泻疫情,流行病学调查后收集现场样本,经过实验室检测确认该次疫情为鼠伤寒沙门菌暴发流行.分离到的18株鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)图谱带型一致,在北京市沙门菌PFGE数据库中未发现相同带型.药物敏感试验结果显示有一株菌株对12种抗生素耐药.这种耐药模式的出现提示需加强耐药监测.

建立检测产气肠杆菌的TaqMan荧光定量PCR和普通PCR方法

目的 建立敏感、特异的普通聚合酶链反应(PCR)方法和TaqMan荧光定量PCR方法对产气肠杆菌进行快速检测.方法 以产气肠杆菌组氨酸脱氢酶基因(hdc)为靶基因设计引物以及TaqMan FAM探针,建立对产气肠杆菌进行检测的普通PCR方法和TaqMan荧光定量PCR方法,并评价该方法的特异性、灵敏性和稳定性.结果 普通PCR和TaqMan荧光定量PCR方法均能对产气肠杆菌进行特异检测;普通PCR方法对质粒标准品和粪便模拟标本的检测下限分别为100 copies/μl和1.0×105 cfu/g,TaqMan荧光定量PCR方法对质粒标准品和粪便模拟标本的检测下限分别为33copies/μl和1.0×104 cfu/g;TaqMan荧光定量PCR方法对质粒标准品和粪便模拟标本检测的扩增曲线良好;在稳定性评价试验中,普通PCR方法的重复性良好,TaqMan荧光定量PCR方法对质粒标准品检测Ct值的组内差异为0.15％～0.98％,组间差异为0.55％～1.63％.结论 本研究建立的检测产气肠杆菌的普通PCR方法和TaqMan荧光PCR方法特异性好、灵敏度高,能够用于产气肠杆菌的快速检测.

利用基因芯片技术分析空肠弯曲菌的遗传特征

目的 为分析我国弯曲菌遗传特征,本研究根据已发表多株弯曲菌的全基因组测序特征及比对结果自行设计基因芯片,利用芯片对我国不同宿主来源菌株进行遗传特异性分析.方法 根据前期基因组水平比对分析的结果,利用Combimatrix tilingCustomArrayTM 90K芯片,设计DNA芯片.芯片包含已测序菌株ICDCCJ07001、269.97、NCTC11168、81-176、81-116和RM1221共3384个CDS的探针序列,以及空肠弯曲菌耐药及致病性相关2个质粒共80个CDS的探针序列,与脂寡糖的合成相关基因簇16种共219个CDS的探针序列、荚膜多糖合成相关基因簇7种共160个CDS的所有序列.对我国不同宿主来源27株分离菌株提取DNA,利用芯片进行杂交,获得杂交信息并分析不同菌株CDS分布特征分析及聚类特点.结果 中国菌株的主要变异区域主要存在于与脂寡糖、荚膜多糖合成相关的基因簇、鞭毛修饰相关的基因簇、DNA限制/修饰相关的基因簇以及空肠弯曲菌Mu样噬菌体基因簇.基因组水平不同来源菌株CDS分布的聚类结果没有发现显著的宿主归因特点,但GBS相关菌株脂寡糖合成相关基因组成具有共性特征.结论 通过验证以及与过去研究的比较,本次研究中的基因芯片技术结果准确可信,本研究所用基因芯片在分析空肠弯曲菌基因多态性方面具有很好的优势,可用于弯曲菌遗传特征和重要毒力因子的分析和检测.

2016年2月全国突发公共卫生事件及需关注的传染病风险评估

目的 评估2016年2月国内外突发公共卫生事件及需要关注传染病的风险.方法 根据国内外突发公共卫生事件报告及重点传染病监测等各种资料和部门通报信息,采用专家会商法,并通过视频会议形式邀请省(直辖市、自治区)疾病预防控制中心专家参与评估.结果 根据近期传染病和突发公共卫生事件监测数据,结合既往突发公共卫生事件发生情况及传染病流行特点分析,2月将是2016年突发公共卫生事件报告数少的月份.近期我国内地将继续出现人感染H7 N9禽流感以及其他亚型动物流感病毒病例的散发病例.季节性流感处于高发期,2月可能达到高峰.我国存在寨卡病毒病输入的风险;但目前我国处于冬季,伊蚊密度低,即使有病例输入,疫情传播风险低.我国依然仍存在中东呼吸综合征输入风险,但进一步播散的风险低.因取暖方式不当导致的非职业性一氧化碳中毒事件将持续高发.结论 2016年2月我国的突发公共卫生事件及传染病疫情发生态势与往年相似,处于全年低水平;需重点关注人感人禽流感、季节性流感和寨卡病毒病所引发的公共卫生风险.

云南省部分地区鼠类与人自然感染恙虫病东方体调查

目的 了解云南地区鼠类和人自然感染恙虫病东方体的情况.方法 采用鼠夹和鼠笼捕鼠,从鼠类脾脏及人血中提取DNA,应用巢式聚合酶链反应扩增恙虫病东方体(Ot) sta56基因,并进行基因序列测定分析.结果 捕获小型哺乳动物7属11种485只,收集到不明原因发热病例血液样本23份.从动物脾脏样本中检出Ot sta56基因片段2份(HHSP65和HHSP112),阳性率0.41％;序列分析显示两者同源性100％,而与中国台湾TT071 la株的同源性高为89.6％,与日本Kawasaki株的同源性为79.7％;进化树分析显示HHS65与TT0711a株不在同一分支上.从不明原因发热患者血液样本中检出Ot sta56基因片段1份(DLRX9),阳性率4.35％;序列分析显示该序列与泰国PG9和Li3b株及中国浙江Jin/2012株的同源性高,均为98.4％,与Karp株的同源性为81.9％,与HHSP65株的同源性64.8％;进化树显示DLRX9与泰国PG9和Li3b、中国浙江Jin/2012株在同一分支上.结论 病原学初步证实引发云南地区恙虫病流行的Ot不仅有Karp基因型Ot,还有新型Ot,该新型Ot可能为日本Kawasaki类似株.

2016年1月中国甲乙丙类传染病疫情动态简介

2016年1月中国部分法定传染病疫情动态摘抄

麻疹湖南省:1月报告病例25例,无死亡.报告病例数与上月持平,比2015年同期(75例)减少67％.上月及2015年同期均无死亡.1月报告病例分布在:邵阳20例(武冈市19例、城步县1例),岳阳4例(岳阳县2例,岳阳楼区、屈原管理区各1例),怀化1例(洪江市);散居儿童18例、学生5例、农民2例;0岁组8例、1岁组7例、2～7岁组6例、8～15岁组2例、15岁以上组2例;男女性别比为4∶1.

建立微量空斑减少方法测定人血清H7N9禽流感病毒中和抗体水平

目的 建立微量空斑减少的方法测定人血清中H7N9禽流感病毒中和抗体水平.方法 确定H7N9禽流感病毒感染MDCK细胞后形成空斑数目,进行病毒定量,系列稀释待测抗体,加入已定量病毒,计算病毒被抗体中和后空斑减少数目,确定中和抗体的滴度.实验中以H7N9病例血清测定该方法的灵敏度,以其他亚型流感病毒抗体阳性人群血清评估微量空斑减少方法的特异性,同时将该方法与微量中和实验进行比较分析.结果 微量空斑减少方法不仅能够检测H7 N9禽流感病例中和抗体水平,而且该方法检测季节性流感病毒抗体、H5N1和H9N2禽流感病毒抗体与H7N9禽流感病毒抗体之间均无交叉反应,与微量中和实验检测结果相一致.结论 建立的微量空斑减少方法具有较好的灵敏度和特异性,能够用于人血清H7N9禽流感病毒中和抗体的检测.

9例人感染H7N9禽流感病例流行病学特征分析

目的 分析浙江省温州市人感染H7N9禽流感病例流行病学特征,研究其流行特点、规律以及危险因素.方法 收集2015年1-4月确诊病例的流行病学以及活禽市场外环境标本结果等资料.结果 H7N9禽流感病例男3例,女6例;发病以高年龄为主(中位数为51岁);主要集中在瑞安市;职业以家务和个体经营户为主;发病主要集中在春节活禽交易频繁期间;病例以发热为主要首发症状,病情进展迅速;治愈组比死亡组更早地就诊、确诊和使用达菲.所有病例均有活禽或农贸市场暴露史;可疑暴露农贸市场外环境样本H7亚型禽流感病毒阳性率39.88％,可疑暴露非农贸市场外环境样本阳性率0,H7亚型禽流感病毒来源活禽交易的农贸市场可能性较高;病例可疑暴露农贸市场外环境样本阳性率较非可疑暴露农贸市场高,差异有统计学意义(x2=40.34,P＜0.05).农贸市场外环境H7阳性率不同月份有差异,1-3月H7阳性率较高;随着温度的上升,病毒含量下降,4月外环境H7阳性率较低,差异有统计学意义(x2=27.33,P＜0.05).温州市采取主要区域活禽市场暂停交易后,没有报告新发病例,农贸市场外环境标本H7阳性持续下降.结论 人感染H7N9禽流感患者病情进展迅速,在发病早期及时就诊、确诊和治疗,预后良好;活禽交易的农贸市场的禽类暴露是感染的危险因素;活禽市场采取休市措施能明显控制疫情发展;病例在人群中散发为主,暂无充分证据支持病毒的人与人传播.

2009年后我国北方地区流感样病例的动态预警分析

目的 探索2009年流感大流行后我国北方地区流感样病例(influenza like illness,ILI)预测预警模式,并评价预测预警效果.方法 根据2010-2014年我国北方地区ILI哨点监测数据,利用Eviews 6.0软件建立乘积季节ARIMA模型,选择适宜的时间间隔对2015年1-32周ILI占门急诊病例百分比(ILI％)进行预测.采用流行控制图法探索北方地区ILI预警模型,通过比较灵敏度、特异度和绘制ROC曲线,选择合适的预警界值,结合乘积季节ARIMA模型的预测值,进行预警并评价预警效果.结果 建立了乘积季节ARIMA模型(1,0,0)×(1,1,0)52,模型拟合度R2 =0.65,不同时间间隔预测结果中,2周时间间隔预测效果较好,且能兼顾预测时效性,模型均方根误差为0.37,平均绝对误差为0.24,平均相对误差百分比为8.26％.ILI％预警界值选用P95预警功效较好,灵敏度为100％,特异度为96％.结合ARIMA模型2周时间间隔预测结果对2015年1-32周北方地区ILI进行预测预警,结果与实报预警一致率为100％.结论 利用ARIMA模型和流行控制图结合构建的动态预警模型,能够较好反映我国北方地区ILI流行趋势,为早期发现和控制流感暴发和流行提供依据.

2014年浙江省丽水市人感染H7N9禽流感病毒分离株基因特征分析

目的 测定浙江省丽水市1株H7N9禽流感病毒8个基因序列,从分子水平分析其基因特征和遗传变异特点.方法 对入感染H7N9禽流感确诊病例标本在P3实验室进行犬肾传代细胞培养;反转录-聚合酶链反应扩增病毒8个RNA片段后测定基因序列;通过生物信息学软件将8个序列与GISAID和GenBank数据库下载的序列进行多重比对和匹配,发现基因特征,分析病毒关键位点的分子变异情况,大似然法绘制系统进化树用于基因进化分析.结果 从病例标本中分离到病毒:A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9),测序获得8个基因核苷酸全序列.HA裂解位点只包含2个碱性氨基酸,HA蛋白受体结合关键氨基酸位点发生A134T、G186V和Q226L变异;在PB2蛋白上发现E627K突变;M2蛋白上发现耐药位点S31N.LS01株HA基因与A/chicken/Zhejiang/DTID-ZJU01/2013(H7N9)的同源性高(98.90％),NA基因与A/chicken/Changzhou/C08/2013(H9N9)的同源性高(98.60％),LS01株其他6个编码内部蛋白的基因均与禽源H9N2株高度同源(99.10％ ～99.89％).LS01株HA和NA基因与沪苏浙一带流行的H7N9禽流感病毒株位于同一亚分支,有着直接的进化关系,在相近地域有进化关系较近的禽类流感病毒存在.结论 A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)株8个基因序列均符合禽源H7N9亚型禽流感病毒特征,其病原基因均为禽类来源.HA裂解位点具有低致病性禽流感病毒基因特点,Q226L和E627K位点发生变异可能与其对人具有高致病力相关.

重庆市活禽市场从业人员感染禽流感的风险调查

目的 通过对重庆市活禽市场从业人员进行人禽流感防控知识和职业防护行为调查,结合环境禽流感病毒监测结果,评价该人群感染禽流感风险,为制定该类人群人禽流感防控提供科学依据.方法 选取重庆市8个区(县)14家禽市场,采用自行设计问卷,对从业人员开展人禽流感防控知识、行为调查;用现场查看和访谈方式收集活禽市场现状与管理情况.结果 96名活禽市场从业人员人禽流感防控知识的总知晓率为18.5％,对传染源、相关疫苗、高危人群、传播途径和早期症状的知晓率分别为41.9％、21.3％、10.4％、7.3％和5.2％.主要途径为电视(94.8％)和网络(26.0％).从业人员工作时佩戴口罩、手套、工作服和防护鞋的比例分别为5.2％、13.1％、28.7％和45.2％,接触禽类后有91.7％的人用水洗手.有30.2％选择去正规医疗机构诊治,有36.8％的人会主动告知涉禽职业.活禽市场管理不到位,消费者可零距离挑选活禽.2014年在调查的活禽市场环境标本禽流感阳性率为34.7％(247/711),其中H5亚型阳性率为18.3％ (130/711)、H9亚型阳性率为16.5％ (117/711).结论 重庆市部分活禽市场未进行规范管理,从业人员人禽流感相关知识知晓率低,防护意识和行为较差,存在较高感染风险.

浙江省德清县农村成人甲型流感各亚型病毒血清抗体检测及其关联探讨

目的 了解浙江省德清县农村社区成人禽流感病毒H7N9、H9、H5、甲型H1N1、季节性H1、H3的血清抗体水平,探索各亚型流感病毒之间的关联.方法 2013年4月德清县发现2例H7N9患者,分别在急性期和恢复期检测了患者及其家属的血清抗体;利用已有的生物样本库,检测病例发生之前收集的725份血清和病例发生之后收集的503份血清的H7N9、H9、H5的抗体水平,了解疫情前后人群血清抗体水平变化情况,在503份血清中抽取398份,检测甲型H1N1、季节性H1、H3的抗体情况,探索其与其他亚型流感病毒的关系;血清检测采用血凝抑制试验(HI),H7N9、H9、H5以HI抗体滴度≥1:20为阳性,甲型H1N1和季节性H1、H3以≥1∶40为阳性,对于部分阳性和阴性样本进行复测;计算抗体阳性率和几何平均滴度,关联分析采用配对x2检验并计算关联系数r.结果 H7N9的14名密切接触者中有2人抗体阳性,阳性率为14.3％;H7N9疫情出现之前,一般人群血清中未发现H7N9抗体(0/725),疫情出现之后发现1名隐性感染者,抗体阳性率为0.2％ (1/503),H7N9疫情出现前后均未检出H5抗体,H9抗体阳性率没有明显变化,约为4.19％(22/503),标化率4.18％;甲型H1N1阳性率为4.77％(19/398),标化率5.73％;季节性H1为5.28％(21/398),标化率7.86％;季节性H3为11.31％(45/398),标化率6.28％;各个年龄组之间抗体阳性率差异无统计学意义;关联分析显示甲型H1N1血清抗体阳性者,H9血清抗体也趋于阳性(r=0.108,P＜0.05);季节性流感病毒H1、H3抗体阳性者,甲型H1N1血清抗体也趋于阳性(r=0.504,P＜0.05;r=0.111,P＜0.05).结论 德清县农村社区一般人群对H7N9和H5无免疫力,对H9、甲型H1N1和季节性H3、H1免疫保护水平有限,需要重点监测和保护.甲型H1N1和季节性流感病毒H9可能存在抗体交叉保护或共同暴露.

2013年宜春市甲型H1N1流感病毒分离鉴定及HA基因分子进化分析

目的 对2013年江西省宜春市甲型H1N1流感病毒HA基因序列及其编码的氨基酸序列进行分子进化分析,为防控甲型H1N1流感大流行和常规监测提供科学根据.方法 随机选择11株2013年宜春市疾病预防控制中心流感监测实验室分离到的甲型H1N1流感病毒毒株,提取病毒RNA,One-step RT-PCR扩增HA基因并双向测序.以世界卫生组织疫苗推荐株A/California/07/2009(H1N1)(GenBank:CY121680)和几株国内外近几年分离的流感甲型H1N1毒株的HA基因为参考序列,采用DNAStar7.0和Mega 5.0软件对HA基因及其编码的氨基酸序列进行比对,绘制分子进化树,进行HA变异分析.结果 2013年宜春市11株所测甲型H1N1流感病毒与疫苗推荐株亲缘性较近,进一步参考几株国内外近几年分离到的流感甲型H1N1毒株,HA没有发生较大变异;其HA基因序列二硫键、糖基化位点未发生变异;尽管有7株毒株同时在抗原决定簇区A区和受体结合位点130环或其附近发生单个位点氨基酸替换变异,但未形成流行病学变异新种.结论 目前的甲型H1N1流感疫苗仍对人群有保护作用,而抗原决定簇和受体结合位点的变异提示仍需要密切关注甲型H1N1流感的再次流行.

全国省级卫生行政主管部门实验室生物安全管理能力调查及分析

目的 掌握我国省级卫生行政主管部门实验室生物安全管理现况,分析问题与不足,为继续做好我国实验室生物安全管理工作提供依据.方法 利用流行病学动态数据采集平台下的实验室生物安全管理子平台进行《全国省级卫生行政主管部门实验室生物安全管理能力调查》问卷的定制和在线发布,收集信息,对反馈信息进行整理和分析.结果 25家参与应答的省级卫生行政主管部门中,96％的实验室生物安全管理职能设置在科教部门,64％的实验室生物安全管理工作有经费支持,72％的省级卫生行政主管部门成立了生物安全专家委员会,80％的省级卫生行政主管部门开展了省内菌(毒)种或者样本运输审批工作.结论 我国实验室生物安全管理工作已走上规范化、法制化道路,但仍然存在一定的问题和困难.建议各部门重视实验室生物安全管理工作,完善管理体系与制度,提高实验室生物安全意识,提升我国实验室生物安全管理水平.

2015年杭州市3～10岁儿童水痘减毒活疫苗接种情况分析

目的 评价杭州市水痘减毒活疫苗(水痘疫苗)接种情况.方法 运用浙江省免疫规划信息系统中登记在册的2005-2012年出生(3～ 10岁)的儿童水痘疫苗接种信息进行描述性及分析性流行病学分析.结果 2005-2012年杭州市共出生儿童665 288人,水痘疫苗接种率为85.78％,其中男性接种率为85.72％,女性接种率为85.84％(P=0.087).3～10岁儿童水痘疫苗接种率随年龄增长呈上升趋势(P＜0.001).本地户籍儿童接种率为85.80％,外地户籍儿童为85.74％(P=0.51).不同本地户籍儿童之间和不同外地户籍儿童之间差异均有统计学意义.老城区接种率为89.23％,新城区为84.17％,郊县市为82.78％ (P ＜0.00l).12～18月龄接种水痘疫苗的比例呈逐年递增趋势(P＜0.001),从2005年的36.96％增长到2012年的80.33％.结论 杭州市出生儿童水痘疫苗接种较及时,且接种率较高.要继续保持水痘疫苗的高接种率,进一步控制水痘疫情的发生.