国际病毒学杂志
International Journal of Virology 국제병독학잡지
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1例人感染腺病毒55型病原体的分离鉴定及进化分析
目的 对1例人感染腺病毒55型病原体进行分离鉴定及进化分析.方法 选取2015年5月安庆市某流感监测哨点医院采集的一例被诊断为急性上呼吸道感染患者的咽拭子标本作为研究样本,提取标本总核酸,采用人腺病毒通用引物进行real-time荧光定量PCR检测.将检出的阳性标本感染Hep-2细胞进行病毒分离.对成功分离的腺病毒毒株进行六邻体基因的扩增、 纯化并测序.测序结果提交GeneBank上Blast,同源分析确定型别、制作系统进化树以及分析六邻体基因和氨基酸序列. 结果 对咽拭子标本中的病毒核酸进行荧光定量PCR 检测,结果显示,腺病毒核酸DNA检测呈阳性(Ct<24).同源比对结果显示,该株的六邻体(Hexon)基因与辽宁株、江苏株、河北株、山西株、安庆株(GenBank号分别为KP896483、KX289874、KP896478、FJ643676、KP279748)的同源性可达100%,与安徽株(KC551973)可达99.96%,存在一个核苷酸C→T的无义突变.进一步的分析显示,该株与参考株在系统发生树上处于同一进化分支,Hexon蛋白氨基酸的同源性为100%. 结论 此ADR标本由人腺病毒55型感染引起,其Hexon蛋白氨基酸没有出现变异.
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2012—2017年北京市昌平区流感相关超额流感样病例数估计
目的 估计2012—2017年北京市昌平区流感相关的超额流感样病例数(influenza-like illness cases,ILI).方法 使用昌平区二级及以上医疗机构ILI监测数据,分别拟合传统Serfling回归模型和调整Serfling回归模型,分年龄组估计流感相关超额ILI数.结果 调整Serfling回归模型结果显示,全人群中,2012—2013年度的流行周为2012年的第52周至次年的第2周、2013—2014年度为2013年的第52周至次年的第6周、2014—2015年度为2014年的第46周至次年第3周、2015—2016年度为2015年的第52周至次年第14周、2016—2017年度为2016年的第47周至次年第6周,年均流行周数为10(范围:4~15)周.各年度流行周的超额流感样病例数分别为598(95% CI:207~719)、1 517(95% CI:1 070~1 964)、2 883(95% CI :2 243~3 522)、5 027(95% CI:4 067~5 986)和3 126(95%CI:2 291~3 961)例,年均超额ILI数为2 630(95%CI:1 976~3 230)例,占同期总ILI监测数的58.7%.传统Serfling回归模型估计<5岁、5~59岁和全人群的结果基本一致.结论 调整Serfling回归模型对于超额ILI的估算结果较传统Serfling模型更为精确.每个流行季,流感的流行均导致数千人至数万人的超额ILI数和门急诊就诊量.
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2015—2017年上海市浦东新区H3N2亚型流感病毒流行特征与基因变异分析
目的 了解2015—2017年上海市浦东新区甲型H3N2亚型流感病毒流行特征及血凝素(HA)基因变异情况. 方法 收集2015年1月至2017年7月5 436份在上海市浦东新区两所国家级流感监测哨点医院采集符合流感样病例(ILI)定义的鼻咽拭子标本,使用荧光定量PCR进行常见流感亚型检测,核酸阳性样本进行MDCK细胞培养.选取275株甲型H3N2亚型病毒分离株进行HA基因测序,对比同期中国香港流行代表株和世界卫生组织(WHO)推荐疫苗株基因序列,分析关键氨基酸位点替换情况. 结果 流感病毒检出率为22.9%(1 245/5 436),其中54.5%(678/1 245)为甲型H3N2亚型.275株甲型H3N2亚型有效测序毒株HA基因分成3C.2a和3C.3a等2个主分枝,96.0%(264/275)毒株位于3C.2a分枝上,其中62株位于3C.2a1新分枝上;氨基酸替换位点主要为N121K,替换率为10.5%(29/275),在3C.2a1亚分枝中携带N121K替换位点的2017年毒株高达94.1%.结论 甲型H3N2亚型是上海市浦东新区2015—2017年流行的主要流感亚型,其HA基因位点改变带来的基因漂移是造成流行高峰的主要原因.
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2012—2016年扬州市手足口病流行病学和基因特征分析
目的 了解扬州市2012—2016年手足口病流行病学及病原学变化特点,为本地区防控手足口病提供科学依据. 方法 收集2012—2016年中国疾病监测信息系统报告的手足口病病例,对其流行特征进行分析;收集扬州市哨点医院手足口病病例样本,进行病毒核酸检测. 结果扬州市2012—2016年共报告手足口病35 720例,年均发病率为155.30/10万(35 720/2 300万),男女性别比为1.54︰1,重症构成比为1.60‰(56/35 720),死亡病例2例.病例以5岁以下儿童为主,占91.83%(32 800/35 720).职业分布以散居儿童(60.18%,21 498/35 720)为主,其次为托幼儿童(35.93%,12 834/35 720).全年均可发病,发病高峰主要集中在每年5至7月和10至12月;其中2012、2014和2016年发病率较高,2013和2015年发病率较低.2012—2016年病原学监测结果显示,普通病例柯萨奇病毒A16型(Cox A16)占33.28%(432/1 298),肠道病毒71型(EV71)占28.58%(371/1 298),其他肠道病毒占38.14%(495/1 298);重症病例主要以EV71(76.79%,43/56)为主,且重症病例EV71阳性率高于普通病例(1.05%,13/1 242),差异有统计学意义(x2=66.62,P<0.01). 结论 扬州市手足口病的发生存在明显季节性及性别、年龄、职业、地区差异,且疫情呈现高发年与低发年交替的规律,病原主要为Cox A16、EV71,重症病例以EV71为主.应根据发病规律加强对手足口病流行病学和病原学监测,尤其是对EV71的监测,预防重症病例的出现.
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一起幼儿园札如病毒感染所致急性胃肠炎聚集性疫情调查
目的 对一起幼儿园急性胃肠炎聚集性疫情进行调查,为明确病因及有效控制疫情提供参考依据.方法 2016年10月16日对北京市某幼儿园出现呕吐、腹泻症状的患者进行调查,调查内容包括发病前3 d的病例接触史、同住人员发病情况、发病前72 h饮食饮水史、其他可疑食物摄入情况、疫苗接种史及生活习惯等;制定病例定义,设对照组,病例组和对照组均采集粪便标本进行实验室检测,检测方法为荧光定量RT-PCR法.结果 共发现14名病例,均在一个班级;其中,幼儿13例,教师1例.13份粪便标本中,诺如病毒、轮状病毒、星状病毒、腺病毒检测结果均为阴性,9份标本札如病毒核酸检测阳性,阳性率为69.2%.对照组11份标本中,1份粪便标本札如病毒核酸检测阳性,阳性率为9.1%.病例组和对照组札如病毒核酸检测阳性率差异有统计学意义(Fisher确切概率法,P=0.005).结论 本次疫情为一起由札如病毒引起的急性胃肠炎聚集性疫情.
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2016—2017年流感流行季北京市二级及以上医疗机构流感应对情况
目的 分析2016—2017年流感流行季北京市二级及以上医疗机构流感应对情况.方法 于2016年11月8日至16日,从北京市16个区中每区选择2家流感样病例门诊量较大的医疗机构作为督导对象,共计32家二级及以上医疗机构,对其疾病控制处(科)负责人进行问卷调查,回收有效问卷31份,调查内容包括医疗机构特征(三级或二级、中医或西医、城区或郊区)以及应对流感的措施等情况. 结果 31家医疗机构中,25家(80.6%)将奥司他韦作为处方药, 21家(67.7%)为重点科室的医务人员提供免费流感疫苗接种服务,27家(87.1%)开展流感快速检测服务,26家(83.9%)为发热门诊等重点科室的患者及家属提供免费口罩,100.0%(31/31)的医疗机构在发热门诊等重点科室储备N95口罩.二级医疗机构为发热门诊等重点科室的患者及家属提供免费口罩的构成比(95.2%,20/21)高于三级医疗机构(60.0%,6/10;x2=6.22, P<0.05),西医医疗机构将奥司他韦作为处方药的构成比(91.3%,21/23)高于中医医疗机构(50.0%, 4/8;x2=6.49,P<0.05). 结论 北京市二级及以上医疗机构流感应对情况总体较好,但在抗病毒药物使用和为医务人员接种流感疫苗等方面仍存在不足.
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人7型腺病毒检测细胞系的构建与鉴定
目的 构建人7型腺病毒(human adenovirus type 7,HAdV7)检测细胞系.方法 将HAdV7中的Hexon基因克隆至带有绿色荧光蛋白基因的慢病毒表达载体pLV-EGFP(2A)-Puro上,获得pLV-EGFP-hexon.将其与包装质粒p-Pax、pMD用脂质体Lip2000共转染293T细胞,获得慢病毒颗粒感染HEp-2细胞,经嘌呤霉素压力筛选和系列的稀释法,获得HAdV7感染的检测细胞系HEp-2/GFP. 结果 细胞系HEp-2/GFP感染HAdV7后24 h,可观察到GFP的表达绿色荧光,而作为对照组的HEp-2/GFP细胞感染双链DNA病毒(如EB病毒和乙型肝炎病毒),并未观察到绿色荧光.此检测细胞系用不同滴度的HAdV7感染,至少可以检测到10 PFU/mL滴度的HAdV7.结论 成功构建了能检测HAdV7的细胞系HEp-2/GFP,且其检测的特异性和敏感性良好,可以作为检测HAdV7感染的诊断方法之一.
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北京市2007—2013年季节性流感和2009年甲型H1N1流感大流行的死亡负担研究
目的 估计北京市2007—2013年季节性流感和2009年甲型H1N1流感大流行有关的死亡负担.方法 以每周死亡监测数据为因变量,流感病毒阳性率为自变量,应用负二项回归模型估计流感相关超额死亡数及超额死亡率.结果 2007—2013年,平均每年2 375人(95% CI:1 002~8 688)死于流感,占所有死亡人数的3.2%(2 375/73 688).80.1%(1 903/2 375)的流感死亡发生在65岁以上老年人中,该年龄组的超额死亡率高于65岁以下人群(113.6/10万比4.4/10万, P<0.05).2009年甲型H1N1流感大流行的超额死亡率接近于非大流行年份的季节性流感(19.9/10万比17.2/10万).65岁以下人群占全人群流感超额死亡的构成比在甲型H1N1流感大流行期间高于非大流行年份[27.0%(966/3 576)比17.5%(373/2 135),P<0.05].结论 流感是导致北京市居民死亡的重要原因,尤其在65岁以上老年人中.本研究结果支持老年人优先接种季节性流感疫苗策略.
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北京市西城区流感样病例与气象因素的相关性研究
目的 探讨北京市西城区气象因素对流感样病例数的影响. 方法 采用广义相加模型(GAM),在控制长期趋势、季节波动及其他混杂因素基础上,分析西城区2012年7月至2017年6月气象因素对流感样病例数的影响. 结果 西城区的流感高峰季出现在冬春季,当低气温处于-10℃以下、平均相对湿度在60%~80%、日照时数为7~10 h、平均风速达到4 m/s以上的天气条件下易出现流感高峰.各气象因素滞后2 d对流感样病例数影响大,低气温每增加1℃,流感样病例数减少0.87%(0.85%~0.89%);平均相对湿度每增加1%,流感样病例数减少0.11% (0.10%~0.13%);日照时数每增加1 h,流感样病例数减少0.03%(0.02%~0.04%);风速每增加1 m/s,流感样病例数增加0.51%(0.22%~0.80%). 结论 低气温、平均相对湿度、日照时数、平均风 速是影响北京市西城区流感样病例数的主要气象因素,可将其作为流感防控和监测预警的指标.
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2014—2016年四川省B型流感病毒全基因组进化特征分析
目的 了解2014—2016年四川省B型流感病毒的流行特点,明确流行株与国际疫苗株的匹配情况及流感病毒全基因组进化特征.方法 选取2014—2016年四川省分离的29株B型流感病毒,全基因组测序后完成序列拼接,采用Bioedit、MEGA5.0软件对各基因片段进行系统发育分析及分子特征分析. 结果 2014—2015年以Yamagata系流感病毒为主,2016年以Victoria系流感病毒为主.全基因组分析表明,29株B型流感毒株中有5株发生了B/Yamagata系血凝素(hemagglutinin,HA)和B/Victoria系神经氨酸酶(neuraminidase,NA)间的重配;B/Yamagata系HA氨基酸序列与国际疫苗株B/Massachusetts/2/2012相比,进化树上group I分支毒株突变较多,所分析的15株病毒株均发生K58R、A118P、N126K、S160I、N176Y等14处氨基酸突变;2016年的11株Victoria系毒株与毒株B/Brisbane/60/2008相比,HA基因主要有2个氨基酸位点发生了共有突变(I127V、N139D).本研究中的29株分离株均未发生NA蛋白酶活性位点及耐药位点的突变.结论 2014—2016年四川省B型流感病毒两系交替流行,29株分离株中的5株出现BY/BV系间神经氨酸酶基因的重配,会导致抗原转变使疫苗失去保护效果,双组分的B型流感疫苗可能更为有效;NA重要的氨基酸位点相对保守.
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一起由柯萨奇病毒A2型引起的疱疹性咽峡炎暴发疫情调查分析
目的 对某幼儿园一起疱疹性咽峡炎暴发疫情的流行病学特征进行分析,为疫情防控提供科学依据.方法 收集病例基本情况、临床表现、流行病学特征等资料,采集病例咽拭子标本进行检测,采用描述流行病学研究方法对疫情的流行病学特征和临床特点进行分析.结果 2017年7月4至11日,北京市石景山区某幼儿园累计报告疱疹性咽峡炎或发热伴口腔疱疹、咽痛症状 病例20例,病例均为同一班级儿童,罹患率为90.9%(20/22).患儿临床表现以发热、咽痛、口腔疱疹为主,高体温38.5~41.0℃.采集6例患儿的咽拭子样本进行检测,检测结果均为柯萨奇病毒A2型阳性.结论 本次疱疹性咽峡炎暴发疫情由柯萨奇病毒A2型引起,该病毒传染性强,易引起托幼机构等集体单位疱疹性咽峡炎暴发流行.
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医院环境中甲型流感病毒气溶胶检测及其HA基因特征分析
目的 了解甲型流感病毒气溶胶在医院环境中的存在情况,分析甲型流感病毒的HA基因变异特征. 方法 选择江苏省淮安市综合性医院(医院A)及儿童专科医院(医院B)各1家,利用BIO Capturer-5仪采集医院门诊输液中心4个位点(入口、出口、中央走廊、输液台附近)的环境气溶胶;医院A和医院B分别采集气溶胶样本16份,共计采集32份;并分别采集到发热门诊就诊的7份病人咽拭子标本,共计14份.以实时荧光RT-PCR及巢式RT-PCR法分别进行流感病毒的快速检测及甲型流感病毒HA基因扩增、测序及构建系统发生树并进行HA基因特征分析. 结果 医院A环境中检测到1份H3N2流感病毒气溶胶,在病人咽拭子中检测到6份H3N2流感病毒和1份甲型H1N1流感病毒;医院B环境中检测到1份甲型H1N1流感病毒性气溶胶,在病人咽拭子中检测到3份H3N2流感病毒和2份甲型H1N1流感病毒.H3N2流感病毒气溶胶样本A/Environment-air/Huai'an/A1/2017与咽拭子样本A/Huai'an/TA1/2017的核苷酸同源性高,为99.8%;甲型H1N1流感病毒气溶胶样本A/Environment-air/Huai'an/B1/2017与咽拭子样本A/Huai'an/TA7/2017的核苷酸同源性高,为100.0%. 结论 医院环境中易存在甲型流感病毒污染,对医院环境中气溶胶进行流感病毒监测有助于了解流感病毒在人群中的流行情况;与甲型H1N1流感病毒相比,H3N2流感病毒分离株的HA基因存在基因多样性.
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甘肃省2010—2016年度流感流行特征分析
目的 分析甘肃省2010—2016年度流感流行特征,为制定防控措施提供科学依据.方法 通过中国流感监测信息系统收集甘肃省2010—2016年度流感病原学监测数据进行分析.采用x2检验比较不同年度、季节、人群及地区间流感病毒核酸检测阳性率及病原型别构成的差异.采用ArcGIS 10.2软件绘制地理分布图.结果 2010—2016年度甘肃省共采集54 795份流感样病例标本,流感病毒核酸阳性率为14.77%(8 091/ 54 795),病原型别以A(H1N1)pdm09型、A(H3N2)型和B型为主,占所有阳性标本的98.89%(8 001/ 8 091).各年度阳性率差异有统计学意义(x2=289.68, P<0.01),其中2015—2016年度高(19.00%,2 529/13 309),流感流行强度呈典型的年度单峰型分布,流行高峰在每年12月至次年1月之间.不同年龄组阳性率及病原型别构成差异有统计学意义(x2值分别为589.06和173.53,P值均小于0.01),其中5~14岁组阳性率高(21.36%, 2 765/12 942),且以B型流感病毒为主(51.02%,1 401/2 746).不同地区阳性率及病原型别差异均有统计学意义(x2值分别为430.82和233.47,P值均小于0.01),其中定西市阳性率高(20.25%, 559/2 761). 结论 甘肃省适宜的流感疫苗预防接种时间应为每年10月份.学校是流感疫情防控的重点场所,提倡加强对5~14岁儿童的流感疫苗预防接种.
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流行性感冒的并发症
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HBx相关DNA甲基化位点研究进展
年 | 期数 |
2019 | 01 |
2018 | 01 02 03 04 05 06 |
2017 | 01 02 03 04 05 06 |
2016 | 01 02 03 04 05 06 |
2015 | 01 02 03 04 05 06 z1 |
2014 | 01 02 03 04 05 06 |
2013 | 01 02 03 04 05 06 |
2012 | 01 02 03 04 05 06 |
2011 | 01 02 03 04 05 06 |
2010 | 01 02 03 04 05 06 |
2009 | 01 02 03 04 05 06 |
2008 | 01 02 03 04 05 06 |
2007 | 01 02 03 04 05 06 |
2006 | 01 02 03 04 05 06 |
2005 | 01 02 03 04 05 06 |
2004 | 01 02 03 04 05 06 |
2003 | 01 02 03 04 05 06 |
2002 | 01 02 03 04 05 06 |
2001 | 01 02 03 04 05 06 |