卡方检验是一种用途很广的计数资料的假设检验方法。它属于非参数检验的范畴，主要是比较两个及两个以上样本率( 构成比)以及两个分类变量的关联性分析。其根本思想就是在于比较理论频数和实际频数的吻合程度或拟合优度问题。

　　今天介绍一下Graphpad如何进行卡方检验。

　　1.打开软件，选择左侧栏 New Table & Graph 中的 Contingency 选项，并以sample data为例来介绍。

　　卡方检验和精确检验的区别就在于前者的频数大于5，后者的频数小于5。

　　2.生成数据表样本，这是NEJM杂志的一篇研究论文中的数据，分别用阿司匹林和安慰剂给予实验对象，并统计了其中发生心肌梗死的频数。

　　3.数据有了之后点击analyze或者Results下的New Analysis进入数据分析环节，按下图进行选择，并勾选右侧的所有项目，点击OK：

　　4.进一步设定卡方检验的各个参数：依次选择Odds ratio和Chi-squere test，在Options中选择two-sided。

　　5.点击OK，生成统计分析结果：χ2= 25.01，P<0.0001。

　　6.根据提示，换用Fisher test再分析一次：

　　P < 0.05，OR值和95%CI大于1，表示aspirin对MI是危险因素(也就是aspirin对MI有效);若相反，则无效。

　　6.统计分析结束后，到了后的作图阶段，点击Graphs。